P6 SecuenciamientoIlluminaIonTorrentNanopore
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PRÁCTICA 06
Secuenciación de ADN:
Métodos de Illumina, Ion Torrent y Nanopore
I. Introducción
La secuenciación de ADN es una técnica fundamental en la biología molecular y la genética, que
permite determinar el orden de los nucleótidos en una molécula de ADN. Existen varios métodos
de secuenciación que han revolucionado nuestra capacidad para leer el código genético, entre los
más destacados se encuentran los métodos de Illumina, Ion Torrent y Nanopore. Cada uno de
estos métodos tiene sus propias ventajas, limitaciones y aplicaciones específicas en la investigación
y diagnóstico genético.
II. Objetivo
Entender los principios y procedimientos de los métodos de secuenciación de ADN de Illumina,
Ion Torrent y Nanopore.
III. Materiales
- Proyector para reproducir videos documentales.
- Cuaderno de laboratorio y lapicero.
IV. Procedimiento
4.1. Visualización de Videos Documentales: Analizar los siguientes videos documentales que
explican los métodos de secuenciación de ADN: método de secuenciación de Illumina,
método de secuenciación de Ion Torrent y método de secuenciación de Nanopore.
4.2. Anotaciones y Comparaciones: Mientras ve los videos, tome notas sobre los principios de
funcionamiento, las etapas clave del proceso, las ventajas y desventajas de cada método.
e-mail: [email protected]
Mg. Freddy Eddinson Ninaja Zegarra-UNJBG
PRÁCTICA 06
4.3. Desarrollo de cuestionario: Utilice sus anotaciones para responder las siguientes:
4.3.1. Métodos de Illumina:
1. ¿Qué tipo de molécula se incorpora en la secuenciación por síntesis de Illumina?
2. ¿Qué nombre recibe el proceso que amplifica las secuencias de ADN en la plataforma de
Illumina?
3. ¿Cómo se llama el proceso en el que se generan miles de millones de copias de fragmentos de
ADN en Illumina?
4. ¿Qué tipo de señal se detecta durante la secuenciación de Illumina para identificar nucleótidos?
5. ¿Qué es el "indexing" y para qué se utiliza en Illumina?
6. ¿Cuál es la función de los nucleótidos terminadores reversibles en Illumina?
7. ¿Qué ventaja proporciona el "paired-end sequencing" en la tecnología de Illumina?
4.3.2. Métodos de Ion Torrent
1. ¿Qué cambio químico detecta la tecnología Ion Torrent durante la incorporación de
nucleótidos?
2. ¿Qué componente del chip de Ion Torrent detecta la liberación de iones de hidrógeno?
3. ¿Qué tipo de PCR se utiliza para amplificar las secuencias de ADN en Ion Torrent?
4. ¿Cuál es el principal subproducto detectado por Ion Torrent durante la secuenciación?
5. ¿Qué elemento del chip Ion Torrent convierte los cambios de pH en señales eléctricas?
6. ¿Qué ventaja tiene la tecnología Ion Torrent en términos de velocidad de secuenciación?
7. ¿Qué tipo de errores son comunes en la secuenciación de Ion Torrent?
4.3.3. Métodos de Nanopore
1. ¿Qué estructura biológica se utiliza en la tecnología Nanopore para leer secuencias de ADN?
2. ¿Cómo se diferencian los nucleótidos durante la secuenciación en Nanopore?
3. ¿Qué proteína es esencial para la translocación del ADN a través del nanoporo?
4. ¿Qué ventaja ofrece la tecnología Nanopore en términos de longitud de lecturas de secuencia?
5. ¿Cómo se detectan los nucleótidos en la tecnología Nanopore?
6. ¿Qué tipo de muestras pueden ser secuenciadas directamente sin amplificación en Nanopore?
7. ¿Qué es un "flow cell" y cuál es su función en la tecnología Nanopore?
V. Resultados Esperados
- Análisis de videos documentales.
- Cuestionario de preguntas resuelto.
VI. Conclusiones
VII. Bibliografía
VIII. Cuestionario
1. Elabore un cuadro con las ventajas y desventajas de cada una de las tecnologías usadas en secuenciación
(Illumina, Ion Torrent, Nanopore)
e-mail: [email protected]
Mg. Freddy Eddinson Ninaja Zegarra-UNJBG