Guia de Contenidos Sesión 4 BIOL130

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INTRODUCCIÓN:

Una molécula de ácido desoxirribonucleico (ADN) consiste en dos largas cadenas de


polinucleótidos. El ADN contiene la información necesaria para la síntesis de ARN (ácido
ribonucleico) y proteínas, las cuales son moléculas esenciales para todas las funciones y
propiedades de la célula.

ESTRUCTURA Y FUNCIONES DEL ADN:


Una molécula de ADN consiste en dos cadenas complementarias de nucleótidos.
- Una molécula de ADN consta de dos largas cadenas de polinucleótidos, compuestas por 4
subunidades de nucleótidos (A, G, T, C). Cada una de estas cadenas se conoce como cadena
o hebra de ADN.
- Existen enlaces tipo puente de hidrógeno entre los nucleótidos complementarios de cada
una de las cadenas de ADN (2 entre A-T y 3 entre C-G).
- Un nucleótido está compuesto por un azúcar de 5 carbonos, una base y uno, dos o tres
grupos de fosfato.
- Las dos hebras son antiparalelas.

El ADN contiene información trascendental para la célula.


- La totalidad de la información genética de un organismo (es decir, todo el ADN que posee)
se denomina Genoma. El ADN contiene a los genes.
- Los genes son segmentos de secuencia de ADN (contenidos en el genoma) los cuales
pueden codificar ARNs o proteínas. Por lo tanto, el genoma contiene la información que
codifica para todas las proteínas y moléculas de ARN que el organismo alguna vez
sintetizará.
- Los genes llevan información biológica que debe copiarse con precisión para su
transmisión a las células de la próxima generación. Cada hebra de ADN puede actuar como
templado en la copia del ADN. Este proceso de copia se denomina replicación.
- En eucariotas, el ADN esta “encerrado” en el núcleo. Los procariontes carecen de
membrana nuclear, por lo que su material genético esta distribuido por el citosol
bacteriano.
- El ADN eucariótico debe estar empaquetado (compactado) para estar en el núcleo. Este
empaquetamiento es gracias a la interacción de ADN con proteínas específicas (llamadas
histonas). El complejo ADN y proteínas se denomina cromatina.
- En eucariotas, el ADN esta dividido en un conjunto de cromosomas lineales diferentes (su
número depende de cada especie), en cambio, la mayoría de los procariontes poseen sólo
un cromosoma circular (ADN genómico bacteriano) y ADN extracromosómico (plasmidos).
- Cada célula humana contiene 2 copias de cada cromosoma, una paterna y una materna.
El par cromosómico se denomina par homólogo (por ejemplo, cromosoma VI, del cual existe
uno cromosoma materno y otro paterno). Los únicos cromosomas que no son homólogos
son los determinantes del sexo (cromosoma X e Y). La visualización de los 46 cromosomas
en mitosis se llama cariotipo humano.
- Cada molécula de ADN que forma un cromosoma lineal debe contener un centrómero, dos
telómeros y multiples origenes de replicación.
- El centrómero permite que las dos cromátidas hermanas se unan. Un complejo de proteínas
llamado cinetocoro, se unen en el centrómero, permitiendo la unión del cromosoma
duplicado al huso mitótico, lo que permite que se separen.

- Por su parte, los telómeros son los extremos del ADN y contienen muchas secuencias de
nucleótidos repetidas que permiten que los extremos de los cromosomas se repliquen de
manera eficiente. También el telómero “protegen el ADN'' de la perdida de información
genética.

Los nucleosomas son la unidad básica de la estructura del cromosoma eucariota.


- Dentro de las proteínas que se pueden unir al ADN para formar los cromosomas
eucarióticos se dividen tradicionalmente en dos clases: las histonas y las proteínas
cromosómicas que no son histonas.
- Las histonas son una familia proteínas básicas, capaces de unirse. al ADN, permitiendo su
compactación. Estas son H2A, H2B, H3 y H4
- Las histonas son responsables del primer y más básico nivel de empaquetamiento
cromosómico, el nucleosoma. Un octámero de histona (8 histonas, es decir, 2 de cada tipo)
forma el núcleo o “core” histónico, en el cual se enrolla el ADN bicatenario (doble hebra).
Especificamente, cada nucleosoma posee 147 pares de basesde ADN.
- Cada nucleosoma está separado del siguiente por un ADN denominado “linker”.
- Además, cada histona que conforma el nucleosoma posee una cola de aminoácidos en
posición N-terminal, que sobresale desde el core de histonas. Estas colas de histonas están
sujetas modificaciones covalentes diferentes, como por ejemplo acetilaciones,
metilaciones, etc.

- Dependiendo del grado de compactación de la cromatina, esta se puede clasificar en


Heterocromatina (muy compactada) o Eucromatina (relajada). El grado de compactacion
depende de las modificaciones covalentes que puedan sufrir las histonas (como
acetilaciones o metilaciones).
- Las histonas han sido descritas solo en eucariontes.

LA REPLICACIÓN:
- La replicación es el proceso en que el ADN se duplica antes de la división celular, para que
cada célula que se produzca tenga la misma información genética.
- Este proceso es semiconservativo (modelo propuesto por Watson y Crick), es decir, cada
molécula de ADN resultante esta compuesta por una cadena antigua (molde) y una cadena
nueva.
- La replicación comienza en un punto de origen y normalmente transcurre en forma
bidireccional.
- La síntesis de ADN ocurre en dirección 5’ → 3’y es semidiscontinua.
- La replicación ocurre durante el ciclo celular, antes de que la célula se divida en dos células
hijas.
- La ADN polimerasa es la enzima que sintetiza la formación de las nuevas hebras de ADN.
Esta enzima requiere de un molde (hebra molde) y de un partidor o primer (iniciador) para
sintetizar la nueva cadena de ADN.
- El apareamiento de bases entre el desoxirribonucleótido entrante y la cadena molde guía
es a través de complementariedad de bases (A-T y G-C).

- Durante la replicación, una de las cadenas nuevas se produce como un fragmento continuo
(hebra líder o continua), mientras que la otra se hace de pequeños fragmentos (hebra
rezagada o discontinua)
- Existen tres etapas principales en la replicación del DNA: Inicio → Elongación → Termino.
- El punto de inicio de la replicación en el cromosoma de E. coli es la secuencia oriC
(replication origin).
- Los eucariontes poseen múltiples orígenes de replicación (el número depende el a especie).
- Horquilla de replicación: Estructura que se forma durante el proceso de síntesis del ADN
(ojo replicativo)
- Fragmentos de Okazaki. Los fragmentos de Okazaki son fragmentos de ADN sintetizados
en la hebra discontinua, que quedan separados por pequeños segmentos de ARN que son
removidos y el espacio es sellado por una DNA ligasa.
- Inicio de la síntesis del DNA: DNA primasa esta enzima puede iniciar la síntesis de una
cadena polinucleotídica por la unión de ribonucleótidos (ARN) cortos. Este ARN deja un
extremo 3’-OH necesario para que la ADN polimerasa pueda iniciar la polimerización de las
hebras nuevas. Los segmentos de RNA son removidos y el espacio es sellado por una DNA
ligasa.
Proteínas que actúan en la horquilla de replicación
- Unión de la ADN helicasa: se une a una cadena de hebra simple hidrolizando ATP. Una vez
unida desenrolla la doble hebra. Avanza “rompiendo” los enlaces puente de hidrogeno
entre las hebras.

- ADN girasa (topoisomerasa II): libera la tensión en la doble hebra generada por el
desenrrollamiento.
- Single strand binding proteins o SSB: proteínas especiales que ayudan a mantener la doble
hebra de DNA abierta en la horquilla de replicación, ademas de proteger al ADN de posibles
fracturas.

- Existen 3 ADN polimerasas (I, II y III) en bacterias y 5 ADN polimerasas (a, b, g, d, e) en


eucariontes. Todas polimerizan de 5’→3’y tienen actividad exonucleasa (proofreading) de
3’→5’.
- Proofreading: hace referencia a la capacidad correctora de las polimerasas. La polimerasa
remueve cualquier residuo mal apareado.
- Sliding clamp (abrazadera deslizante): ayudan a la polimerasa a quedarse firmemente en
el ADN a medida que se mueve por la hebra sencilla.
-Termino de la replicación: en procariontes es más simple que en eucariontes.
-Los eucariontes poseen varios cromosomas con telómeros en sus extremos: para replicar
los telómeros que tienen cientos de repeticiones de la secuencia, los eucariontes poseen
una enzima especial llamada telomerasa que realiza esta función.
DEL ADN A LAS PROTEINAS: TRANSCRIPCION Y TRADUCCIÓN
Transcripción:
- La transcripción es el primer paso de la expresión génica. Esta etapa consiste en
copiar la secuencia de ADN de un gen para producir un ARN.

- Al igual que el ADN, el ARN es un polímero lineal compuesto de 4 bases


nucleotídicas (A, U, C, G), azúcares (pentosa) y grupos fosfato. Las azúcares tienen
en el carbono 3` un grupo OH en lugar de H. Este OH es más reactivo, por lo tanto,
el ARN es menos estable que el ADN.

- Las enzimas que realizan la transcripción son la ARN polimerasa. Esta polimerasa
cataliza la formación de enlaces fosfodiéster que unen los nucleótidos para formar
una cadena lineal. Siempre lo realiza en dirección 5` → 3`

- La liberación inmediata de la cadena de ARN del ADN, a medida que se va


sintetizando, significa que muchas copias de ARN pueden realizarse a partir del
mismo gen en un tiempo relativamente corto.
- La ARN polimerasa no es tan precisa como la ADN polimerasa, pero posee también
posee un mecanismo de corrección de errores.
- Existen 3 ARN polimerasas en eucariontes (ARN pol I, II y II) y solo una en
procariontes.
- A diferencia de la ADN polimerasa, la ARN polimerasa no requiere partidor (primer).
Además, la trascripción se inicia solo en secuencias denominadas promotores de
cada gen.
- La ARN pol I transcribe los genes ribosomales (ARNr) 28S, 18S y 5.8S.
- La ARN pol III transcribe los genes de ARN de transferencia (ARNt) y el ARN
ribosomal (ARNr) 5S.
- La ARN pol II transcribe los genes que generan los ARN mensajeros (ARNm), y que
posteriormente producirán las proteinas.
- La transcripción consta de 3 etapas: Inicio → Elongación → Termino.
- La transcripción comienza cuando al ARN polimerasa se une a la secuencia del gen
llamada promotor, cerca del inicio de la transcripción. Esta unión puede ser directa
o a través de proteínas auxiliares.
- La ARN polimerasa utiliza una de las cadenas de ADN como plantilla o molde para
hacer una nueva molécula de ARN complementaria. La elongación básicamente es
la etapa donde la hebra de ARN se alarga al agregar nuevos nucleótidos.
- La transcripción finaliza en un proceso llamado terminación. La terminación
depende de secuencias en el ARN que señalan el fin de la transcripción.

Procesamiento de los ARNs mensajeros:


- Cuando se produce inicialmente un transcrito de ARNm en las células eucariontes,
este se debe procesar para obtener un ARN mensajero maduro, el cual puede salir
del núcleo para ser traducido.

- En el procesamiento, al extremo 5` del transcrito de ARNm se añade un cap la cual


es un nucleotido modificado (7-metil-guanosina). Al extremo 3` se añade una cola
de poli-A.
- En la mayoría de los ARNm ocurre también el proceso conocido como splicing o
“corte y empalme”. En este proceso, algunas secciones del transcrito de ARNm
(intrones) se eliminan y las secciones restantes (exones) se vuelven a unir.
- Algunos genes pueden experimentar splicing alternativo, lo que conduce a la
producción de diferentes ARNm maduros a partir del mismo transcrito inicial.
- Estas modificaciones descritas son esenciales en células eucariontes. Estas entregan
estabilidad y permiten el tránsito del ARNm desde el núcleo al citoplasma.
Traducción:
Síntesis de proteínas y código genético.
- La traducción es la etapa donde el ARNm se "decodifica" para construir una proteína
(o un pedazo/subunidad de una proteína) que contiene una serie de aminoácidos
en específicos.
- En un ARNm, las instrucciones para construir un polipéptido son los nucleótidos de
ARN (A, U, C, y G), que se leen en grupos de tres. Estos grupos de tres se conocen
como codones. Por ejemplo, una proteína de 100 aminoácidos estará́ codificada por
un mRNA de 300 nucleótidos.

- Existen 61 codones para los aminoácidos. Cada uno se "lee" para especificar un
cierto aminoácido de los 20 que se pueden encontrar comúnmente en las proteínas.
Por ejemplo, un codón AUG especifica el aminoácido metionina y también actúa
como un codón de inicio para señalar el comienzo de la construcción de la proteína.
- Hay tres codones más que no especifican aminoácidos. Estos codones de
terminación (UAA, UAG y UGA) le informan a la célula cuando está completo un
polipéptido. En conjunto, esta colección de relaciones codón-aminoácidos se llama
el código genético, porque permite que las células "decodifiquen" un ARNm en una
cadena de aminoácidos.
- El código genético es UNIVERSAL, ya que un codón en un organismo especifica el
mismo aminoácido en cualquier otro. No es ambiguo, porque cada codón codifica
para un solo aminoácido. También el código genético es Degenerado, es decir, un
aminoácido puede ser codificado por más de un codón.
- Marcos de lectura: un marco de lectura abierto es aquel que comienza en un codón
AUG de inicio. Existen tres posibles pautas en la lectura de proteínas. Mutaciones en
el DNA pueden producir mutaciones silenciosas, sin sentido o con cambio de
sentido.
- Los ARNs de transferencia o ARNt, son "puentes" moleculares que conectan los
codones del ARN con los aminoácidos para los que codifican. Un extremo de cada
ARNt tiene una secuencia de tres nucleótidos llamada anticodón, que se puede unir
a codones del ARNm en específico. El otro extremo de ARNt lleva los aminoácidos
que especifican los codones.
- Los ribosomas son las estructuras donde se construyen los polipéptidos (proteínas).
Se componen de proteínas y ARNr (ARN ribosomal) y son producidos en el nucléolo
(dominio nuclear). Cada ribosoma tiene dos subunidades, una grande y una
pequeña, que se reúnen alrededor de un ARNm. El ribosoma proporciona un
conjunto de espacios útiles o “sitios” donde los ARNt pueden encontrar sus codones
correspondientes en la plantilla del ARNm y entregar sus aminoácidos. Estos
espacios se denominan sitios A, P y E. Además, el ribosoma actúa como una enzima
que cataliza la reacción química que une los aminoácidos para formar una cadena
polipeptídica.

Los pasos de la traducción:


- La traducción consta de 3 etapas: Inicio → Elongación → Termino.
- En la iniciación, el ribosoma se ensambla alrededor del ARNm que se leerá junto con
el primer ARNt (que lleva el aminoácido metionina y que corresponde al codón de
iniciación AUG). Este conjunto (ribosoma, ARNt, ARNm), es conocido como
complejo de iniciación, el cual se necesita para que comience la traducción.

- La elongación es la etapa donde la cadena de aminoácidos se extiende. En la


elongación, el ARNm se lee de un codón a la vez, y el aminoácido que corresponde
a cada codón se agrega a la cadena creciente de proteína.
- Cada vez que un codón nuevo está expuesto, un ARNt correspondiente se une al
codón; La cadena de aminoácidos existente (polipéptido) se le une el aminoácido
nuevo del ARNt entrante, mediante una reacción química formándose el enlace
peptídico. Luego de esto, el ARNm se desplaza un codón sobre el ribosoma, lo que
expone un nuevo codón para que se lea. Durante la elongación, los ARNt pasan por
los sitios A, P, y E. Este proceso se repite muchas veces conforme se leen los nuevos
codones y se agregan los nuevos aminoácidos a la cadena.
- La terminación es la etapa donde la cadena polipeptídica completa es liberada.
Comienza cuando un codón de terminación (UAG, UAA o UGA) entra al ribosoma, lo
que produce una serie de eventos que separa el ARNm, los ribosomas, y la cadena
polipeptídica recién sintetizada.
- Después de la terminación, es posible que el polipéptido necesite tomar su forma
tridimensional correcta, además de poder sufrir modificaciones post-traduccionales
correspondientes.

Control de la expresión génica:


- La regulación génica es la forma como una célula controla qué genes, de los muchos
genes en su genoma, se "encienden" (expresan). Gracias a la regulación de los genes,
cada tipo de célula de un organismo tiene un conjunto diferente de genes activos, a
pesar de que casi todas sus células contienen exactamente el mismo ADN. Estos
diferentes patrones de expresión génica causan que los diversos tipos de células
tengan diferentes conjuntos de proteínas, lo que hace que cada tipo de célula sea
exclusivamente especializada para hacer su trabajo.
- En los eucariontes, la expresión de los genes involucra muchos pasos y su regulación
puede ocurrir en cualquiera de ellos. Sin embargo, muchos genes se regulan
principalmente en el nivel de la transcripción.
Diferentes tejidos producen diferentes proteínas.
- Las células en un organismo multicelular se diferencian en los diferentes tejidos
porque sintetizan y acumulan diferentes conjuntos de ARNs y proteínas, es decir,
expresan distintos genes. Por ejemplo, una de las funciones del hígado es eliminar
las sustancias tóxicas como el alcohol de la sangre. Para ello, las células del hígado
expresan genes que codifican las subunidades de una enzima llamada alcohol
deshidrogenasa. Esta enzima descompone al alcohol en una molécula no tóxica. Las
neuronas en el cerebro de una persona no eliminan las toxinas del cuerpo, así que
mantienen estos genes sin expresar, o "apagados". Del mismo modo, las células del
hígado no envían señales utilizando neurotransmisores, así que mantienen los genes
neurotransmisores apagados.
- La transcripción de cada gen es controlada por la región regulatoria en el ADN,
cercano al sector donde comienza la transcripción (promotor). Proteínas que
reconocen estas secuencias y se unen a ellas, estas proteínas se denominan factores
de transcripción.

Regulación génica en eucariontes:


- Como se mencionó anteriormente, la expresión génica en eucariontes implica
muchos pasos y casi todos pueden regularse. Diferentes genes se regulan en
diferentes puntos y no es poco frecuente que un gen (particularmente uno
importante o “poderoso”) sea regulado en múltiples pasos. A continuación, se
describen algunos de estos controles:

- Accesibilidad de la cromatina. La estructura de la cromatina (ADN y sus proteínas


de organización) puede regularse. La cromatina más abierta o “relajada”
(eucromatina) hace a un gen más disponible para la transcripción.
- Transcripción. La transcripción es un punto regulador clave para muchos genes.
Grupos de proteínas del factor de transcripción se fijan a secuencias específicas del
ADN en o cerca de un gen y promueven o reprimen su transcripción en un ARN.
- Procesamiento del ARN. El proceso de corte y empalme, la adición del cap y la
adición de una cola poli-A a una molécula de ARN pueden regularse, así como la
salida del núcleo. Se pueden producir diferentes ARNm maduros del mismo ARNm
por el proceso de empalme alternativo.
- Estabilidad del ARN. El curso de vida de una molécula de ARNm en el citosol afecta
cuántas proteínas pueden producirse desde ella.
- Traducción. La traducción de un ARNm puede aumentarse o inhibirse por los
reguladores.
- La actividad de la proteína. Las proteínas pueden someterse a una variedad de
modificaciones, tales como ser cortadas o modificados con grupos químicos. Estas
modificaciones pueden ser reguladas y pueden afectar la actividad o el
comportamiento de la proteína.

Referencias:

Libro: Biología molecular de la célula. Alberts B, Johnson A, Lewis J, Morgan D, Raff M,


Roberts K, Walter P. 2008. Quinta y Sexta edición. Editorial Garland Science Taylor & Francis
Group, LLC. UK.

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