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    3 DNA y Antecedentes

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    Gybran Vargas
    Este documento presenta información sobre el curso de Genética Microbiana impartido por el Prof. Antonio Ibarra. Aborda conceptos como el tamaño de genomas, densidad génica, genes indispensables y dispensables, y modelos de replicación del ADN como el conservativo, semiconservativo y dispersivo. Explica el experimento clásico de John Cairns para demostrar el modelo semiconservativo de replicación del ADN.

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    3 DNA y Antecedentes

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    Este documento presenta información sobre el curso de Genética Microbiana impartido por el Prof. Antonio Ibarra. Aborda conceptos como el tamaño de genomas, densidad génica, genes indispensables y dispensables, y modelos de replicación del ADN como el conservativo, semiconservativo y dispersivo. Explica el experimento clásico de John Cairns para demostrar el modelo semiconservativo de replicación del ADN.

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    3 DNA y antecedentes

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    3 DNA y Antecedentes

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    Este documento presenta información sobre el curso de Genética Microbiana impartido por el Prof. Antonio Ibarra. Aborda conceptos como el tamaño de genomas, densidad génica, genes indispensables y dispensables, y modelos de replicación del ADN como el conservativo, semiconservativo y dispersivo. Explica el experimento clásico de John Cairns para demostrar el modelo semiconservativo de replicación del ADN.

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    de 50

    Curso de Genética

    Microbiana

    Prof. Antonio Ibarra

    Estructura del DNA y REPLICACIÓN


    Tarea
    ● GENOMAS

    ● ¿DUDAS DE ANTECEDENTES?

    ● ASESORÍAS
    Ver un ejemplo
    Tamaño del genoma en:

    Pares de bases y se abrevia pb o bp (en inglés)

    Las variantes son:

    Kpb o sea: son 1000 pb

    Mpb o sea: son 1,000,000 pb

    ¿Es lo mismo tamaño del genoma que número de genes?

    NO, NUNCA, NEVER


    Ya sabemos qué es un gen ¿cuánto mide uno?

    La respuesta es depende ¿de qué? De qué organismo se hable.

    Así, en una bacteria (que son los organismos que veremos en este
    curso) el tamaño PROMEDIO de un gen es de 1,000 pb o 1 kpb.

    Si Salmonella enterica tiene un genoma de 5.5 x 106 pb ¿Cuántos


    genes podría tener?

    ------------
    Dado lo mencionado
    ¿cómo defines
    densidad génica?
    + Conceptos
    (no son los últimos, sorry!)
    ¿Que es un gen dispensable?

    ¿Qué es un gen indispensable?


    ¿Que es un gen dispensable?

    Es un gen que puede ser eliminado o mutado y no afectar la


    viabilidad de una célula.

    ¿Qué es un gen indispensable?

    Es un gen que al ser eliminado o mutado afecta la viabilidad de una


    célula.

    ¿EJEMPLOS?
    Los genes indispensables también tiene otro nombre:

    HOUSEKEEPING o de Mantenimiento

    ¿EJEMPLOS?
    Replicación
    Modelos de replicación del DNA
    ★ Conservativo

    ★ Semiconservativo

    ★ Dispersivo
    ¿Se entendió?
    En 1963, John Cairns realizó un experimento replicando DNA en bacteria

    para incorporar timidina tritiada. Teóricamente, cada molécula de DNA nueva

    deberá tener una hebra radioactiva o “caliente” y otra no radioactiva o “fría”.

    Purificó el DNA después de un ciclo y lo fotografió por TEM

    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21790/#:~:text=In%201963%2C%20John%20Cairns%20tested,(%E2%80%9Ccold%E2%80%9D)%20strand.
    En un segundo ciclo de replicación vió esto:

    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21790/#:~:text=In%201963%2C%20John%20Cairns%20tested,(%E2%80%9Ccold%E2%80%9D)%20strand.
    https://www.nature.com/articles/s41594-019-0194-1
    Prescott y Kuempel

    https://schaechter.asmblog.org/schaechter/2015/01/pictures-considered-23-what-grains-tell.html
    ¿Qué implica esto?
    ¿Qué hay un qué?
    Evidencias de Bird, Louarn,
    Martuscelli (1972), sitio ilvA.

    (1973) Rytter y Hirota.


    Origen de replicación,
    plásmidos que además de
    proteínas tienen lípidos
    ¿qué implica esto?
    Horquillas de
    replicación
    ¿Ya se cansaron?
    REPLICACIÓN

    ● Sabemos que existe un origen de replicación en un sitio físico en el


    cromosoma.

    ● Se sabe dónde está.

    ● Si se le pone este oriC en un DNA circular se replica.

    ● ¿Y ahora? ¿Qué más necesitamos para “hacer” DNA?


    ¿Qué creen?
    Más
    conceptos
    5’ 3’
    5’ 3’

    3’ 5’

    5’ 3’
    3’ 5’

    3’ 5’
    G G A T C C A A
    5’ 3’

    3’ 5’
    C C T A G G T T
    Degradación

    Desnaturalización
    Degradación
    G G A T C C A A
    Por temperatura o por 5’ 3’
    concentración de sales,
    pH, acción enzimática
    3’ 5’
    C C T A G G T T

    -G- -G- -A- - T- -C- - C- - A- -A-

    -C- - C- -T- -A- -G- -G- -T- - T-


    Degradación
    G G A T C C A A
    Por temperatura o por 5’ 3’
    concentración de sales,
    pH, acción enzimática
    3’ 5’
    C C T A G G T T

    -G- -G- -A- - T- -C- - C- - A- -A-

    -C- - C- -T- -A- -G- -G- -T- - T-


    Degradación
    G G A T C C A A
    Por temperatura o por 5’ 3’
    concentración de sales,
    pH, acción enzimática
    3’ 5’
    C C T A G G T T

    -G- -G- -A- - T- -C- - C- - A- -A-

    -C- - C- -T- -A- -G- -G- -T- - T-


    Degradación
    G G A T C C A A
    Por acción enzimática 5’ 3’

    3’ 5’
    C C T A G G T T
    EXONUCLEASA 5’

    EXONUCLEASA 3’

    ENDONUCLEASA

    -G- -G- -A- - T- -C- - C- - A- -A-

    -C- - C- -T- -A- -G- -G- -T- - T-


    G G A T C C A A
    5’ 3’

    Desnaturalización

    Por temperatura o por


    concentración de sales

    3’ 5’
    C C T A G G T T
    G G A T C C A A
    5’ 3’

    Renaturalización

    Por temperatura o por


    concentración de sales

    3’ 5’
    C C T A G G T T
    ¿Cómo lo podemos medir?
    ESPECTRO DE ÁCIDOS NUCLEICOS
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