Bio Celular
Bio Celular
Bio Celular
1. CITOESQULET
1.0. Introducció
- Característiques moleculars: expressió i formes moleculars
Un fenómeno interesante en biología celular es el movimiento de cilios y flagelos y también la generación
de la forma celular, especialmente en los tipos celulares altamente especializados, tales como las células
nerviosas con sus largos axones y las células en cepillos del epitelio intestinal con sus micro-vellosidades.
Aunque las bases moleculares no se conocen en detalle, tanto el movimiento como las características
morfológicas de un tipo celular específico están relacionadas con un conjunto complejo de fibras
proteicas localizadas en el citoplasma: El citoesqueleto.
Todas las células eucarióticas observadas al microscopio electrónico contienen 3 clases principales de
fibras del citoesqueleto.
• En las fotografías se puede observar como los microfilamentos de actina tienden a ser largos y van de
una punta de la célula a la otra.
• Los microtúbulos tienden a ser radiales y parten de un solo punto en la célula. Podríamos decir que
forman estructuras radiales.
• Mientras que los filamentos intermedios tienden a rodear al núcleo ; es decir, forman estructuras
redondeadas en el espacio
1.1.1. Molècula.
- Expressió i control. Dominis funcionals de G. Formes moleculars.
Modificacions postraduccionals.
La actina es unja proteína globular (actina G) que polimeriza formando fibras. (Actina F) de 43 kDa
aprox. Es una proteína que se ha conservado muy bien evolutivamente. Es muy abundante. La actina de
las células musculares y la de las células no musculares son productos de genes diferentes y por tanto
difieren ligeramente en sus propiedades. Sin embargo, todas las actinas estudiadas tienen un tamaño
similar, poseen unas secuencias de aa muy parecidas y comparten muchas otras propiedades, lo que
sugiere que evolucionaron a partir de un único gen ancestral.
Necesita Mg+2 – ATP ya que tiene capacidad para hidrolizar el ATP. Forma ADP + Pi. La conformación
de la actina es diferente dependiendo de si une ATP o ADP. De hecho la actina G tiene 4 estados:
Los filamentos de actina crecen por adición de actina G en sus extremos. En las condiciones apropiadas,
la adicción de estas subunidades puede tener lugar por ambos extremos, pero el ritmo de adición de un
extremo, el llamado "extremos de crecimiento", es varias veces superior al del otro. La razón de esto es
que los monómeros de actina G contienen ATP ó ADP fuertemente unido. La velocidad de unión a los
microfilamentos es muy superior para la actina G con ATP unido que para la actina G con ADP. Poco
después de la polimerización de la actina se hidroliza el ATP enlazado, para convertirse en ADP, si bien
este proceso NO es esencial para que la polimerización tenga lugar.
La hidrólisis del ATP origina que en los filamentos de actina tenga lugar un fenómeno similar al de una
"cinta transportadora", esto es, el alargamiento de los filamentos en un extremo al incorporarse
monómeros de actina-ATP al tiempo que se acortan los extremos opuestos al liberarse subunidades de
actina -ADP.
GRAFICAS
El trademelling y mantener éste equilibrio dinámico es costoso para la célula. Necesita un mecanismo
rápido para volver a generar ATP a partir del ADP. Con ADP es lento, con ATP es rápido.
Se puede inducir un mecanismo físico de movimiento mediante esto. Sirve para propulsarse. Alguna
bacterias utilizan las polimerizaciones y despolimerizaciones para propagarse. Forman lo denominado
"cometa de actina". Realizan un trabajo mecánico.
DROGAS
* NOTA: "In vivo" es más el peso que tienen ciertas proteínas catalíticas que NO la propia química de la
polarización / despolarización de la Actina. Estas proteínas catalíticas son las reguladoras de muchos
procesos como:
-Entrecruzamiento
-Interacciones con la actina
-Unión a la membrana plasmática
-Polimerizaciones de actina (Bloq/Desbloq extremos i/o monómeros)
-Proteínas motoras.
- Prot. SECUSTRADORAS
La profilina secuestra los monómeros. Tiene más afinidad por ellos libres que no en filamentos. Lo que
pasa es que la profilina da el monómero al filamento. (=en vez de lo normal) (=VER FOTOCOPIAS)
- Prot. NUCLEADORAS
Forman complejos y sustituyen estos núcleos. "In vivo" lo realizan otras proteínas. (No hay aquel desfase
en la gráfica).
Mimetizan o reproducen agregaciones de monómeros de Actina-G. Inducen la polimerización de otros
filamentos.
Los filamentos preexistentes empujan la membrana. La profilina está unida a la membrana. El receptor
recibe el ambiente i disminuye la concentración de PIP2 . La profilina deja ir la actina G y se produce una
polimerización local. (=QUIMIOTAXI: fenómeno por el cual la célula se desplaza.)
ARP 2 y ARP 3 se asemejan a la actina G solo que éstas NO producen filamentos. En la célula, ARP 2 y
ARP 3 se unen a 5 proteínas (=Complejo ARP 2 , 3). Éste complejo se asemeja a un grupo preexistente
de monómeros. Entonces la actina se une a él y se polimeriza. El complejo ARP 2,3 puede unir más
filamentos y además también reconoce lateralmente a la Actina de tal manera que se producen estructuras
ramificadas. Como es lógico, el complejo ARP 2 ,3 se une al extremo negativo del filamento.
* En el borde de migración es donde se produce todo este proceso.. "In vitro" también se producen
ramificaciones.
- Prot. ENTRECRUZADORAS
Como mínimo tienen 2 dominios de interacción con la actina. Hay muchos tipos de estructuras.
Espectrina ==> Hace que el glóbulo rojo sea plástico. La espectrina se une a filamentos de actina y a
proteínas como Banda 4.1 las cuales se unen a la membrana plasmática.
Filamina ==> Cuando 2 filamentos se cruzan entre sí encontramos la filamina. Están en los cruces de 2
filamentos de actina
- Prot. RECUBRIMIENTO
Cap Z ==> Proteína que bloquea los extremos " + " de los filamentos.
Tropomodulina ==> Proteína que bloquea los extremos " - " de los filamentos.
- Prot. FRAGMENTADORAS.
Cofilina ==> Tensa los filamentos. El paso de rosca se hace más pequeño. Acaba rompiendo el filamento
Plaquetas: Son fragmentos de mega-células. De echo es citosol de una célula grande que se separa; se
secreta.. Son trozos de célula. Éstas plaquetas NO son activas; hay que activarlas. Una vez activas se
pegan a todo !!
Es un proceso que se realiza en fracciones de segundo. La plaqueta aumenta de superficie y fabrica fibras
"por doquier." La plaqueta está llena de Actina - G y profilina. La plaqueta se activa por las citoquininas
( NOx ). Las señales producen una entrada de Ca+2 ; se activa la gelsolina y se fragmentan los filamentos;
genera extremos " + " Entonces se inactiva la gelsolina debido a que PIP2 disminuye de concentración. La
profilina libera Actina - G y entonces hay un crecimiento explosivo. Hay mucha polimerización.!!!
Proteínas de interés que actúan como enlace de moléculas de membrana plasmática con Actina - F.
Los dominios C y N están plegados, si es así, la proteína está inactiva. Una vez se activa se despliega y
actúa con Actina - F. Muy importante la actividad Rho A inactiva. Separa el filamento de Actina - F.
Rho A: Es una proteína. Son GTPasas de peso molecular pequeño. Tienen 2 situaciones. El GTP no
hidroliza el GTP; necesita de GAP's específicas para que se active la actividad GTPásica. Entonces sí se
obtiene GDP. Cuando hay GDP se remplaza a GTP otra vez mediante una GEF específica. (2o3 en
asociación)
Al ser GTP actúa de manera que forma un complejo estable. Se separa cuando GTP se vuelve GDP. GDP
se forma en el citosol (Hay GEF)
Hay GTP (=estable) entonces van al núcleo, Se encuentra con un GAP; entonces se suelta. Todo esto
asegura la existencia de un ciclo.
27/9/04
Familia Rho A
ERM y Rho A son de la misma familia. Unión de N-C sobre sí mismos. (estado inactivo). La activación la
da Rho A.
* En las células hay una inhibición por contacto a la hora de replicarse. Por eso no se dividen. Los
protoncogenes codifican para proteínas que le dicen a la cell que NO se divida. Cada una que "se calla"
hace que la probabilidad de que haya una proliferación (tumor) aumenta. La proteína Ras es un típico
ejemplo. Es meramente probabilístico.
De GTPasas pequeñas hay muchas (200 aprox.) Ras es definitoria de una sub-familia. También hay Rac /
Rho / cdc42 / Rab,etc... . controlan todo el citoesqueleto.
Éstas GTPasas interaccionan con complejos de proteínas inestables y los estabilizan cambiando de
configuración. Está activa unida a GTP e inactiva unida a GDP. No se fosforila sino que transloca todo el
GDP por un GTP. Esto lo hace GEF.
El mismo GEF NO hidroliza sino que es GAP quién cambia GTP por GDP. Son todas específicas.
Si Ras NO funciona, No hay AMPc y por tanto NO hay señal para la cell. Es entonces cuando aumenta la
probabilidad del tumor.
EJERCICIO.....
A.- Estado Quiescente: Cell con vida normal.
B.- Al activar Rho hay más fibras de estrés y más puntos focales
C.- Al activar Rac hay más estructuras de mallas
D.- Al activar cdc42 hay "pelos"; protusiones.
GTP S: El enlace NO se puede hidrolizar !!. Inhibimos todas las GAP. Veríamos todos los resultados a la
vez.
Dominancia
Dominante negativo: la expresión de una proteína anómala hace inhibir lo que es la acción normal de una
proteína.
MOTORES MOLECULARES
Los filamentos solo tienen un motor; es la miosina. Hay 18 tipos. Todas las miosinas tienen cabezas
globulares (ATP asa), cuello con proteínas reguladoras y la cola lleva el orgánulo (o demás) a arrastrar.
Los filamentos de miosina son agrupaciones de ésta molécula; es lo que forman el músculo estriado.
* En el dominio motor hay una gran homología. Todas las miosinas van hacia el extremos "+"
(Excepción: Miosina VI )
La actina avanza en dirección " - ".
Actina , miosina y proteínas cap Z. Bloquea el extremo "+" de los filamentos en músculo liso/estriado. La
alfa-actina separa 30 nm. Provoca que NO se despolimerize el filamento.
Retículo endoplasmático liso. Retículo sarcoplasmático. En contacto con las bandas Z (=invaginación).
Provoca la liberación de Ca+2. Provoca que se modifique la actina / tropomiosina. Se desplaza dejando al
descubierto los puntos de unión con la miosina. Cuando el Ca+2 disminuye de concentración; el músculo
se relaja (=VER CONTRACCIÓN MUSCULAR)
MICROTUBULOS
Los microtúbulos son el tercer componente principal del citoesqueleto, son varillas rígidas y huecas de
aproximadamente 25 nm. de diámetro. Los microtúbulos son estructuras dinámicas que están
continuamente ensamblándose y desensamblándose en la célula. Intervienen en algunas formas de
locomoción celular, el transporte intracelular de orgánulos y la separación de cromosomas durante la
mitosis.
Los dímeros de tubulina polimerizan para formar microtúbulos, que generalmente consisten en 13
protofilamentos lineares ensamblados alrededor de un centro hueco. Se disponen en paralelo. Como
consecuencia, los microtúbulos (al igual que la actina) son estructuras polares con dos extremos
diferenciables. Un extremo "más" de crecimiento rápido y un extremo "menos" de crecimiento lento.
Tanto la α-tubulina como la β-tubulina se unen a GTP (que actúa de forma análoga al ATP unido a la
actina para regular la polimerización). Concretamente el GTP unido a la β-tubulina (NO el α-tubulina-
GTP) se hidroliza a GDP durante o justo después de la polimerización. Ésta hidrólisis del GTP disminuye
la afinidad de la tubulina por las moléculas adyacentes, lo que favorece la despolimerización.
Los microtúbulos sufren un intercambio rotatorio, un comportamiento dinámico en las que las moléculas
de tubulina unidas a GDP se liberan continuamente del extremo "menos" y son remplazadas por
moléculas de tubulina-GTP por el extremo "más". El que un microtúbulo crezca o se acorte viene
determinado por la velocidad de adición de la tubulina respecto la velocidad de hidrólisis de GTP.
Mientras las nuevas moléculas de tubulina unidas a GTP se añadan a mayor velocidad que la hidrolisis de
GTP, el microtúbulo mantiene la caperuza de GTP en su extremo "más" y el crecimiento del microtúbulo
continua. Sin embargo, si la velocidad de polimerización decrece, el GTP fijado en el extremo "mas" será
hidrolizado. Es entonces cuando la tubulina asociada a GDP se disociará, dando lugar a un acortamiento
del microtúbulo.
DROGAS
ORGANIZACIÓN DE MT
Los mictoúbulos se extienden a partir de un centro organizador de microtúbulos, al que se anclan los
extremos "menos". En las células animales, el principal MTOC es el centrosoma, que se localiza junto al
núcleo. El centrosoma sirve como lugar de inicio del ensamblaje de los MT que crecerán a partir del
centrosoma hacia la periferia celular. Los centrosomas de la mayoría de las células animales están
constituidos por centriolos. Los centriolos son estructuras cilíndricas constituidas por nueve tripletes de
microtúbulos. Aunque los centriolos probablemente sean los precursores de los cuerpos basales, parece
ser que NO son indispensables para el funcionamiento del centrosoma (huso mitótico). Los centriolos no
parecen ser necesarios para el ensamblaje o la organización de los MT. (en vegetales y algunas células
animales NO están presentes).
Otro centro organizador de MT son los crepúsculos basales en cilios y flagelos. Lo veremos más adelante.
La inestabilidad dinámica por el extremo "más" viene dada por la concentración crítica de tubulina y por
la disponibilidad de GTP. Si el MT no crece, éste entra en una fase de depolimerización. La caperuza de
GTP es muy importante.
La β-tubulina ligada a GTP se puede hidrolizar a GDP. Los dímeros que se unen al microtúbulo son de
GTP. Al interior del MT los dímeros se estabilizan y se hidrolizan. A la parte más externa encontramos
GTP que es la forma más estable. Si no hay polimerización el GTP más exterior pasa a GDP y empieza la
inestabilidad y la consecuente despolimerización.
EXPERIMETO.
Incubamos con dímeros de tubulina-biotina. Existe una proteína que tiene afinidad por la biotina
(=marcador)(=AVIDINA). Si el MT crece tenemos una alta concentración de Tubulina-Biotina. La
avidina está marcada con fluorescencia y se engancha a los extremos que crecen.
Para ver aquellos que NO crecen tenemos Ac contra tubulina y NO tubulina-biotina. Entonces veremos
los MT estables; que no crecen.
El extremo "mas" también se puede estabilizar temporalmente y la tubulina de los MT puede sufrir
maduraciones reversibles.
* MAP'S Estructurales:
Son proteínas que se fijan a los microtúbulos e incrementan su estabilidad .Dichas interacciones permiten
a la célula estabilizar los microtúbulos en localizaciones definidas y son un mecanismo para determinar la
forma y la polaridad de la célula. Controlan la vida media de los microtúbulos así como su alargamiento y
pueden formar puentes de enlace cruzados.
La unión de las MAP's al citoesqueleto controla los microtúbulos. Si se fosforila (o desfosforila) pierde la
capacidad de estar unida. La acción de fosforilar o desfosforilar la llevan acabo unas MAP's kinasas. Las
MAP kinasas al fin y al cabo son las que regulan la función del citoesqueleto.
A su vez las MAP kinasas están reguladas por señales de receptores, AMPc, PIP, PI3 que acaban
modificando a las MAP kinasa y éstas activan o inactivan las MAP's favoreciendo o desfavoreciendo la
polimerización de microtúbulos.
* MAP's Motoras
La quinesina y la dineína son prototipos de proteínas motoras de los microtúbulos, se mueven a lo largo
de los microtúbulos en direcciones opuestas. La quinesina se mueve hacia el extremo "mas" y la dineína
hacia el extremo "menos"
QUINESINA
La quinesina es una molécula de aproximadamente 380 Kda constituida por 2 cadenas pesadas (120 Kda
cada una) y 2 cadenas ligeras (64 Kda cada una). Es un dímero de 4 cadenas. Las cadenas pesadas tienen
regiones largas de α-hélice que se enrollan una alrededor de la otra en una estructura de hélice enrollada.
Los dominios de cabeza globular amino-terminales de las cadenas pesadas son los dominios motores de la
molécula: se unen tanto a los MT como a ATP, cuya hidrólisis proporciona la energía necesaria para el
movimiento. (Semejante a la miosina lo cual evoca a que provienen de un ancestro común).
La zona de la cola está constituida por cadenas ligeras unidas a los dominios carboxilos- terminales de las
cadenas pesadas. Esta región es la responsable de la unión a otros componentes celulares (vesículas,
etc...) que se transportan a lo largo de los MT por la acción de los motores de quinesina. Presentan 34 aa
modificados que determinan una unión específica a aquellas estructuras que hay que transportar.
F(X)
La función es transportar el "carrier". Están separados 5nm los lugares de unión; (5-8nm deformados). Se
desplaza por un protofilamento solamente. Por cualquier de los 13; pero seguro que si engancha uno; ya
no se suelta. Necesita ATP para enlazarse.
FAMILIA DE LA QUINESINA
DINEINA
La dineína es una molécula extremadamente grande (2.000 KDa), que está constituida por dos o tres
cadenas pesadas (500 Kda cada una) unida con un número variable de polipéptidos ligeros e intermedios,
que oscilan entre 14 y 120 Kda. Al igual que la quinesina, las cadenas pesadas forman dominios
globulares motores de unión a ATP que son los responsables del movimiento a lo largo de los MT.
La quinesina convencional y otros miembros de la familia que se dirigen hacia el extremo "mas,
transportan su carga hacia la periferia celular, mientras que las dineínas citoplasmáticas se dirigen hacia el
extremo "menos" transportando los materiales hacia el centro de la célula.
Los microtúbulos y las proteínas motoras asociadas colocan los orgánulos con membrana en la célula
(como AG, RE, lisosomas, mitocondrias). Los fármacos que depolimerizan los mictrotúbulos, provocan
que el RE se retraiga hacia el centro de la célula, lo que indica que se requiere la asociación con los
microtúbulos para mantener el RE en su estado extendido. Requiere la acción de quinesina, la cual estira
del RE a lo largo de los microtúbulos en dirección "más" hacia la periferia celular.
Por otro lado, la dineína citoplasmática interviene en la colocación del AG (Aparato de Golgi). El AG se
localiza en el centro de la célula, cerca del centrosoma. Si los microtúbulos se disgregan, bien por un
fármaco o debido a que la célula entra en mitosis, el AG se rompe en vesículas que se dispersan por todo
el citoplasma. Cuando los microtúbulos se vuelven a formar, el AG también se reensambla y parece ser
que las vesículas de Golgi son transportadas al centro de la célula.
CILIOS Y FLAGELOS.
Los extremos "menos" de los microtúbulos de cilios y flagelos están unidos a un cuerpo basal que tiene
una estructura similar a los centríolos (9 tripletes de microtubulos). Los cuerpos basales sirven para
iniciar el crecimiento de los microtúbulos al axonema, así como para anclar los cilios y los flagelos a la
superficie de la célula.
Los movimientos de los cilios y flagelos se producen por el deslizamiento de los dobletes externos de los
microtúbulos uno respecto a otro, impulsados por la actividad motora de la dineína axonémica. La base de
la dineína se une al microtubulo de 13 protofilamentos (el completo) mientras que la cabeza se une al
microtubulo de 10 protofilamentos. Cuando la dineína se desplaza al extremo "menos" hay una curvatura
del microtubulo ya que están unidos por puentes de nexina. Sino resbalarían de manera normal. La nexina
hace que se doblen, lo que constituye la base del movimiento de cilios y flagelos. Tiene que haber una
sincronización total. (Proceso poco estudiado).
FILAMENTOS INTERMEDIOS
Compuestos de proteínas variables Presentan un dominio central y otro globular. Se organizan en
dimeros, tetrámeros, filamentos. Tienen un diámetro de 10 - 11 nm. Cada tipo de tejido o tipo celular
presenta sus propias proteínas.
Presentan dominios centrales en hélice α bastante conservados, los extremos son globulares y más
variables. El tetrámero es antiparalelo, el filamento NO está polarizado.
NO se asocia ni hidroliza GTP o ATP. No consume ATP al polimerizar.
Su función es mecánica. Refuerza las cells, asocia tejidos que deben resistir tensiones.
También sirven de puntos de asociación con otras estructuras de la célula. Lugares de contacto entre las
cells:
- Contacto de adhesión: Ligados a actina.
-Desmosomas / Hemidesmosomas: Ligan membranas vecinas
DOMINIOS
* GLOBULAR: son dominios variables. Generalmente son secuencias largas (55 KDa)
Dan variedad a las proteínas (interacción con estructuras vecinas). Este dominio es importante para el
ensamblaje de los filamentos y a veces sobresale de la superficie de los filamentos.
ENSAMBLAJE
* DIMERO: Una hélice α se "enrosca" con otra hélice α. Presentan una orientación paralela. Puede ser un
mono / hetero / homopolímero. Si es hetero son de familias diferentes.
*TETRAMERO: Es una agrupación de dímeros. Se disponen de manera antiparalela lo que asegura unos
filamentos NO polarizados.
N |-------------------| C
C |--------------------| N
*FILAMENTO: Unión más larga, dan más resistencia. Los filamentos presentan 60nm. Se asocian
lateralmente.
NOTA: Primero se forman los dímeros en los cuales los dominios de eje central de 2 cadenas
polipeptídicas están enrollados uno alrededor del otro formando una estructura de espiral enrollada (tipo
coiled - coil) (Similar a las cadenas pesadas de miosina)
Los dímeros se asocian de un modo escalonado antiperalelo para formar tetrámeros que se ensamblan
extremo con extremo para formar protofilamentos. (NO polarización)
El ensamblaje de filamentos requiere interacciones entre los tipos específicos de proteínas de filamentos
intermedios. Por ejemplo, los filamentos de queratina siempre se ensamblan a partir de heterodímeros que
contienen un polipéptido de tipo I y uno de tipo II. Por el contrario, las proteínas del tipo III pueden
ensamblarse en filamentos constituidos por un único polipéptido (vimentina) o constituidos por dos
proteínas de tipo III diferentes (vimentina-desmina)
Los filamentos intermedios suelen ser más estables que los filamentos de actina o los microtúbulos y NO
exhiben el comportamiento dinámico asociada a la poly/despolimerización. Sin embargo las proteínas del
filamento intermedio suelen ser modificadas por fosforilación, que puede regular su ensamblaje y
desensamblaje en la célula.
Los filamentos intermedios tienen un diámetro de 10 nm. A diferencia de los filamentos de actina y de los
microtúbulos, los filamentos intermedios NO están directamente implicados en los movimientos
celulares. Parecen desempeñar básicamente un papel estructural proporcionando resistencia mecánica a la
célula y tejidos.
Afegim a un cultiu Biotina - Keratina. S'utilitza com a marcador. Incubem amb avidina + cromófor. Ens
indica on está la queratina. Fixem amb formaldheid, que mata peró fixa. A 20 segons la distribució es a
"grumolls". S'intercalen al llarg del filament. Al cap de 4 minuts es tot ja uniforme. Indica que hi ha un
recambi constant.
Mitjançant fotobloqueig. (Els fluorocroms també es gasten) Teñim tot amb fluorocrom e irradiem. Ara no
es veu res a la zona irradiada. Al cap de uns cuants minuts la zona blanquejada torna a tenir rodamina
fluorescent. Aixó es un clar exemple de que hi ha dinamisme.
Mientras que los filamentos de actina y los microtubulos son polímeros constituidos por un solo tipo de
proteínas (actina y tubulina respectivamente), los filamentos intermedios están compuestos por diversas
proteínas que se expresan en distintos tipos de células. Más de 50 proteínas diferentes han sido
identificadas. Hay muchos tipos:
Hay queratinas duras (pelo, uñas) y blandas; constituyen el grupos de las citoqueratinas.
Se encuentran en el núcleo, NO en el citoplasma. Presente en todas las células eucariotas. Hay 3 tipos, A,
B, C. Son filamentos delgados que se unen formando un entramado ortogonal a modo de "malla". La
fosforilación determina la disgregación de la "malla". Tienen la función de controlar la envoltura nuclear
al largo del ciclo celular.
Son filamentos especializados para reforzar la cubierta del núcleo por dentro. Son dinámicos pero NO en
el sentido de poly /despoly. Van cambiando pero NO por los extremos sino por el medio. Son dinámicos
porque al dividirse una célula los filamentos nucleares se desorganizan. Después se vuelven a asociar en
las células hijas.
MATRIZ EXTRACELULAR
Son proteínas que rellenan los espacios entre las células. Es lo que se denomina tejido conjuntivo. Piel /
cartílagos / Dermis, etc.... la propia célula produce esta matriz extracelular.
Encontramos:
* FIBRONECTINA: molécula grande 450 Kda. Dímero con 1 puente di-S Fibro-nectina (unión de fibras)
Hay muchos elementos. Forma soluble / insoluble en sangre.
Tiene una infinidad de dominios. Hay una secuencia llamada RGD (Arg-Gly-Asp) que es la responsable
de la unión de la superficie de la célula, en contactos locales.
Dicha secuencia RGD reconoce integrinas. La fibroncetina reconoce colágeno, RGD, fibrina i GAG's. La
fibronectina es como un circunflejo ( ^ ) Cunado se rompe se forman monómeros / \ .
Presente en la cascada de cicatrización (=Opsonicación), en el desarrollo embriológico, en la unión,
expansión y migración de células.
Alteraciones en esta molécula produce malformaciones en S.N, cardíacos incluso puede ser letal para el
embrión.
* LAMININA: principal componente de las láminas basales (junto con el colágeno de tipo IV)
Forma un tapiz en forma de red. Asociado en el tejido conectivo (=epitelial cells).
También presentes en células de Schwan, células musculares, etc...
La forma de la laminina es una cruz ( T ). Es un heterodímero.
Formada por una cadena α (hay 5 tipos) , una cadena β (hay 3 tipos) y una cadena γ (hay 2 tipos). Solo
se conocen 11 de todas las que hay. La más común es la Laminina - 5 (α3 β3 γ2 ).
Se une también a GAG's, colágeno, heparina, integrina lo cual quiere decir que presenta el triplete RGD.
Toda glucoproteína de la matriz extracelular que tenga RGD se une a integrinas. GRAFICO
LAMINAS BASALES
Lamina fina dispuesta en red. Presente en epitelios, cell.schwan, músculo, etc.. presentan diferente
organización en cada uno de estos diferentes tejidos.
Sirve para soporte físico de cells, control del desarrollo, función de filtro en riñón, permiten la migración
de sangre hacia zonas de inflamación, intervienen en la formación de metástasis, etc...
Los constituyentes principales son, colágeno IV, laminina, perlecano (proteoglucano).
C) Glucoaminoglycanos (GAG's)
Los gag son cadenas poliméricas de disacáridos de repetición (80 - 200 residuos) . Su función es la de
rellenar espacios.
Si se unen covalentemente a proteínas se forman los llamados proteoglucanos.
Alteraciones en los genes que codifican para estos GAG's originan enfermedades graves como el
"gargolismo", provoca fallos en determinados órganos, son enfermedades con consecuencias altamente
fenotípicas.
El ácido hialurónico es el más importante. Potencia la integridad estructural de la matriz extracell. Sirve
también para la señalización de proliferar o migrar. No está sulfatado, sirve de elongación en la MP una
vez sintetizado.
Este ácido hialurónico está fuertemente relacionado con el cáncer. Altos niveles de AH se asocian con
diversos tipos de cánceres humanos.
AH promueve la proliferación y reduce la diferenciación. También promueve la migración celular, la
invasión.
Una sobre-expresión de HAS (hialurato sintasa) induce el crecimiento del fibrosarcoma y carcinoma de
próstata.
Alteraciones de las interacciones endógenas del AH inhiben crecimiento, invasión y metástasis de varios
tipos de tumores "in vivo".
PROTEOGLUCANOS
Se forma de una proteína central ( o núcleo) que se adhiere a GAG's. Estos GAG's representan un 95 %
del peso molecular del proteoglucano. Hay un tetrasacárido que forma un link de unión entre el GAG y el
núcleo proteico. Este tatrasacárido suele ser NP - xilosa - 2 galactosas - Ac.glucorónico - GAG.
Las funciones de los proteoglycanos son estructurales. Son el componente estructural de las laminas
basales. (perlecano). De tejidos como el cartílago. También realizan funciones de receptor y de
transducción de señal.
Algunos proteoglucanos como el agrecano interaccionan con el ácido hialurónico para formar grandes
complejo de la matriz extracell.
Los proteoglucanos son capaces de reclutar moléculas de ligando pero NO de generar una señal. Aug
Aumentan la concentración de un ligando localmente y hacen que el receptor se estimule con más
eficiencia.
ADHESION MOLECULAR
Adhesión molecular: Conjunto de relaciones físicas que establece una célula con su entorno con otras
células o con la matriz extracelular. Para que la cell sea funcional precisa estar adherida; si no lo está NO
será funcional o morirá. (Caso de las cell de la glándula mamaria, necesitan estar polarizadas para
funcionar). (=Transwell: Dispositivo para cambiar la polaridad de la célula).
- INTEGRINAS
Las integrinas constan de 2 subunidades una α y β. La α (120 - 180 Kda) y β (90 - 110 Kda). La unión α
β determina la especificidad. Hay más de 20 diferentes. Se han encontrado 18 α y 8 β. Esto representa
muchas combinaciones.
Las integrinas son glucoproteinas. Es un heterodímero. El dominio Aα (de la subunidad α) reconoce
proteínas de la matriz extracelular. Es como una pinza. Si no esta presente este dominio entonces se
reconoce mediante el dominio Aβ (de la subunidad α).
Diferentes integrinas actúan con un mismo ligando; o diferentes ligandos. En diferentes tejidos producen
acciones diferentes también. (Hay muchas combinaciones posibles).
Hay una placa de adhesión entre la integrina y el citoesqueleto (ya puede ser actina o FI). Cuando se
activan hay una reorganización de la célula.
Las integrinas median 2 tipos de uniones estables en las que el citoesqueleto se fija a la matriz
extracelular.
* Adhesiones focales: Los haces de filamentos de actina se anclan a las subunidades β de la mayoría de
las integrinas mediante asociaciones con otras proteínas, incluyendo α-actina, talina y vinculina.
Las fibras de estrés (que son haces de filamentos de actina entrelazados por α-actina) se unen al dominio
citoplasmático mediante asociaciones complejas en las que intervienen un cierto número de de proteínas
como talina, vinculina y otras más.
Por la cara exterior la integrina esta asociada a la fibronectina.
NOTA: Hay un tercer tipo de contacto cell-sustrato que se considera un tipo de adhesión focal un poco
diferente. Es el llamado contacto focal. Dicho contacto une la célula con la matriz extracelular
directamente mediante la integrina.. Directamente al vidrio. Vinculina más actina.
La organización de los filamentos viene inducida por una GTPasa de la familia Rho. Se llama Rac.
La primera que se activa es la FAK (focal adhesión kinasa). Activa las proteínas de adhesión o los
contactos focales. Hay un cluster. Se unen los filamentos de actina (=forman fibras de estrés).
Las integrinas están unidas a la talina de manera antiparalela. CN-NC. Están unidas a vinculina y a fak
también. Cuando esta cambia la vinculina también hay una reorganización total. Se activan proteínas de
señal. Es un proceso muy complejo (Símil del dominó chino).
Las integrinas tocan de todo: regulan proteínas, cambios de señal, cambios del citoesqueleto...de todo..!!
Si se rompe una subunidad citoplasmática están totalmente en el estado de máxima afinidad. Se entendió
como unas tijeras. Hay un complejo activador de integrinas IAC (suposición). Se observó que en todas
ellas había ciertos aa pauta. Se hicieron experimentos de mutagénesis (Problema 13)
Se observó que mutaciones puntuales en la región bisagra de la subunidad αβ induce cambios de afinidad
al ligando. (=Conclusión xunga).La FAK es el concepto de IAC. Se activa la FAC (=fosforilación en Tyr),
cambia de configuración la integrina; es decir, se activa, hay cambio de cationes MIDAS. (Ca +2 - Mg +2 )
y se reconoce al ligando. Es entonces cuando la señalización se da. Cuando el ligando entra hacia dentro y
la cell toma conciencia de lo que hay. (outside - in).
* NOTA: Uniones Ig-integrina y Ig- proteglucano de tipo heparan. Son las 2 excepciones de unión
heterofílica que presentan las Ig.
- SELECTINAS
Hay 3 tipos:
NOTA: En vegetales las lectinas reconocen residuos de glúcidos. Pequeñas regiones intracelulares.
Encontramos dominios EGF. Es un lectina - like domain.
Este dominio de lectina reconoce azúcares. Tiene que ser un tetrasacárido. Es: Ac.siálico + Galactosa +
N-Acetilglucosamina + Fucosa. (=Sial.lil - Lewis).El dominio de lectina reconoce esto. Sirve para activar
integrinas.
"RODAMIENTO DE SELECTINAS"
Uno de los papeles claves de las selectinas es iniciar las interacciones entre los leucocitos desde la
circulación a los lugares de inflamación tisular. Las selectinas median la adhesión inicial de los leucocitos
a las células endoteliales. Se pegan y se despegan. Van rodando !!! Tras esto se forman adhesiones más
estables, en las que integrinas de la superficie de los leucocitos se unen a moléculas de adhesión cell (I-
CAM). (=Diapenesis) Los leucocitos firmemente sujetos son capaces de penetrar la pared de los capilares
y entrar al tejido circundante, migrando entre las células endoteliales.
- CADHERINAS
Tienen 2 características:
- Expresión Diferencial
Así que se forma el tejido se empiezan a expresar. Esto es esencial para la diferenciación.
-Adhesión Cuantitativa
Cuanta más cadherina hay también es específico. Células con muchas cadherinas se "juntan" con células
con muchas; y células con pocas se "juntan" con células con pocas.
Las cadherinas presentan un dominio externo con 5 repeticiones de tipo tándem. En la parte más externa
hay un triplete de aa. (H-A-V). (Muy importante). El dominio intracelular carboxi está unido a cateninas.
Es aquí donde encontramos los filamentos de actina.
- CATENINAS
La catenina β una vez fosforilada por una enzima ya no sirve. Va al proteosoma donde será degradada vía
ubiquitinización. La enzima se activa con receptores Tyr Kinasa. Si se inhibe la acción de la enzima
entonces la catenina β NO estará fosforilada. Normalmente está fosforilada.(MIRAR MEJOR)
UNIONES CELULARES
Modificaciones especializadas de la membrana plasmática entre 2 células vecinas. Hacen función de
anclaje, adhesión y reconocimiento (=señalización). Se clasifican según la superficie en zónulas, fáscias,
máculas.(Ver grafico)
Impermeabilizan la cell.
Función de barrera. Cinturón.
Presentes en epitelio intestinal, sistema urinario, riñones, etc...
Polarizan la cell. Bloquean el movimiento de proteínas lateralmente entre 2 cell vecinas.
Varias proteínas involucradas en su formación.
COMO SE FORMAN ?
Forman un "cosido". Polimerizan y hay como puntos de unión de membarana plasmática de células
vecinas. (=Forman un cinturón) Bloquean el paso intracelular; NO hay paso de moléculas.
Si hacemos un corte mediante criofractura encontramos Ocludinas, Claudinas, JAM
Forman unas 4 hélices transmembrana. Forman 2 loops extracelulares. En la cara del citoplasma
encontramos el extremo N-Terminal y el C-Terminal.
Claudinas: Forman loops diferentes, se unen las subunidades grandes con las grandes y pequeñas con
pequeñas. (Complementariamente tb), se unen a actina. (Zónula Ocludens). Las JAM también
Ocludina: Co-polimeriza con las claudinas. Solo existe paso extacelular. Algunas veces hay trasnporte
basolateral.
-Desmosoma: Unión con filamentos intermedios. Forman un disco que soporta el estrés mecánico (p.e: en
encías, piel, etc...). La placa de adhesión se une a los tonofilamentos (FI = citoqueratina) Las proteínas
que forman el disco son: Placaglobulinas y Desmoplaquina.
Las cadherinas asociadas son: Desmogleínas y desmocolinas. (cadherinas desmosomales)
Aparecen en la fase embrionaria.
-Hemidesmosoma: Unión con filamentos intermedios. Adhesión de células epiteliales a lámina basal. Hay
placa de adhesión que forma el anclaje con los tonofilamentos. Aparece asociada con la integrina α6 β4 .
NOTA COOPER: Los desmosomas son uniones entre células adyacentes, en las que contactos cell-cell
están mediados por proteínas transmembrana relacionadas con las cadherinas. En al cara citoplasmática,
los desmosomas se asocian con una placa densa característica de proteínas intracelulares, a la que se
anclan los filamentos de queratina. Estos anclajes están mediados por la desmoplaquina, un miembro de
una familia de proteínas denominada plaquinas que unen filamentos intermedios y los vinculan a otras
estructuras celulares.
Los hemidesmosomas son uniones morfológicamente similares entre las células epiteliales y el tejido
conectivo subyacente, en las que los filamentos de queratina se unen a las integrinas a través de otras
proteínas de la familia de las plaquinas. La plectina.
Los desmosomas y los hemidesmosmas unen los filamentos intermedios a regiones de contacto de manera
similar a como se une el citoesqueleto de actina a la membrana plasmática en las uniones adherentes y en
las adhesiones focales.
La plactina además de unirse a FI se puede unir a filamentos de actina, y a microtúbulos por lo que puede
proporcionar puentes entre estos componentes del citoesqueleto dando estabilidad mecánica a la célula.
La proteína en cuestión es la conexina. Se agrupa formando complejos. Forma una conexión. Una especie
de "tubito" . La cell vecina también forma éste "tubito". Estos tubitos se juntan y se permite el paso de
citoplasma entre éstas células. Pasan pequeñas moléculas como H2O, y otras cosas.
SEÑALIZACIÓN CELULAR
El mecanismo básico requiere un ligando (=señalizador) que se une a un receptor que convierte la señal
extracelular en una señal intracelular (Transducción + Molécula efectora)
Transducción: Preséncia de una señal extracelular produce cambios en el estado intracelular sin que la
señal pasa a través de la membrana.
Son 6 etapas:
CARACTERÍSTICAS
Moléculas señalizadoras actúan a diferente distancia en el organismo. Los receptores tienen mucha
especificidad por un determinado ligando.
Hay 4 tipos:
Una respuesta suele estar asociada a muchas señales. Las respuestas son múltiples, genéticas, reguladoras,
etc...
El mismo receptor en diferentes tejidos i/o diferentes receptores en el mismo tejido producen respuestas
diferentes.
4 Tipos de receptores.
- Ion chanel
- Membrana bound enzyme
- G-protein
-intracelular.....
CANALES IONICOS:
- Sinapsis SNC
-NT
-Gradiente electroquímico --> Proteínas de membrana
- Ca+2 : Altera muchas enzimas. Se considera un 2º mensajero.
- Conductividad de iones. (Na + , K+ , Ca+2)
PROTEINA G
La unión del ligando al dominio extracelular de estos receptores induce un cambio conformacional que
permite al dominio citosólico del receptor unirse a una proteína G, la cual se disocia del receptor y
transmite la señal a una diana intracelular, que puede ser una enzima o un canal iónico.
La subunidad α se une a los nucleótidos de guanina, que regulan la actividad de la proteína G. En el
estado inactivo, α se une al GDP formando un complejo con β y γ . La unión estimula la liberación del
GDP y su intercambio por GTP. La subunidad α unida al GTP, se disocia del complejo βγ . Tanto la
subunidad α unida a GTP como el complejo βγ, interaccionan con sus dianas para dar lugar a una
respuesta.. La subunidad αse inactiva por la hidrólisis del GTP unido a ella, de tal manera que se inactiva
(α - GDP) y se reasocia con el complejo βγ, quedando así listo para un nuevo ciclo.
*NOTA: La toxina del cólera no permite la hidrólisis de GTP - α. Las células no paran de secretar H2O.
Muerte por deshidratación. Formación de "excrementos aquosos".
REGULACIÓN
FOSFOLIPASA C (PCL)
FOSFATIDIL INOSITOL ( PIP2 ) -------> IP3 se une a RER citosol = aumenta Ca+2
DAG va a activar las protein quinasa C (Junto cn las Ca+2 del
IP3)
Las Protein kinasas C se activan ya sea por Ca+2 , DAG o por ambos
EFECTORES 2º MENSAJEROS
- Sufren autofosforilación
- Transfieren ATP a Tyr de otras proteínas
- Activan proteínas RAS
El receptor EGF actúa como una proteína tyrosina - kinasa, se postuló que la fosforilación de las tirosinas
de la proteina era un mecanismo de señalización esencial en la respuesta celular a la estimulación por
factores de crecimiento. Se incluyen receptores para EGF, NGF, PDGF, insulina y más factores de
crecimiento.
Estos receptores comparten una estructura en común: un dominio N-.term extracelular de unión al ligando
y otro dominio citosólico C-terminal con actividad proteína-tyrosina kinasa.
La unión del ligando al dominio extracelular de estos receptores activa el dominio quinasa citosólico,
dando lugar a la fosforilación del propio receptor (=AUTOFOSFORILACION) y de las proteínas diana
intracelulares, que propagan la señal indicada por el factor de crecimiento.
El primer paso del proceso de señalización en la mayoría de los receptores proteina-tirosina kinasa és la
dimerización del receptor inducida por el ligando. La dimerización conduce a la autofosforilación; las dos
cadenas se fosforilan la una a la otra.. Esta fosforilación supone:
- incrementa la actividad proteína kinasa del receptor
- genera sitios de unión específicos para que otras moléculas señal interaccionen.
Estas moleculas señal se asocian mediante un dominio de la proteína (-SH) que se une a péptidos
específicos del receptor que contengan fosfotirosinas.
PROTEINAS RAS
Las proteínas ras se unen a Tyr kinasa "a secas" a través de proteínas adaptadoras. De adaptadoras hay
muchas, hay sitios de reconocimiento SH2 y SH3 .
Las más comunes son : GTP, IP3, PLC, CAM's.
El 30 % de los cánceres está asociado a este tipo de proteínas. Es una proteína monomérica unida a GTP.
GTPasa interruptora. RAS asociada a metabolismo y proliferación. Cambian la expresión génica y la
actividad proteica.
También en la mitocondria.
Hay proteínas que tienen vida media altas y otras cortas. Esto va mediado por proteólisis programada.
(=UBIQUINONA). (=Complejo y proteosoma).
El péptido señal es reconocido por una proteína llamada SRP. Se une e impide la traducción. Sólo libera
la proteína cuando el ribosoma se une a un receptor. Se produce una translocación post-traduccional
El translocador SEC 61 queda allí.
TIPOS DE TRASNPORTE
- Transporte controlado. "Gated trasnporte"
- Transporte transmembrana
- Transporte vesicular. (Saben de donde salen y donde van) "Tráfico vesicular"
EXPERIMENTO:
Hipótesis señal. La señal la lleva la misma secuencia de proteínas
MATRIZ NUCLEAR: Lo que permanece en una matriz histológica después de haber extraído todo lo que
podamos mediante métodos químicos. Gradiente de NaCl, detergente, proteasas, Dnasas, Rnasas. Lo que
queda és la matriz nuclear.
És una malla proteica que sustenta todos estos elementos. Se trata de una malla extremadamente
insoluble; és por eso que no se puede estudiar.
EXPERIMENTO:
Se intenta solubilizar matriz nuclear de pacientes con lupus eritomatoso sistémico. Es
una enfermedad autoinmune. Es un "chollo" para el investigador. El paciente fabrica Ac para
TODAS las proteínas del cuerpo. Hay sonda para todo!!!. Un ejemplo también es la enfermedad
de Croon. Estos pacientes producen Ac que atacan al duodeno. Provocan una oclusión del
intestino. El Croon se reproduce!!.
Se engancha a una proteína llamada DNA topoisomerasa II. Deshace tensiones del DNA. La
matriz nuclear tiene funciones de éste tipo. Hay un conjunto de proteínas implicadas en el DNA,
ya sea para su síntesis, posición, etc...motivos estructurales y funcionales.
Láminas nucleares. Son como filamentos intermedios, siempre anclados a la membrana nuclear. Forman
mallas.
-Fibras.
-Centro fibrilar. Componente con más densidad
-Matriz. Componente granular.
3 de ellos se forman a partir del mismo gen. (28 S, 5'8 S , 18 S). Gen de 13 mil nucleótidos.
EXPERIMENTO.
Hacemos un marcaje con un trazador UTP-35 S. Se incorpora UTP en el RNA que se sintetiza
en el momento .Seguidamente hacemos una autoradiografía. Sumergimos la sección en una
emulsión de plata. (El revelado es en oscuro.) Está bien pensado. (=MIRAR MEJOR).
* NOTA: Conforme más afuera del núcleo más elaborado está el rRNA. Al borde del nucleolo ya está
maduro.
DNAr: Los ribosomas NO tienen DNA. El DNAr es la secuencia del DNA del cromosoma que codifica
para los RNA del ribosoma. El número de copias es alto. (miles). Se encuentra en diferentes cromosomas
en tándem (=sec. NOR). Cada copia forma un RNA de 45 S que es cortado formando los 3 descritos
anteriormente.
* NOTA: Al finalizar la mitosis aparece el centro fibrilar. Aparecen tantos como genes NOR hay. Después
aparece el componente fibrilar denso y posteriormente el punteado de ribosomas. Esto es la manifestación
de un proceso biológico.
- Lado citosólico.
Proteínas citosólicas
- Lado nuclear.
Proteínas fibrosas que se anclan a la lámina nuclear.
En 1 núcleo puede haber una concentración de poros muy alta; de echo en oocitos de Xenopus la
concentración de poros es altísima .Los anfibios se reproducen en el ambiente, por eso el oocito está
cargado de materiales de reserva para el embrión. Todo el alimento lo produce ella.
WGA: Aglutinina del gérmen de trigo. (=inhibe el transporte). Es una lectina. Se une a carbohidratos. Hay
lectinas también en animales. (en plantas muxo!!). Presenta algunas nucleoporinas. Secuencias de
carbohidratos reconocidas por WGA.
También pueden entrar libremente. Las fibrilares de 20 Kda , las globulares de 40 Kda. Transporte activo
para el resto.
*NOTA: Las globulares pasan mejor que NO las fibrilares. Como es eso ??! De echo el complejo hace un
codo. Son dependientes de Ca+2. Cuanto más Ca+2 más se abren.
- Xenopus
- Cultivo celular
- Sistemas libres de cell ("in vitro"). (símil relojero).
El antígeno T grande del virus SV40 no necesita de replicación celular. El mismo se replica.
Aquí vemos que la proteína se va al núcleo. El T grande NO entra nunca al núcleo. Este residuo
de 128 es clave par ala señal; redirecciona al antígeno T grande al núcleo. Esta secuencia es
necesaria y suficiente para que vaya al núcleo.
Para observar donde está el marcado se hace uso de el microscópio confocal el cual sólo ilumina un plano
de la célula. Disecciona la célula por planos.
EXPERIMENTO 1:
Hay algo que compensa los gradientes. Productos solubles que son importantes en el citosol. Es como un
citosol de recreación.
El citosol de Xenopus contiene algo que nos interesa. Separamos el citosol en 2 fracciones, la fracción A
(FrA) y la fracción B (FrB)
* NOTA: la entrada es dependiente de ATP. La FrA se denomina importina. La FrB és una proteína
llamada Ran. La importina NO sufre tantas modificaciones post-traducionales como es de esperar. La
recombinante está activa también.
Hay algo en el citosol que hace que el sistema sea más eficaz. Plantean una hipótesis. Esta estima que en
algún momento hay una unión con la importina.
Se realizó una inmunoprecipitación de Xenopus. Realizaron también un Western Blot.
RECEPTOR NLS
Es citosólico. Son 2 proteínas. Una de 60 Kda, la otra de 90 Kda. La 60reconoce la señal. La de 90 ayuda
(proteína β). La entrada la hace Ran. GTPasa pequeña.
QUE ES RAN?
DIBUJITO!!!
Los RNA's NO tienen mecanismos de salida. La señal la aporta una proteína que se une a ellos.
Cada tipo de RNA (tRNA, rRNA, mRNA, catalítico...) utiliza una ruta distinta; están bien estudiados.
Todos los RNA abandonan el núcleo con proteínas que hacen de puente con otras proteínas distintas.
HIV RETROVIRUS.
El transcrito virial NO puede salir del núcleo. Forma un transcrito más pequeño. Éste sí que tiene una
señal. Abandona el núcleo. Este fabrica unas proteína llamada REV. REV tiene una secuencia NLS. Entra
dentro del núcleo .Tiene 3 señales.
Que entre al núcleo
Que salga del núcleo.
Que procese el RNA del HIV
Se une a una región que se llama de respuesta a REV. (RRE= rev response element). Rev se engancha
aquí. Es exclusiva de los transcitos HIV. Tiene una señal de trasnporte celular. Ahora, pues, tenemos el
transito total que SI que sale. Es ahora cuando infecta. Si rompemos el ciclo este que sólo es exclusivo de
virus tenemos una diana !!! (=Hay que atacar contra aquí). Actualmente existen 3 tratamientos en 1 para
el sida.
PROTEINAS CITOSOLICAS
Como se pliegan las proteínas cuando se hacen? Como se modifican ? Como se degradan?
Entre el 15-20 % llegan a la configuración final sin ayuda. Pero gastan ATP; es mucho mejor ayudarlas.
Hsp= heat shockproteins.
Se expresan con un xoc térmico. Hay que ir con mucho cuidado. Hay que aumentar la temperatura pero
poco. NO hay que llegar a la desnaturalización.
Hsp son ATPasas. Se unen a polipéptidos que NO están totalmente plegados. Los despliega. Se llega a un
estado más abierto para ver si él sólo se puede plegar bien.
Lo que se intenta es evitar que cuando se forma se pliege. Hasta que la proteína NO está totalmente
formada no saltan. Cuando saltan hacen que se pliegen de la forma nativa.
Las chaperoninas forman un barril de 2 anillos. Complejo Gro. Si hay un xoque térmico “groel” pasa de
un estado "tight" a otro "relaxed".Consume ATP.
MODIFICACIOPNES POST-TRADUCIONALES
Facilitan el plegamietno correcto. Se han descrito más de 100 modificaciones. Hay reversibles e
irreversibles.
- Glucosilación: Irreversible. Se añaden hidrocarburos. (Proteoglucanos). Es necesario que primero se una
al proteoglucano y luego a su receptor. Los factores de crecimiento se enganchan y aumentan su
capacidad. Siempre la glucosilación tiene lugar sobre una Ser ó Thr. Tiene 2 finalidades esta
modificación:
Degrada todo lo que está mal. "Data maining" (Rollo asegurançes). Puro trabajo descriptivo. Hay una
discrepancia.
Posición 1 estan muy por debajo de lo esperado. En posición final es más elevado de lo normal.
DIBUJO
Se descubrió que proteínas que tienen aa como Arg, Lys, Phe, Leu, Trp en posición primera; tienen una
vida corta. Si hacemos la prueba y ponemos una actina con un aa de estos en posición primera se observa
que la actina pasa a tener una vida corta. Esto es una señal. Son AA desestabilizantes. !!!
Otra señal son las ciclinas. Son proteínas que se manifiestan al final de cada una de las fases del ciclo
celular. Son de vida corta. Las señales PEST (degradación proteolítica) provocan una vida media/corta.
Las enzimas son E1, E2, E3. La E3 engancha la cola de Ub al sustrato. Las otras dos añaden Ub. Es
lógico pensar que de E3 hay muchas diferentes; y de echo así es. De E3 se conocen unas 30 diferentes.
Cada una reconoce un sustrato diferente.
PROTEOSOMA: 700 Kda Cilindro hueco. 2 sub-unidades de 19 S cada una. Es algo más pequeño que un
ribosoma. Se conocen inhibidores. Cuando falla este proceso hay deficiencias. Pej: Alzheimer. Se
acumulan placas de β-amiloide. Se forma un péptido de degradación insoluble. Normalmente se degrada
bien y ya esta. A veces se acumula en forma de lámina β y forma agregados. Forma placas que son la base
de la patología.
Provoca un tumor benigno. Las células de G0 infectadas tienen la proteína P53 activa. La P53 bloquea la
replicación de DNA. Es un antioncogeno. Reduce la probabilidad de que entren en replicación.
Dicho virus cuando infecta va al núcleo. En el núcleo activa "Early gens" y fabrica E6. E6 es una proteína
de vida media corta; contiene aa desestabilizantes. Tiene mucha afinidad por P53. Desde el momento en
que se crea ya se une formando el complejo E6-P53.
La proteína E3 es la encargada de enganchar la cola de Ub. Viene E3 y a la hora de marcar a E6; marca
alostearicamente a P53. LIADA !!!. La célula entra en replicación. Se ha de dividir. Forma un tumor
benigno.
RETICULO ENDOPLASMATICO
Encontramos 2 orgánulos en la célula. Tienen un aspecto similar dentro de la célula. Son estructuras muy
dinámicas .
El mRNA va a un ribosoma anclado a la RER. La proteína entra hacia adentro. Vía traslocación por poro.
Péptido señal: Van a dentro del RER de una manera muy efectiva y eficaz.
Diferencia de PM. 35 aa del extremo amino. Entra en la ruta de secreción; a estos 35 se les llama péptido
señal.
Microsomas: NO existen "in vivo". Es un artefacto creado. Se producen al lisar la célula. Los aislamos a
través de la centrífuga y de un gradiente de densidad.
EXPERIMENTO 1
Los MR se lavan con salina. Se extrae lo que NO está unido covalentemente. Hay algo en el lavado que
proporciona una síntesis óptima.
Pancreas exocrino= Aumenta fuertemente la síntesis proteica .Contiene también enzimas hidrolíticas,
etc...
Pancreas endocrino= Insulina y glucagón
.
EXPERIMENTO 2
A: sin nada
B: con proteasa
La proteína queda protegida. Si esta fuera como en el caso 2, con la proteasa se degrada. Con SDS se la
come también.
El Translocador de RER és SEC 61. Actualmente hay 70 SEC's. Hay unas 70 fases críticas en el proceso
de secreción de proteínas .En el 3' NO hay codón de paro. El ribosoma queda unido al RER. Se para la
síntesis de manera urgente. (=MIRAR MEJOR)
Mutamos un mRNA y ponemos una Lys (p.ej) con un grupo fosforeactivo. Técnica entrecruzante
(Crosslink). Establece enlaces covalentes. Luego purificamos el mRNA y encontramos todo aquello que
está enganchado a él.
De Rutas SRP hay 2:
La ruta SRP independiente se estudió en el pre-profactor α. Proteínas de levadura que NO tienen péptido
señal. Su síntesis es citosólica. Entra a través de SEC 61. Permanece unida a chaperonas una vez
sintetizada. Estas la presentan a SEC 62-Sec 63. Estas a su vez la presentan a SEC 61 y és ésta última
quien la hace entrar. !!
SRP-Dep NO hay en bacterias; solo en eucariotas. Las SEC 61, 62 y 63 si que hay. (Rollo reminiscéncia)
Se están dejando.!!
En la ruta independiente la proteína entra por chaperonas de dentro del RER. PnP = GRP 98.
*NOTA: Existe la hipótesis del "trinquete térmico". A la que cierta longitud de proteína que entra se une
un chaperona. Ya no sale. Esto consume ATP. Se van uniendo.!!
Existe también la hipótesis de "trinquete cross-bridge". Se une i ella estira de la proteína cambiando su
configuración. Consume ATP. Una vez dentro queda en el lumen o en la membrana.
N C
C N
Adición de glucanos ricos en manosa: N-Glucosilación sobre residuos de Asn - Thr. Siempre tienen la
misma forma
Tunicomicina= No se pliegan bien las proteínas. En Asn la N-glucosilación és muy importante. Hay una
eliminación de 3 glucosas. Ricos en manosa. Ahora abandona el RE (=El último es irreversible). La
proteína se determina si esta bien plegada o NO.
Disulfuro isomerasa ==> Cataliza puentes disulfuro en el interior de RER. Dominios citosólicos NO
tienen puentes di-sulfuro.Solo en el exterior de la célula hay formación de puentes disulfuro.
CONTROL DEL PLEGAMIENTO
SISTEMA SENSOR
Receptor Tyr-kinasa. Se forma el dímero. Si hay un aumento de ??????? No hay dímero. Si se liberan , se
autofosforilan y se dimerizan. !! Al dimerizar-se dan la señal. UFPR
El conjunto de todos los dictiosomas es el AG. Los dictiosomas o cisternas más cercanos al núcleo son las
"cis"; las más exteriores son "trans"
1.- RE
2.- AG
3.- Membrana nuclear.
El AG está próximo al RER. Entre RER y AG hay muchas vesículas. Cada una de las cisternas contienen
diferentes enzimas, las membranas también; cada una presenta su tipo de enzimas. No es lo mismo en
"cis" que en "trans"
Para estudiar esto van muy bien un tipo de proteínas denominadas "spike" (proteína G) de las cubiertas de
ciertos virus.
Se utilizan Criométodos. Si la Temperatura disminuye hay un bloqueo. A 15º C hay vesículas que NO se
pueden unir al Golgi. Se observan vesículas como Coatómeros.
La señal KDEL del extremo C-terminal hace de retenedor. De hecho se cree que es una señal de
retención. Si NO está, la proteína se excreta; NO es retenida.
EXPERIMENTO
Se sobreexpresa una proteína llamada α pero con KDEL. La célula se le escapa bip. Ac contra Bip.
La sobreexpresión de α satura los receptores y se les escapa Bip. Todo se escapa.
Aparentemente la señal está en la secuencia trasnsmembrana transporte hacia el interior del Golgi.
Avanzada = Trans
Atrasada = Cis
Iluminamos una zona marcada (=quemada). Vemos si es móvil o NO. Nos lo indica el tiempo de
regeneración de la fluorescencia.
TRAFICO VESICULAR
Kiss & run
Proteínas que fabrican vesículas
Son proteínas de cubierta que se enganchan y deforman la membrana. Cada proteína tiene sus proteínas
específicas.
Tenemos 6 fases:
1.- Class.
2-. Vesiculación
3.- Desprendimiento
4.- Direccionamineto
5.- Reconociemiento
6.- Fusión
VESICULAS COP I
ARF
Hay 6 ARF. El coatomero es uno de ellos. Madura en un tramo determinado de la ruta de transporte.
Esta GEF se llama Sec 7
ARF en la membrana recluta coatómero. En la vesícula se une a GAP específica (de ARF). Provoca que
GAP se solubilize. El coatómero se libera. La unión de coatómero es dependiente del estado de ARF.
ARF se engancha siempre que de GTP se pase a GDP. Hay que mirar la relación GEF/GAP
VESICULAS COP II
Se aíslan a partir de experimentos de transporte “in vitro·. Son SEC 23 , SEC 24, Sec 13,-Sec 31 que
forman un dímero. Sec 16 también.
La polimerización de estas proteínas forman la cubierta. La entrada está regulada por una proteíina
GTPasa del tipo ARF (Pero NO de la misma familia) Sar 1 tiene su GEF. La GAP específica es SEC23.
La migración NO suele hacer más de una micra. El Golgi está entorno al núcleo. Puede haber entre 190 y
15 micras. La migración és muy corta. Entre RER y el golgi hay compartimentos que reciben el nombre
de compartimentos intermedios del RER.
FORMACION DE AGREGACIONES
Se unen a MT y se desplazan de la cisterna trans a la cisterna cis del Golgi. El ensamblaje es muy similar.
El reconocimiento se hace ya que la vesícula tiene su receptor y busca su complementario. Si hay
reconocimiento se funcionan. Cada sistema tiene su “esnore” vesicular y su “esnore” diana.
(complementaria)
Intervienen 6 elementos:
Snore V
Snore T
Rab: GTPasa pequeña
SNAP 25: Proteína asociada
NSF: N-etilamida. Hace de factor sensitivo
SNAP-γ: Sitio de anclaje
FUNCION DE Rab
Rab actúa sobre un efector que bloquea el Snore T. Esto hace que suelte la protección ; entonces si se
reconocen se fusionan ; si NO se vuelve a proteger. La forma GAP desacopla a Rab y PUM… !!!(Ya
está.) De moléculas GAP hay muchas.
FUSION
Para que se fusionen; los lípidos se mezclan. In vivo es necesario formar un complejo (=poro hidrofóbico)
Trabajo mecánico: Dos proteínas se enrollan excluiendo el agua y se fusionan. Hay proteínas que tiran de
ellas.(Como los virus). Funciones ectoplásmicas. Proteína G.
ENDOCITOSIS
Molécula de hemoglutinina. Estructura de pétalos de flor. Se abren; hay cilindros contráctiles. Aumenta la
hidrofobicidad. En el Ph crítico se abre la cápsula y estas membranas se aproximan y se fusionan.
LISOSOMAS
Mitotraquer ===> Colorante de la mitocondria. (=verde)
El colorante de los lisosomas es rojo. Se observa teñido todo el citosol.
Los lisosomas són estructuras que captan orgánulos (incluso bacterias) y mediante las hidolasas los
degrada. Se los "come".
Tienen 3 elementos:
- Membrana con alta concentración de trasnportadores
- Contienen muchas hidrolasas, proteasas, etc....
- Hidrolasas funcionan con Ph ácido. (Bomba de H+ ) (alta [ ] transportadores)
Tienen aspectos diferentes en función del material a degradar. Existen mucha nomenclatura con respecto
a ellos.
- Fagocitosis: Degrada material extracell enorme!
- Endocitosis: Degrada material extracell de PM bajo!
- Autofagocitosis: Suicidio
- Autofagosoma: En condiciones de stress.
*NOTA: Cuando se degrada a ella misma su masa celular sirve para utilizarla como energia o como
productos (=sustratos).
Las enzimas proceden de AG. Sigen una ruta de secreción. Existen enfermedades genéticas lisosomales.
Afectan a procesos vitales .NO hay un gen que codifique para hidrolasas características. Cuando esto
sucede hay toxicidad. Muerte de tejidos. Hay una enfermedad que consiste en que NO se tienen
hidrolasas. Se llama "i cell desease".
Se añaden fosfatos, en "cis" golgi y en "trans" golgi. Uno reacciona en el "cis"; y el otro en el "trans". El
primero se añade mediante la N-acetil-glucosamina-P-transferasa. Si esta mutado NO se añade manosa en
el 6-P
En el "trans"golgi hay reconocimiento de ésta manosa 6-P y hace que vayan al lisosoma. La primera
enzima la marca como lisosomal!
Hay una mutación en VPS. Lsa proteínas NO llegan al lisosoma. (=es secretada en la forma P2)
Hay tres tipos de células
Es mejor para estudiar todo esto las A. VPS 15 y VPS 34. Se han alterado unos genes que codifican para
una kinasa autofosforilativa y fosforila 34.
Estructura verde; receptor de manosa 6-P. Autofosforila la kinasa VPS 15 y VPS 34 fosforila a
fosfolípidos de la membrana. Se forma una vesícula. "Clusterizan". Se forma una vesícula siempre que
tenga algo para transportar.
EXOCITOSIS
Tramo final de la ruta de secreción.. Hay 2 tipos
- secreción: normal; sin sentido (=constitutiva) como mínimo!
- regulada: Productos que acumulados se almacenan y ahora son secretados para producir un
estímulo. (Secreción a Go-Go).
Todas las células presentan constitutiva. La regulada es muy importante; es un proceso muy dinámico.
La secreción regulada NO es mediante un receptor. Sintetizan un producto y allí alcanza el "trans" golgi y
por agregación se libera!
Toxina diftérica.. Es un dímero. Taca a ef2. Esta es una proteína crítica. La subunidad A es catalítica.
Si ponemos
por un proceso de endocitosis B pasa dentro de la célula; va a la membrana y es a través de B que pasa A.
A se une con ef2; este con ATP y ya está liada!!
CICLE CELULAR.
La célula un cop neix (acaba de fer la fase M) ha de créixer. Fa la fase G1. Si surt del cicle celular diem
que esta en fase G0. Pot sortir de manera temporal com els hepatòcits o per sempre; com es el cas de les
neurones.
Durant G1 la célula viu. Ara doncs, si pasa el punt de NO-retorn que es troba cap al final de la fase G1, ja
no pot tornar enrere. Ara necesariament ha de completar el cicle celular.
Després trobem la fase S on es dóna tota la síntesis de DNA, algunes proteines com MTOC, etc....
Ara ens trobem a la fase G2. Entre la fase S i la Mitosis. Es de preparació, es de creixement. Síntesis
important d'elements que provoquen canvis en la mitosis. Després ve la Mitosis. Es una fase que ja se
sap!
El control del cicle celular el fan les quinases. CDK's. Son dependent de ciclines. En mamifers s'han
estudiat fins a 10 diferents. Reconeixen sustrats i realitzen una cascada de reaccions. Condueixen a la
síntesis de DNA, etc...Provoquen canvis a l'interior de la célula per que es doni el cicle celular.
Regulació:
La regulació la fan les ciclines. Es la subunitat reguladora de l'enzim. Sense un NO hi és l'altre. Si falta la
ciclina NO hi ha activitat quinasa en les CDK's. Les ciclines es sintetitzes i són degradades via
ubiquitinització. La vida mitjana de les ciclines és bastant constant.
CYCLINAS
-D cyclinas
- E cyclinas
Al final de la G1.
Requerida para que toda la fase S vaya perfectamente
Se une a cdk2
- B cyclina
Síntesis al final de S
Forma MPF (=Cdc2- Cyclina B). Este echo marca el final de la fase G2 y comienzo de la fase M
A la metafase hay una degradación (es tan importante la síntesis como la posterior degradación)
- H cyclina
Al comienzo de G1 tiene lugar la síntesis de la cyclina D que se une a CdK4 y a CdK6. Estos complejos
se activan aproximadamente en el 2º tercio de G1 y son responsables de la progresión de la fase G1 y de
la transición a S Además en G1, a la mitad, tiene lugar la síntesis de cyclina E que se une a CdK2; que
junto los anteriores complejos promueve la transición hacia la fase S.
Hacia finales de G1 tiene lugar la síntesis de Cyclina A que se une con CdK2. Este complejo es el
responsable de que la fase S transcurra perfectamente.
En la fase G2, hacia el inicio, se sintetiza la cyclina B,que se une con CdK1; y mientras la cyclina A (ya
sintetizada) se une con la CdK1 también. Estos 2 complejos son los responsables de llevar a la célula a la
fase M.
Para que se produzca la activación del complejo se necesita de CAK. Cuando la cyclina se une a la CdK
ésta sufre un cambio conformacional que provoca que la Thr 160 quede expuesta. CAK actúa a este
nivel. Esta nueva fosforilación provoca una nueva reestructuración de la molécula permitiendo el acceso a
los sustratos.
CAK a su vez está regulada por:
-MAT1: Unión a CAK formando un complejo activador.
-CAKAK: Se produce una fosforilación a nivel de Thr 170 de CAK. Dicha fosforilación la realiza o bien
CdK2-Cyclina A o bien, CdK1-cyclina B
Kap: Fosfatasa inhibidora. Desfosforila el que ha fosforilat CaK. Treu el P de la treonina fosforilada.
Familia INK 4: Formadas por p15, p16, p18 todos los miembros se unen a CDK dependientes de la
cyclina D. CdK 4 / 6. Pueden unirse a la CdK sola y al complejo CdK-cyclina. Si se unen a CdK impiden
la unión a la cyclina; si lo hacen al complejo, provocan la disociación.
INK4: Inhibeixen G1. TGF inhibeix el Cicle celular
* P21: es un producto de p53. Bloquea el G1. El domini de unió es CDK y la regió C-terminal. Inhibeix la
replicació peró NO la reparació.
REGULACION CDK's
QUINASAS INHIBIDORAS
Wee1: En todos los eucariotas fosforila el residuo tyr 15 conservado en todas las CdK. Es una
fosforilación inhibidora ya que dicha tyr está en la región catalítica de la molécula.
Myc 1: En levaduras
Myt 1: Fosforila tyr 15 y también thr 14.
FOSFATASAS ACTIVADORAS
Eliminan los grupos fosfato de las quinasas inhibidoras (Wee 1). Mediante éste mecanismo la célula
puede acumular grandes cantidades de CdK-cyclina inactivas que luego podrán ser activados de golpe.
Las cromátidas hermanas están unidas mientras que las cohesinas sean funcionales. La separasa
proteoliza la cohesina. Hasta que las cromátidas No estén unidas al huso mitótico está inactiva porque
esta unida a una segurina.
Durante dicha transición. Se dan 2 proteólisis:
TRANSICIÓN G1-S
CdK 4 - cyclina D
CdK 6 - cyclina D
CdK 2 - cyclina E
Rb: Proteina supresora de tumors. Retinoblastoma. Participa en el cicle celular. Es una proteina
sagrestadora. Són factors de transcipció.Conecta el sistema de control del cicle celular amb la maquinária
transcripcional. Són capaces de inhibir a moltes proteinas entre las quales está el factor de transcripción
E2F.
Los comlpejos CdK 4/6 -cyclina D fosforilan a Rb y la inactivan. Se libera E2F y la cyclina E se forma.
Todos aquellos estímulos que favorezcan la proliferación celular deben provocar la fosforilación de Rb.
Los que impidan la proliferación deben evitar dicha fosforilación.
És un punt de restricció. Un aument de E2F provoca una gran cascada. Es un bon punt de regulació
FAMILIA E2F
Factors de Transcripció que controlen: C-Myc, E2F, CDK 1, Cyclina A, Cyclina E, etc..Timidina K.
Dispara una cascada dirigida en el cicle celular. És dóna una retroalimentació positiva en el nostre sistema
d'estudi..
Al final de la mitosis s'inactiven les Cyclines - Cdk y es fosfata. Es comená amb G1 altre cop.
DIFERENCIACIÓ
MORT CELULAR
La célula rep moltes informacions del exterior i del interior. Lesions importants fan que la celula programi
la mort. Tot aixó ho regulen bateries de gens. (Gens Proapoptótics / Antiapoptótics)
Tisular homeostátic: la homeostasis és el balanç entre proliferació i apoptosis. Aqeusta relació depén de
les relacions correctes entre la proliferació de la celula, la diferenciació i la mort celular.
* NOTA: Les caspases són les peces centrals acabrán induint la apoptósis. (=Domini CARD, proteases)
PRO-APOPTOSIS
BAX= Membre de la familia. Indueix l'apoptosis. Presenta senyals interns. Dañs en DNA. P53 estimula a
BAX. Aquets estimula al citocrom C i a caspases i ja está!!
P53= "Guardiana del genoma" .És un estímul intrínsec de la célula. Quan aumenta la concentració de P53
s'atura la replicació. El DNA es repara; si no pot ésser reparat s'indueix a l'apoptosis.
Quan hυ irradia el DNA, aquets es trenca. Es fosforila mitjançant p53. Normalment P53 está associada a
MDM2. Es separa al fosforilar-se i es torna activa. (=Factor de Transcripció). Actúa en tota una bateria de
gens (Cyclines, reparació de DNA, i apoptósis) (Bax, fas, NF-KB, potencia l'activitat de les caspases).
Activa tot un conjunt de respostes apoptótiques. Reprimeix PCL2 (=Gens anti-apoptótics). P53 es
degrada per ubiquitinització.
NECROSIS
Es quan hi ha una lesió. Lo primer que es trenca és la membrana plasmática. Es perd el control de tot.Hi
ha una inflamació de la célula, cambia el gradient de ions, etc..els enzims es van malmeten. NO hi ha
cambis en le nucli. Comporta la lisis de la celula i l'alliberament de tot el contingut cap a l'extreior. Afecta
a un grup de célules.
SENESCÉNCIA CÉLULAR
Telómers (Telomerasa) Es divideix sense límits. Compensa l'escurçament. Conté sequéncies TTAGGG
repetides.