Microbiologa

Alonso Torres Escuela de Nutricin y

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Qu es un microorganismo?
Haga clic para modificar el estilo de subttulo del patrn

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Microorganismo es todo ser vivo que no puede ser visto a simple vista, por lo que necesitamos de un microscopio para observarlos.

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DOMINIOS BACTERIA ARCHAEA EUKARYA

lulas

procariotas procariotas no no

eucariotas SI

cleo con nvoltura

Organelas Haga clicno modificar el no de subttuloSI para estilo del

patrn

ibosomas

70S

70S

80S

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Los dominios bacteria y archaea son BACTERIAS PROCARIONTES, las archaeas son las mas prehistricas, termoresistetes (viven sobre los 100C) ya que fueron las primeras formas de vida, y en ese entonces las condiciones climticas eran otras. Por su parte las del dominio bacteria, son mas desarrolladas
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Taxonoma bacteriana
CLASIFICACION: DOMINIO (RNA 16S) REINO (fenotpico) DIVISION Gracillicutes, firmicutes, tenericutes, mendocicutes CLASE clic para modificar el estilo de subttulo del Haga ORDEN patrn FAMILIA GENERO ESPECIE CEPA
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Gracillicutes: gram+ Firmicutes: gramTenericutes: sin pared celular (del dominio bacteria) Mendocicutes : son peptidoglicano ( del dominio archaeas)

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nomenclatura
Para referirnos a una especie usamos el sistema binominal de Linneo Escherichia sp (especie) Escherichia spp (genero) Escherichia coli O157 : H7 (cepa) Escherichia coli sp (E.coli) Haga clic para modificar el estilo de subttulo del patrn

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Clula procarionte

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La clula procarionte es de mucho menor tamao que una eucarionte, no presenta organelos membranosos (mitocondrias, retculos endoplasmaticos, ap. de golgi), solo presenta ribosomas, de 70 S (constante de sedimentacin) con los cuales sintetizara sus protenas. El material gentico no esta en un ncleo definido, esta disperso en el citoplasma, podemos distinguir el DNA cromosomal, que en si no es un cromosoma propiamente tal, pero contiene el material gentico vital de la bacteria. Tambin hay DNA extracromosomal, como el plasmidio, que son pequeos segmentos de DNA circular y los Haga o para modificar el estilo genes saltarines, estos transposones clictambin llamados de subttulo del patrn son pequeas cadenas de cidos nucleicos, que presentan una secuencia de insercin (SI) con la cual se pueden unir al DNA cromosomal. Estos plasmodios y transposones no contienen informacin vital de la bacteria (me refiero a vital, a la informacin que determina caractersticas anatmicas, fisiolgicas, protenas especificas, enzimas, 7/5/12 caractersticas basales y fundamentales de la bacteria) si

AGRUPACIONES BACTERIANAS

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Staphylo : racimo Strepto: cadena

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Bacilo solo Letra china (bacilos de forma irregular) Bacilo en cadena (strepto) Curvo NUNCA FORMAN RACIMOS No existe el staphylobacilo*

bacilos

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La biparticin o fisin binaria es la manera por la cual la bacteria se reproduce, se multiplica, esto quiere decir que de una bacteria, obtendr 2, y estas sern idnticas entre si. Primero la bacteria duplica su material gentico, luego los cada cadena de DNA (idnticas entre si) se anclan a un mesosoma respectivamente (el mesosoma es una Haga clic para modificar el estilo de subttulo del prolongacin de la membrana patrn interna, la cual se adhiere al DNA para mantenerlo anclado). Luego los mesosomas, cada uno anclado a una cadena de DNA, migran hacia los polos, separando ambas cadenas de DNA. Luego se forma el SEPTO que es una pared 7/5/12

Posterior a esto, la clula se divide en el sector del septo generando 2 clulas exactamente iguales, genticamente.

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Conjugacin bacteriana
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La conjugacin es un mecanismo por el cual se puede traspasar material gentico de una bacteria a otra a travs del Pili sexual, el cual es una prolongacin de la bacteria por la cual puede transportar sustancias. La bacteria que tiene el Pili sexual y que dona material gentico se llama F+, mientras que la que recibe se llama FLuego de que F- haya recibido el material gentico, habr obtenidoestilo de subttulo del Haga clic para modificar el genes para tener su patrn propio Pili sexual, por lo tanto ahora ser F+

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Bacterias gram +

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Bacterias gram -

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Tincin de gram. Es un mtodo que busca diferenciar a las bacterias segn su pared celular (las que tengan) Siempre se tie lo MAS EXTERNO de la bacteria. Paso 1) hacer el frotis y agregar cristal violeta. Luego que hago el frotis, tio todas las bacterias con cristal violeta, en las gram+ se tie el pptidoglican y en las gram- la membrana externa (lo mas externo de ambas) Paso 2) LUGOL El lugol contiene yodo, esto hace que el cristal violeta se fije al pptidoglican de manera 7/5/12 permanente, por lo que la gram+ queda teida

Por su parte la gram- no le har ningn efecto el lugol ya que no tiene su pptidoglican al descubierto (est bajo la membrana externa) Paso 3) decoloracin con alcohol cetona. Es el paso mas importante de la tincin de gram, el alcohol disuelve los lpidos, por que la membrana FOSFOLIPIDICA externa de las gram(que estaba teida con cristal violeta) se destruir y dejar al descubierto el pptidoglican que no esta teido. Por su parte, a la gram+ no le ocurrir nada, ya que se le agreg lugol, lo que fijo el colorante a su pptidoglican Paso 4) teir con safranina. 7/5/12

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Bacterias con pared atpica

Bacterias sin pared celular : (no se tien con GRAM) Ureaplasma spp Mycoplasma spp

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Fuerza protn motriz FPM

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FPM

La bacteria que hace respiracin OxIdativa, oxidar sus nutrientes en el citoplasma, generara protones de hidrogeno, los cuales enviara al espacio periplasmico generando una gran concentracin de protones, estos pasaran nuevamente por diferencia de gradiente al citoplasma por la enzima atpsintasa la cual sintetizara ATP
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La concentracin de protones en el espacio periplasmico ser el motor del flagelo (fuerza protn motriz) por lo que el flagelo no necesita ATP (adenosin trifosfato) para funcionar.

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Flagelo: movilidad Fimbria: adherencia a superficies.

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Esporulacin
Algunas bacterias pueden entrar a un estado denominado dormancia, estas bacterias son las Clostridium spp y Bacillus spp La bacteria es aquella que se nutre, tiene un metabolismo y vive, si no se encuentra en optimas condiciones puede esporular, formando la espora que contiene solo el material gentico cromosomal, cuando esta espora vuelve a encontrar condiciones optimas, germina a su manera vegetativa, o sea, a bacteria

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Ciclo vital de las bacterias.

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Fuentes Agua En este momento los Energa microorganismos no Micronutrientes* presentan una multiplicacin Condiciones ptimas* significativa, ya que se estn adaptando al medio, estn asimilando los nuevos Haga clic para nutrientes, sintetizando modificar el estilo de subttulo del patrn nuevas protenas funcionales y estructurales para su membrana, nuevas enzimas, como tambin estn desarrollndose, creciendo y preparndose para la multiplicacin. 7/5/12

Adaptacin del microorganismo al medio (FASE LAG)

Fuentes

Carbono, nitrgeno, azufre, fosforo e iones.

El carbono es importante ya que este el microorganismo obtendr fuentes para la sntesis de compuestos orgnicos estructurales o funcionales. Segn la fuente de carbono clasificamos: Autotrficas: realizan fotosntesis o quimiosntesis, siendo la
fuente de energa la luz o algn compuesto qumico. Como fuente de carbono usan CO2 para la sntesis de sus compuestos carbonados

Heterotrficas: usan compuestos orgnicos como fuente de 7/5/12 carbono y energa. Aqu estn bacterias con el hombre

Micronutrientes

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AGUA

La cantidad de agua es relevante para mantener la forma funcional de las protenas.

Esta agua se mide con la actividad de agua (AW) que es un factor que va de 0 a 1, mientras mas cercano a 1, mas agua existe.

Bacterias xerfilas resisten ambientes muy secos, como los que son altos en azcar.

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Condiciones optimas

PH t Concentraciones u osmolaridad Oxigeno Otras bacterias (competencia)

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PH

PH, la concentracin de protones de hidrgeno ser se suma importancia para la estructura funcional de las protenas Acidfilas (lactobacillus) bajo PH 5.5 Neutrfilas (Escherichia coli) neutro Basfilas sobre PH 8.5
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Temperatura

Temperatura mnima: Por debajo de la cual el organismo no crece(12C) Temperatura mxima: Por encima de la cual el organismo no crece(105C) Temperatura ptima: En ella el organismo crece mejor y mas rpido.
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Psicotrofas: t de refrigeracin (salmonella) Mesfila: t fisiolgica (E.coli) Termfila: t altas, alrededor de 55c Termdurica: resiste ebullicin. (archaeas)

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Concentracin

La concentracin de iones va incidir en la funcin enzimtica y en los movimientos de agua. Microorganismos osmticos: resisten altas presiones osmticas. Halfilos: resisten altas concentraciones de Na.

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Requerimiento de oxigeno

Aerbicas: crecen con la concentracin de oxigeno comn de nuestra atmosfera, utilizan oxigeno en su metabolismo. Anaerbicas: no necesitan oxigeno en su metabolismo. Microaerofilas: crecen cuando hay baja concentracin de oxigeno, debe ser menor a la concentracin atmosfrica normal. Aerobias estrictas: solo necesitan oxigeno y nada mas, para su desarrollo y metabolismo. Anaerbicas estrictas: no se desarrollan en 7/5/12 ambientes con oxigeno.

Anaerobias facultativas: cuando hay 0xigeno hacen respiracin oxidativa, cuando no hay oxigeno, hacen fermentacin.
a) b) d) e)

Bacterias aerobias estrictas Bacterias anaerobias estrictas Bacterias microaerfilas Bacterias anaerobias facultativas (facultativas)

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Otros microorganismos.

La existencia de otros microorganismos puede ser un factor importante.

Por ejemplo en nuestras manos tenemos bacterias que son parte de la microbiota normal de esta parte de nuestro cuerpo, las cuales generaran condiciones especificas como PH, desechos metablicos que podran evitar el crecimiento de microorganismos. Si removimos estos microorganismos residentes que no son patgenos, por ejemplo por uso excesivo de jabones, habrn condiciones especiales para la 7/5/12 proliferacin de hongos por ejemplo.

Tambin puede ser que dos especies de microorganismos van a competir por los nutrientes.

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Fase de crecimiento exponencial

En el momento que el microorganismo ha encontrado condiciones optimas y se ha adaptado por lo que comienza a multiplicarse.

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Tiempo generacional

Es el tiempo en minutos en que una bacteria se divide, el tiempo varia segn las condiciones, si la bacteria esta en las mejores condiciones, el tiempo generacional ser mas corto. Tiempo generacional= tg Cada bacteria que se divide crea una generacin : g

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1g

2g

3g

Importante: las bacterias se dividen por biparticin y es un crecimiento con un comportamiento matemtico exponencial o tambin de 7/5/12 progresin geomtrica.

NT: Ni x 2^g

Donde: NT: numero total de bacterias Ni: numero inicial de

bacterias 2: constante de duplicacin g: numero de generaciones

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Caso: La bacteria Escherichia coli, muy comn en nuestro colon, crece de manera muy rpida a temperatura fisiolgica, con un PH cercano al neutro, con un tiempo generacional en condiciones optimas de 15 minutos. Cuntas bacterias tendr en 4 horas y 30 minutos, si al comienzo tenia 5 bacterias?

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Datos: Ni: 5 g: 18 (4 horas y media =270 min/15 tg) NT: ? NT= 5 x 2^18 NT= 5x 262.144 NT=1.310.720 Entonces mis E.coli en 4 horas y medias 7/5/12 se convirtieron en 1.310.720 bacterias.

ITU

Una infeccin del tracto urinario es un claro ejemplo de lo ya visto, una proliferacin de microorganismo s que encuentran condiciones adecuadas.

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Flora normal del tracto urinario

Diphteroides Bacillus spp. Micrococcus Lactobacillus spp. Strepcoccus grupo viridans

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Uropatogenos

Escherichia coli Klebsiella spp. Proteus spp. Pseudomonas aeruginosa Enterobacter spp. Serratia marcescens Staphylococcus aureus Enterococcus spp.

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Escherichia coli es mas comn en pacientes ambulatorios Proteus spp son mas comunes en infecciones de pacientes hospitalizados

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La va urinaria es estril desde el glomrulo hasta el tercio medio de la uretra. Desde un punto de vista terico, las bacterias pueden invadir el tracto urinario La ruta ascendente: es el principal mecanismo de infeccin, y como lo dice el nombre, los microorganismos ascienden desde la zona perianal hasta la uretra.
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Cmo se defiende el husped?

PH de la orina Osmolaridad de la orina Urea en la orina Secreciones prostticas

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Cmo comprobar la presencia de ITU?

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Examen de orina

El Urocultivo estndar emplea orina de segunda miccin. Los primeros 10-12 ml de orina deben eliminarse para arrastrar las bacterias presentes en el tercio distal de la uretra, que pueden contaminar la muestra. Requiere aseo genital previo y frasco estril.
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pruebas

Urocultivo en agar McConkey

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UFT

Se toma 1 microlitro de orina, se cultiva en este agar y se espera la formacin de colonias de gram negativos. Se cuentan las colonias que crecieron en 1 microlitro, y por regla de 3, se calcula las UFT de un mililitro de orina ( 1 ml)
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>100 coliformes/ml o > 100.000 de no coliformes en mujeres sintomticas. >10000 bacterias /ml en hombre sintomticos. >100.000 bacterias/ml en individuos asintomticos en dos muestras consecutivas.
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Examen bioqumico

Con cintas reactivas: Parmetros importantes: Nitritos: bacterias de la infeccin urinaria metabolizan los nitratos a nitritos. Leucocitos: la respuesta inmune nos indica una infeccin, la presencia de macrfagos y polimorfonucleares atacaran estas bacterias produciendo inflamacin (cistitis) 7/5/12

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Fase estacionaria

Momento en el cual deja de crecer el numero de bacterias. OJO : no significa que las bacterias dejaron de multiplicase, significa que el nmero de bacterias que mueren es muy similar a las que nacen.

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En esta etapa hay una sobrepoblacin en el ecosistema, lo que provoca una escasez de nutrientes y muchos desechos metablicos, lo que provoca que no todas las bacterias tengan las condiciones optimas para poder multiplicarse.
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Muerte de las clulas

Muerte: la bacteria pierde la capacidad de reproducirse. Definitivamente las bacterias no tienen condiciones optimas, dejas de multiplicarse, envejecen y mueren, por lo tanto comienza a bajar la poblacin.
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Eliminacin de microorganismos

el numero de microorganismos que muere por cada unidad de tiempo es un porcentaje constante del numero de microorganismos sobrevivientes probabilidad* Valor D = unidad de tiempo en el que elimino el 90% de los microorganismos
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Por lo tanto, si para medir el crecimiento de las bacterias usbamos potencias, para medir la muerte se usa el logaritmo de base 10.

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ejemplo

Tengo una poblacin de 100.000 bacterias y aplico un agente desinfectante que tiene un valor D de 10 minutos
D log Viables 10.000 1000 100 10 1 0.1 No viables 0 90.000 9.000 900 90 9 0.9 0 min 10 min(1D) 20min (2D) 30min (3D) 40min (4D) 50min (5D) 60min (6D) 7/5/12 10^5 10^4 10^3 10^2 10^1 10^0 10^-1 100.000

90%

99% 99.9 %

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90 % D 99 % 2D 99.9 % 3D 99.99 % 4D 99.999% 5D

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Eliminacin de microorganismos
Estndar: probabilidad de que queden microorganismos viables de 10^6 Tipos de esterilizacin: Autoclave: calor hmedo (15 min a 121 C) Pupinel: calor seco ( 1 a 2 horas a 180 o 200 C)
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Tambin existe la pasteurizacin, esterilizacin comercial, y escaldado o blanqueado.

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Medios de cultivos

Agar: Medio de cultivo solido es un polisacrido extrado de algunas algas marinas, con alta capacidad de captar agua y formas gel. Usualmente se utilizan (promedio) 20 gr por litro de solucin.
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Se prepara en tubos o placas de

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En el agar las bacterias forman colonias:

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Agar semi solido

Es un agar menos concentrado. En promedio son 5 gramos por litro de solucin. Se utilizan usualmente para medir la movilidad de las bacterias.

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Caldos de cultivo

Son medios de cultivo lquidos. Se preparan en botellas o tubos. Las bacterias generan turbidez, no colonias.

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Microbiologa

Alonso Torres Escuela de Nutricin y

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