Wie RoyPJ sagt muss es
Was bedeutet Wetter?
heißen, allerdings ohne Anführungsstriche die für wörtliche Rede verwendet werden oder Zitate, allenfalls noch in zweideutigen Situationen, wenn keine anderen Auszeichnungen wie Kursivschreibung zur Verfügung stehen. Hier besteht aber keine Schwierigkeit den Sinn des Satzes zu erfassen.
Es gibt aber auch Konstruktionen mit Bedeuten am Ende, und zwar wie aus dem bekannten Lied Loreley bekannt, Ich weiß nicht, was soll es bedeuten, also übertragen auf das Wort Wetter:
Was soll Wetter bedeuten?