USTHB/FSB compte rendu Biostatistiques L3 BIOCH 17/10/2020

Correction

Exercice 1.(7pts) Dans le cadre d’une enquête sur la qualité de la viande de moutons de la wilaya
de Chlef après l`abattage, le pH de carcasse de moutons a été analysé dans des élevages suspectes
de ne pas respecter les normes de stockage en vigueur dans notre pays. Pour répondre à la question
suivante : Les élevages suspects respectent ils les normes nationales ?
Un ingénieur en contrôle de qualité a réalisé l’enquête et les résultats figurent dans le tableau
1.
Tableau 1
Contrôle Suspect 1 Suspect 2 Suspect 3
5.48 6.37 4.56 6.94
5.64 5.04 4.42 5.88
5.34 5.49 4.25 6.36
5.42 6.28 4.37 5.35
5.91 5.31 3.98 6.48

1
Sachant que les variances sont homogènes l’ingénieur réalise un test statistique et obtient les
résultats suivants :

SCE ddl CM p
Effe 9,622 0,0000
t 3 52
Erre
ur
Tota 12,90
l 97

1) Donnez l’objectif de l’analyse.

Vérifier l’effet du stockage sur le pH, en comparant 4 moyennes par une anova. 1

2) Citez le facteur.

Type de stockage 1

3) Complétez le tableau et interprétez les résultats en respectant les étapes du test.

H0 :µT= µ2= µ3= µ4

Le type de stockage n’a pas un effet significatif sur le pH. 1

Tab.Anova 2

SCE ddl CM p
Effe 9,622 3 3.20 0,0000

2
 t 3 7 52
Erre 3.287
16 0.21
ur 4
Tota 12,90
l 97 19

Conclusion : p<<<0.05

H0 :rejetée le type de stockage a un effet très hautement significatif sur le pH.

Au moins une des moyennes est responsable du rejet H0. 1.5pt

Probabilité post-hoc. (* : différence non significative).

T S1 S2 S3
T
S
*
1
S 0,002 0,001
2 725 111
S 0,000
* *
3 208

4) Conclusion

Selon les comparaisons post-hoc µS2≠ µT

Donc le suspect 2 ne respecte pas les normes de stockage. 0.5

3
Exercice 2.(7pts) Le but de cette expérience est d’étudier la relation qui pourrait exister entre
: la pression systolique (mm Hg) et le taux de cholestérol (mg/100ml). Ces deux paramètres ont été
mesuré sur 3142 patients. Les résultats obtenus figurent dans le tableau suivant :

Variance -covariance Moyennes

Cholestérol Pression Pression Cholestérol
Cholestérol 1885 80.41 128.63 226,37
Pression 80.41 228.55

1/ Etablir l’équation du modèle :

Pression = a*cholestérol + b 0.5

a= cov(cholesterol ;pression)/var(cholestérol) = 80.41/1885 = 0.043 1pt
b = moy(Pression) – a*moy(Cholestérol) = 128.63 – 0.043*226.37 = 118.89 0.5pt

Pression = 0.043*Cholestérol + 118.89 0.5pt

2) Etudiez la qualité de la régression :

4
R2 = SCEreg/SCEtot * 100 0.5

H0: Beta = 0 0.5pt

La Pression est linéairement indépendante du cholestérol.

Tableau Anova 2pts

SCE ddl CM F p
regression SCEreg 1 SCEreg/1 CMreg/CMres
Erreur SCEres 3140 SCEres/3140
Total SCEtot 3141

Si p<0.05 H0 : rejetée la Pression est linéairement dépendante du cholestérol. 0.5 pt

Si p>0.05 H 0 :retenue Pression est linéairement indépendante du cholestérol. 0.5 pt

3)Déduire la relation entre la pente et le coefficient de corrélation (justifiez votre réponse).

a= cov(ch ;P)/var(P)

r = cov(ch;P)/Sch*SP

Cov(ch;P)= r* Sch*SP

a = r* Sch*SP /var(P) = r* Sch/Sp

5
 a = r* Sch/Sp

0.5 pts

Exercice 3 (6pts)

Dans une étude sur le cancer de la prostate 5 variables ont été observées sur 53 patients et sur
lesquels une intervention chirurgicale a été réalisée afin de s’assurer de l’implication ou non du
système lymphatique. Les variables considérées sont les suivantes :

— age : âge du patient ,

— acid niveau de "serum acid phosphatase",

— radio résultat ”une analyse radiographique (0 : négatif, 1 : positif),

— taille de la tumeur (0 : petite, 1 : grande),

— gravite résultat de la biopsie (0 : moins sérieux, 1 : sérieux).

— lymph implication (1) ou non (0) du système lymphatique.

Remarque : la variable lymph est une variable qualitative, elle a été utilisée pour marquer les
individus sur le graphique des individus. Donc elle n’a pas été introduite dans la matrice de
corrélation.

6
 Tableau 1 2

Valeurs
propres % variance
1,53 30.54
1,15 22.95
0,97 19.36
0,74 14.77
0,62 12.38
5,01

7
Question1 : complétez le tableau 1. Selon vous combien d’axe doit-on choisir ? en une ligne
commentez le graphique ci-dessus.

On choisit 2 axes dont le pourcentage de variance est supérieure à 20 %(Plan 1*2). 0.5

Le graphique des valeurs propres montre une diminution modérée de l’inertie du premier axe au
dernier axe. 0.5

Tableau 2 : résultats relatifs aux variables

Contribution
s Qualités
Dim.1 Dim.2 Dim.1 Dim.2
age 0.00 20.48 0.00 0.24
acid 0.00 58.28 0.00 0.67
radio 22.41 16.03 0.34 0.18
taille 38.65 0.99 0.59 0.01
gravite 38.94 4.22 0.59 0.0

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Question 2 :

1) Comment reconnaît-on sur la figure des variables qu’une variable est bien représentée ?

Selon la longueur du vecteur et l’angle aigu que fait cette variable avec l’axe. 0.5

2) Interprétez les graphiques ci-dessous en vous aidant des résultats du tableau 2. 2.5

L’axe 1 apporte 30.54% du total de l’information du tableau des données brutes, il sélectionne du
côté positif les variables gravitées et taille. La gravité est corrélée à la taille de la tumeur.
Ces deux variables ont contribué à construire l’axe 1 avec plus de 38% de l’inertie totale.

les individus associés à ces deux variables sont :

34,43,46,44,42,53.

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Ce groupe d’individus s’oppose aux groupes d’individus 20,22,16,19,6 sélectionnés du côté négatif
de l’axe1 et dont le système lymphatique n’a pas été impliqué.

L’axe 2 qui apporte une variance de 23% de l’inertie totale est construit principalement par les
variables acide (58% de contribution et une qualité de 0.67 et la variable age du patient.

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11
12