Lijst van nummer 1-albums in de Album Top 100 in 1999

Onderstaande albums stonden in 1999 op nummer 1 in de Album Top 100, de voorloper van de huidige Media Markt Album Top 40. De lijst werd samengesteld door de Stichting Nederlandse Top 40. Vanaf 10 juli 1999 stopte de Album Top 100 van de Stichting Nederlandse Top 40 bij het samengaan van deze stichting met de Stichting Mega Top 100. De overgebleven lijst was die van Megacharts B.V.. Sinds 9 april 2011 wordt er door de Stichting Nederlandse Top 40 weer een albumlijst samengesteld. Deze lijst bevat zowel nieuwe en oudere albums als compilatie-albums. De lijst is vernoemd van de sponsor: de Media Markt Album Top 40.

Nummer	Datum	Artiest	Titel
	2 januari	geen Album Top 100 verschenen
316	9 januari	U2	The Best of 1980-1990
317	16 januari	George Michael	Ladies & gentlemen: The best of George Michael
316	23 januari	U2	The best of 1980 - 1990
	30 januari	U2	The best of 1980 - 1990
318	6 februari	Ilse DeLange	World of hurt
	13 februari	Ilse DeLange	World of hurt
319	20 februari	2Pac	Greatest hits
320	27 februari	Bee Gees	One night only
319	6 maart	2Pac	Greatest hits
	13 maart	2Pac	Greatest hits
318	20 maart	Ilse DeLange	World of hurt
	27 maart	Ilse DeLange	World of hurt
321	3 april	Andrea Bocelli	Sogno
	10 april	Andrea Bocelli	Sogno
	17 april	Andrea Bocelli	Sogno
322	24 april	Vengaboys	Greatest hits! Part 1
	1 mei	Vengaboys	Greatest hits! Part 1
	8 mei	Vengaboys	Greatest hits! Part 1
323	15 mei	ABBA	De grootste hits in Nederland - 25 jaar na 'Waterloo'
321	22 mei	Andrea Bocelli	Sogno
324	29 mei	Backstreet Boys	Millennium
	5 juni	Backstreet Boys	Millennium
325	12 juni	Frans Bauer & Corry Konings	Frans Bauer & Corry Konings
326	19 juni	Toy Box	Fantastic
	26 juni	Toy Box	Fantastic
323	3 juli	ABBA	De grootste hits in Nederland - 25 jaar na 'Waterloo'