Le SpermaScore 10 Kruger

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SPERMASCORE K

Mode d’emploi

Compteur et logiciel protégés par copyright.


Jean-Pierre Duval
28/03/2020

1
Table des matières
SPERMASCORE K ............................................................................................................................................................... 1
Introduction .................................................................................................................................................................. 3
Caractéristiques ............................................................................................................................................................ 3
La carte SD................................................................................................................................................................. 3
Ecran d’accueil .............................................................................................................................................................. 4
CONFIGURATION A LA PREMIERE UTILISATION............................................................................................................ 4
Réglages de la date et de l’heure. ............................................................................................................................. 4
UTILISATION DU COMPTEUR ........................................................................................................................................ 6
Identification ............................................................................................................................................................. 6
Ecran de Comptage ................................................................................................................................................... 7
Les pourcentages et le calcul de dominantes ........................................................................................................... 8
Ecran de synthèse ..................................................................................................................................................... 9
Transfert du jour ..................................................................................................................................................... 10
LE TABLEAU EXCEL DU SPERMASCORE ....................................................................................................................... 11
Aide ......................................................................................................................................................................... 12
Utilisation du classeur pour la relecture et l’enregistrement des noms des touches et des abréviations. ........... 12
Les informations données par le tableau................................................................................................................ 13
Format de transfert et d’enregistrement ................................................................................................................... 14
ANNEXES ..................................................................................................................................................................... 15
Yes another terminal............................................................................................................................................... 15
Pile de sauvegarde .................................................................................................................................................. 15
Remerciements ........................................................................................................................................................... 15
Références .................................................................................................................................................................. 16

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Introduction
Les directives OMS de 2010 préconisent d’établir le spermocytogramme selon la grille de Kruger & coll.
SpermaScore est un outil conçu pour réaliser cet examen.

Comme tous nos compteurs, il ne propose aucun diagnostic.

En France, il reste beaucoup d’utilisateurs de la grille de David et Coll. Nous commercialisons toujours cette ancienne
version. Nous consulter.

Caractéristiques
• Un écran tactile de grande dimension facilite l’enregistrement des renseignements nécessaires au comptage,
la lecture des résultats en cours de frappe, et le contrôle du résultat en fin de comptage.
• Un connecteur USB permet de transmettre les données à un logiciel de laboratoire. Le formatage est
expliqué plus loin.
• Une horloge permet de dater les comptages.
• Une carte SD permet de configurer le compteur mais aussi de stoker les résultats.
• Les résultats stockés sur la carte SD peuvent ensuite être relus sur un PC sous windows10 en utilisant le
classeur Excel® fournit avec le compteur ou transmis à un logiciel de laboratoire.
• Le formatage du transfert des données peut être modifié pour s’adapter au laboratoire (nous consulter)

La carte SD
Elle est indispensable pour utiliser le compteur car elle contient :
• Le nom et les abréviations de touches.
• Des documents d’aide
• Un classeur Excel®
• N’importe quelle carte SD peut être utilisée mais nous vous conseillons d’utiliser celles que nous vous
fournissons, elles sont préchargées avec le fichier de reconnaissance de méthode : logo.txt et les dossiers
« touches » et « label » indispensable au fonctionnement. Ces fichiers et dossiers permettent aussi à Excel®
de reconnaître le chemin d’accès à la clé.
• Attention de ne pas placer deux cartes possédant ce fichier « logo.txt » simultanément dans le PC, Excel
ouvrirait seulement la carte placée dans le lecteur le plus haut. d\ : ou e\ : etc…
• Nous vous conseillons de faire une sauvegarde de la carte SD fournie avec le compteur avant toute
utilisation ou d’utiliser une copie.
• Ne laissez pas la carte SD se remplir de dossiers journaliers, cela ralentit considérablement le compteur et le
tableau Excel. Faites des sauvegardes.

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Ecran d’accueil

La date et l’heure sont affichée en haut de l’écran, ces informations sont nécessaires pour l’enregistrement des
résultats. On les réglera en touchant l’icône en bas à droite.
L‘icône en bas à gauche sert au transfert des fichiers de la journée vers un ordinateur.

CONFIGURATION A LA PREMIERE UTILISATION


Réglages de la date et de l’heure.

Les valeurs enregistrées s’affichent, en cas de réglage les cases concernées changent de couleur.
Cliquer sur les flèches hautes ou bases pour régler, confirmer avec ENTER

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Le compteur utilise la configuration de touches proposée par le Docteur Pons. La configuration est visible sur le
fichier Excel. Elle est enregistrée dans la carte SD.

Cette configuration peut être modifiée par l’utilisateur, sauf les touches 6 « ENTER » et 18 « TYPIQUES » qui sont
figées.
Il faut respecter quelques principes :
1. Le nom des touches doit tenir dans la case.
2. L’abréviation doit être de 8 signes, lettres espace ou nombre.
3. La classe doit être en majuscule :
A=Tète
B=Pièce intermédiaire
C=Pièce principale (Flagelle)
D=Reste cytoplasmique
4. Si une touche est laissée vide l’abréviation doit être de 8 X majuscule : « XXXXXXXX » et la classe « Z »
5. Si possible ne pas utiliser d’apostrophe, ce caractère est mal interprété par l’écran.

N=Typiques
Z= non comptés
X= enter
ces 3 dernières ne sont pas normalisées elles servent au logiciel du compteur associé.

Avec le classeur Excel on peut transférer les données de noms de touches, des abréviations et des classes dans la
carte SD pour reconfigurer le classeur. Si des fichiers de résultats ont été enregistrés sur la carte SD avec une
configuration précédente, ils ne seront plus utilisables avec la nouvelle configuration et doivent être éliminés. En
effet ils seront lus mais les associations résultats/cases ne seront plus valables.

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UTILISATION DU COMPTEUR
Identification

1. Le champ rempli ici « DUPONT » est le champ « Opérateur » il n’est pas nécessaire de le remplir à chaque
fois, il reste en mémoire même compteur éteint. Il suffit de taper dessus pour le modifier.
2. Le champ Identifiant est obligatoire, les autres sont facultatifs.
3. Opérateur, Médecin, Nom, Prénom sont limités à 20 caractères, Identifiant à 9.
4. La date de naissance doit être rentrée sous la forme jj/mm/aaaa
5. Suppr permet de corriger un champ.
6. Blanc (entre menu et Etape suivante) permet de rentrer un espace.
7. Menu permet de sortir de l’identification et de revenir à l’écran de démarrage sans sauvegarde.
8. Les champs validés sont colorés.
9. On peut revenir sur les différents champs tant qu’on n’est pas passé à Etape suivante

Ecran d’identification avec une erreur sur la date de naissance : doigt sur Suppr

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Ecran de Comptage

Une fois les champs d’identification remplis, on arrive sur l’écran de comptage.

Les cases des sous-compteurs ne sont pas tactiles, on utilise le clavier mécanique qui présente une sensation
optimale au toucher. Les touches sont rangées comme les sous-compteurs : La ligne 1 est en bas la ligne 4 en haut.

Sur cet écran on remarque :


L’identifiant (ID1), le nom et le prénom apparaissent s’ils ont été indiqués.
Les 5 cases supérieures à droite sont réservés aux éléments non-comptés dans le total (leucocyte, flagelle isolé…)
Les étiquettes des cases prennent la couleur des classes d’anomalies.

Le comptage se fait sur les éléments des 3 lignes 1, 2 et 3 et de la case 19 de la ligne 4 en haut à gauche).
1. Spermatozoïde typique, dans ce cas on tape sur la touche « typiques », la touche « ENTER » ne sera pas
utilisée. La case « typiques » indique le nombre de spermatozoïdes typiques comptées, le total et le
compteur-résumé « typiques » s’incrémentent.
2. Spermatozoïde atypique, on peut compter 6 anomalies par spermatozoïde, On valide avec la touche ENTER
cela incrémente les compteurs individuels, le total et le compteur-résumé « atypiques »
- Les cases correspondantes aux anomalies touchées sont grisées sur l’écran, tant qu’elles ne sont pas
validées avec ENTER, on peut modifier en retapant sur la touche, elle redevient blanche.
- Quand on appuie sur ENTER les cases grisées et le totalisateur d’atypiques s’incrémentent. Et les cases
correspondantes retrouvent leur fond blanc.
3. Les cinq cases à droite de la ligne des touches supérieures permettent de compter des éléments hors
comptage de spermatozoïdes : les leucocytes, les flagelles isolés ...

Si on tape une ou plusieurs anomalies et un élément non compté ou une forme typique, une erreur se produit, elle
est signalée par un bip ; dans ce cas soit on supprime les cases grisées, soit on tape ENTER. Les anomalies grisées son
alors comptées mais pas les éléments non-comptés ou la forme typique.
La touche tactile « corrige » permet de corriger la dernière entrée ou groupe d’entrées dans le cas d’anomalies
multiples.
En fin de comptage, un bip se fait entendre, il est toujours possible de corriger la dernière entrée ou d’augmenter le
total d’éléments à compter jusqu’à 1000 par ajout de 50 avec la touche tactile « total+50 »
Le TZI1 est recalculé à chaque entrée, il est corrigé en cas de correction.

1 TZI=teratozoospermia index ou Index de tératozoospermie voir le calcul u TZI en annexe.


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Les pourcentages et le calcul de dominantes

Ces images d’écran montrent l’action de la touche pourcentage et retour comptage. La touche 5 affiche un
compteur de 100
Cette touche affiche un fond rouge, elle dépasse 30%, c’est l’indication de dominance.
Il peut y avoir plusieurs anomalies dominantes.

Le calcul de pourcentage indique aussi les pourcentages de chaque classe d’anomalie. (Ligne supérieure de la
seconde image) et les pourcentages des formes typiques et atypiques.

Le calcul des pourcentages se fait de la manière suivante

Anomalie X100
 anomalies

On retrouve l’ensemble des données sur l’écran de synthèse en tapant sur menu

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Ecran de synthèse

Cet écran comporte trois touches tactiles :


• Menu pour retourner à la page d’accueil
• Enregistre pour enregistrer le fichier sur la carte SD
• Transfert pour transférer immédiatement les données de comptage et d’identification à un logiciel de
laboratoire via la connexion USB du compteur.
il est possible de transférer les comptages enregistrés sur la carte SD en fin de session : Voir la touche en bas à
gauche de la page d’accueil mais il faut que les fichiers soient enregistrés sur la carte SD.

Si la touche Transfert est utilisée sans câble USB branché, les données non enregistrées seront perdues.
Il est donc conseillé d’enregistrer puis le cas échant de transférer les données.

On ne peut pas enregistrer plusieurs fois le même examen. Mais on peut le transférer plusieurs fois.

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Transfert du jour
Si on ne dispose pas d’une liaison USB à côté du compteur, et si les fichiers de résultats de la journée ont été
enregistrés sur la carte SD, il est possible de les relire et de les transférer vers le logiciel du laboratoire DANS LA
JOURNEE de la lecture.
Astuce : pour ressortir les résultats d’une journée antérieure, il suffit de changer la date du jour et d’éteindre le
compteur pour réinitialiser celui-ci et de le rallumer.
On retrouve les comptages du jour.

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LE TABLEAU EXCEL DU SPERMASCORE
Il a deux fonctions
• La configuration des intitulés des touches et de leurs abréviations qui seront enregistrés sur la carte SD
Ce classeur est fourni avec la carte SD. Si vous changer le nom des touches les résultats antérieurs ne
correspondront plus. Autrement dit un tableau correspond à une configuration qui correspond à une carte
SD.
Si vous ne possédez pas Excel® nous pouvons vous remplir le tableau et vous fournir une carte SD
programmée à votre convenance.

• La relecture des résultats quand ils sont enregistrés sur la carte SD

Attention : le tableau Excel® utilise un programme qui est considéré comme une macro. Pour l’utiliser, Il faut
autoriser les macros, vous ne risquez rien, votre ordinateur ne va pas exploser ! Malgré les mises en garde d’Excel®.
Les macros utilisées sont des programmes écrit en VBA (Visual-Basic-Application) de Microsoft pour Excel sous
W10®. Elles ont été écrites avec office Excel 2019®, testées avec succès avec les versions 2016 et 2010
☺ Un fichier PDF fourni avec la carte SD explique comment autoriser les macros.

Ces macros sont « open source » mais protégées par un mot de passe pour éviter des modifications accidentelles en
cours d’utilisation. Votre service informatique peut les lire, cela confirmera la sécurité et l’absence de virus ou de
malware.
Ces macros ne sont pas compatibles avec d’autres tableurs comme Libre-office ou Open-office. La compatibilité n’a
pas été testée sur les ordinateurs Apple® Android® ou Linux®.
Le classeur Excel® est un exemple donné gracieusement avec le compteur, il ne peut être soumis à garantie en cas
de modification, d’effacement ou de bug. Dans ce dernier cas veuillez avoir l’obligeance de nous le ou les signaler.

Le mode de passe est donné en annexe.

Attention : Sauvegardez régulièrement la carte SD,


Copiez les fichiers et dossiers contenus dans la carte SD avant la première utilisation. Utilisez une copie pour repartir
sur une carte vierge ou effacée.
Le fichier Excel lit TOUTE la carte à chaque recherche de carte. Pour ne pas saturé la mémoire évitez de dépasser 30
jours par carte.

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Aide
Le tableau possède des signets d’aide sur certaines cases marquées d’un petit triangle rouge en haut à droite des
cases. L’utilisation du tableau est expliquée sur celui-ci.

Utilisation du classeur pour la relecture et l’enregistrement des noms des touches et


des abréviations.

Si on clique sur « rechercher la carte SD et les répertoires, l’ordinateur recherche une carte SD ayant le logo
correspondant au compteur SpermaScore. Le chemin s’affiche dans la fenêtre et les différents dossiers contenu
dans la carte SD s’affiche sous la forme de la date abrégée on clique sur une date 01-07-20 par exemple.
Dans la seconde fenêtre les identifiants des résultats de cette journée s’affichent.

Le bouton enregistrement des informations permet de remplacer les intitulés des touches et des abréviations
contenus dans les dossiers « label » et touches » de la carte SD par celle figurant dans le classeur.

Le bouton effacer les listes permet d’effacer les cases de répertoire et les fichiers et de réinitialiser le classeur sans
effacer le contenu de la carte SD

On clique sur un identifiant et la fenêtre des résultats apparait :

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Pour revenir à la feuille des fichiers cliquez sur Clavier en bas à gauche.

Nous vous conseillons d’en faire une sauvegarde avant toutes modifications.
En fin d’utilisation du tableau ne pas l’enregistrer à l’invite d’Excel comme cela il reste en état d’origine.

Les informations données par le tableau

Le calcul de l’index de tératozoospermie (TZI) est calculé comme suit :


Tzi=∑ (des anomalies par catégorie)/Total des cellules présentant au moins une anomalie)
Sachant qu’un spermatozoïde peut présenter de 1 à 6 anomalies.

Les anomalies sont classées en 4 classes :


- Anomalies de la tête A ou (H pour Head defects)
- Anomalies de la pièce intermédiaire B ou (M pour Neck et Midpiece defects)
- Anomalies de la pièce principale (flagelle) C ou (P pour Principal piece defects)
- Présence de Reste cytoplasmique D ou (C pour Excess residual Cytoplasm)

Les valeurs dominantes (>= 30%) sont affichées sur fond rouge dans les pourcentages

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Format de transfert et d’enregistrement

Les enregistrements et le transfert utilisent le même formatage de données :

Le codage des fichiers est extrêmement simple, chaque champ est séparé du suivant par « ; » c’est le caractère Ascii
59 en décimal.

Lors du premier enregistrement du jour, le compteur crée un dossier jj-mm-aa


Dans lequel on retrouve :
• Un fichier « nbexam.txt » qui indique le nombre de dossiers du jour.
• Autant de fichier que de patient nommé « n.txt » ou n va de 1 à 255. A un autre jour correspond un autre
répertoire, un autre fichier « nbexam.txt » et autant de fichier « n.txt ».
Ces fichiers « n.txt » étant constitué de :

A. L’identifiant
B. Le total des cellules comptées
C. La sommes des atypiques
D. Le total des cellules à compter , 100-150-200….
E. Les anomalies telles qu’elles sont rangées dans le compteur, de 1 à 5 (la ligne 1 du bas) puis
les lignes 2 et 3 de 6 à 17 et enfin la première touche de la ligne 4.
F. Les éléments non-comptées de 1 à 5
G. Les typiques
H. Le TZI
I. Le pourcentage de typiques
J. Le pourcentage d’ atypiques
K. Le pourcentage d’anomalies de classe A
L. Le pourcentage d’anomalies de classe B
M. Le pourcentage d’anomalies de classe C
N. Le pourcentage d’anomalies de classe D
O. Le nom du patient
P. Le prénom du patient
Q. La date de naissance
R. Le nom du médecin
S. Le nom ou matricule de l’opérateur

Le driver USB de la connexion est reconnu par Windows 10 sinon il est à l’adresse :
https://www.silabs.com/products/development-tools/software/usb-to-uart-bridge-vcp-drivers

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ANNEXES

Yes another terminal


Pour récupérer les données sans posséder Excel, on peut utiliser ce petit programme freeware
Vous le trouverez sous ce lien : https://sourceforge.net/projects/y-a-terminal/
C’est un terminal de réception des données séries très utile.
il permet, par exemple, de récupérer les données sous la forme de fichiers TXT, DAT…

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Pile de sauvegarde
Ce compteur est équipé d’une horloge interne sauvegardée par une pile lithium type CR2020 la durée de vie est
d’environ 5 ans.
La date et l’heure sont affichées sur l’écran d’accueil. Si vous devez fréquemment remettre à l’heure le compteur,
c’est que la pile est en fin de vie. Il faut la changer. Ce n’est pas très difficile, il faut seulement un peu de soin et
respecter les polarités : vous devez voir le + de la pile.

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Remerciements
Nous tenons à remercier le Docteur J.M. Plouchart pour son assistance et ses remarques avisées.
Le Professeur Jouannet avec qui nous avons mis au point le premier compteur selon David.

Le comptage selon Kruger et coll. est bien décrit sur le site :


http://www.fivfrance.com/page_spermocytogramme.html

Cette nouvelle version est basée sur les précieuses indications du Docteur Hanae Pons-Rejraji,
PhD, MCU-PH du laboratoire AMP-CECOS CHU Estaing Clermont-Ferrand
UMR INSERM 1240 Université Clermont Auvergne
Equipe 2 « Imagerie Moléculaire et Stratégie Théranostique »

Nous nous sommes inspirés de ses remarques pour concevoir notre compteur et rédiger cette notice.
Nous lui sommes très reconnaissant.

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Références
Kruger et coll. 1986
Menkveld et coll. 199_
Coetzee et coll. 1998

Le document de l’OMS : Examination and processing of human semen. Edition 2_1_


Analyse Page 67 et suivantes
TZI Page 115 et suivantes

Mot de passe du fichier .xlsm


sper

Mise à jour
V10.5

Spermascore V10 16 JP Duval 21.10.2020

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