Manual Bioquimica Del Nitrogeno

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MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO

Modelo por Competencias Profesionales

TECNOLÓGICO DE ESTUDIOS SUPERIORES DE


ECATEPEC

INGENIERÍA BIOQUÍMICA

MANUAL DE PRÁCTICAS DE LABORATORIO

BIOQUÍMICA DEL NITRÓGENO

QUINTO SEMESTRE

1
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

INDICE

PRÁCTICA No. 1 FIJACIÓN DE NITRÓGENO Y SU 4


IMPACTO EN LA CALIDAD DE LOS
SUELOS

PRÁCTICA No. 2 ASIMILACIÓN DE NITRÓGENO 8

PRÁCTICA No. 3 DETERMINACIÓN DE PUNTO 13


ISOELECTRICO E IDENTIFICACIÓN
DE AMINOÁCIDOS

PRÁCTICA No. 4 METABOLISMO DE PROTEÍNAS 18

PRÁCTICA No. 5 AISLAMIENTO DE DNA 24

PROYECTO 29

ANEXO LISTA DE COTEJO PARA 32


DESEMPEÑO DURANTE LA
PRÁCTICA
RÚBRICA DE EVALUACIÓN PARA 34
REPORTE DE PRÁCTICA
RUBRICA DE EVALUACIÓN PARA 35
PROYECTO

2
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

PRESENTACIÓN

Este manual de prácticas de laboratorio fue diseñado para apoyar el proceso

de enseñanza-aprendizaje de la asignatura Bioquímica del Nitrógeno del cuarto

semestre de la carrera de Ingeniería Bioquímica del Tecnológico de Estudios

Superiores de Ecatepec e integra conocimientos prácticos con habilidades y

destrezas tanto específicas, como genéricas para el ejercicio profesional de tal

manera que contribuya a la formación integral de los alumnos que les permita

desarrollar una mayor capacidad de adaptación a la nueva sociedad de la

información que exige autonomía para pensar, aprender y trabajar.

El principal objetivo es dirigir el trabajo experimental del alumno, dándole

libertad de investigar, plantear y decidir la forma de llevar a cabo diferentes

experiencias de acuerdo a sus intereses, pero siempre dentro del cumplimiento

de los objetivos de aprendizaje.

Con esta forma de trabajo se pretende que el alumno adquiera madurez


académica y desarrolle las competencias que le permitan integrarse de manera
exitosa al nuevo ambiente laboral.

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MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

PRÁCTICA No. 1

FIJACIÓN DE NITRÓGENO Y SU
IMPACTO EN LA CALIDAD DE LOS
SUELOS

4
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

CARRERA (S): Ingeniería Bioquímica


NOMBRE DE LA ASIGNATURA Bioquímica del nitrógeno
NO. CRÉDITOS SATCA DE 2
PRÁCTICA
NOMBRE(S) DE LA(S) Metabolismo del nitrógeno
UNIDAD(ES) DE APRENDIZAJE
TEMA(S) Ciclo del nitrógeno (fijación de nitrógeno)
COMPETENCIA A Competencias Específicas:
DESARROLLAR Comprender, identificar y analizar y relacionar el
metabolismo de aminoácidos.
Competencias Genéricas:
Sistémicas
• Aplicar los conocimientos a la práctica
• Habilidades de investigación
• Capacidad de aprender (aprender a aprender)

Interpersonales:
• Capacidad crítica y autocrítica
• Trabajo en equipo
• Habilidades interpersonales

Instrumentales:
• Análisis y Síntesis
• Organización y planificación
• Conocimientos generales básicos
• Conocimientos básicos de la profesión
• Comunicación oral y escrita (lengua propia)

NO. DE PRACTICA 1 DURACION 4


(HORAS)

5
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

ANTECEDENTES
Fijación de nitrógeno.
El nitrógeno es un elemento indispensable para la vida, forma parte de las principales
biomoléculas de todos los seres vivos. Es también uno de los elementos más abundantes
de la Tierra, pues en su forma gaseosa (N 2) constituye 78% de la atmósfera. El nitrógeno
puede llegar al suelo gracias a los aportes de materia orgánica y a la fijación bacteriana a
partir del aire. Sin embargo, la cantidad de nitrógeno presente en muchos suelos es
escasa, debido a su propia dinámica y a su ciclo biogeoquímico. La disponibilidad de
nitrógeno es el factor que limita la fertilidad de la mayor parte de los suelos

PREGUNTA GENERADORA
¿La fijación de nitrógeno es igual en todos los tipos de suelo?

ACTIVIDADES A DESARROLLAR
Previas:
1. Investigación referente al ciclo del nitrógeno haciendo énfasis en el proceso de fijación
de nitrógeno.
2. Resolver los siguientes cuestionamientos:
a) ¿Cuáles son los tipos de fijación de nitrógeno y cuál es la más frecuente?
b) ¿Qué importancia tiene la nitrogenasa y cuál es su papel en la fijación del
nitrógeno?
c) ¿Qué factores afectan la actividad de la nitrogenasa?
3. Investigación acerca de técnicas de determinación de nitrógeno total
4. Realizar diagrama de bloques del método o técnica a utilizar
Durante la práctica:
1. Montaje y/o preparación de aparatos y/o equipos
2. Puesta en práctica de la o las técnicas
3. Determinación de nitrógeno total en diferentes muestras de tierra.

EVIDENCIAS A GENERAR EN EL DESARROLLO DE LA PRACTICA

1. Registro de resultados obtenidos para cada una de las muestras de acuerdo a la


siguiente tabla.

Muestras de tierra

Cantidad de
nitrógeno

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MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

INSTRUMENTO DE EVALUACION (RUBRICA, LISTA DE COTEJO, ETC.)

1. Se empleará una lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno durante el
desarrollo de la práctica (60% de la evaluación total. Ver anexo)

2. Se empleará una rúbrica para evaluar el reporte de la presente práctica.(40% de la


evaluación total. Ver anexo)

BIBLIOGRAFIA
1. Horton R., Moran L., Ochs R., Rawn J., Scrimgeour K. 1995. Bioquímica. Prentice
Hall-Hispanoamericana, S.A. México.
2. Lehninger AL, Nelson, DL. Principios de bioquímica. 4a. ed. Barcelona: Ediciones
Omega; 2005
3. Mathews C., Van Holde K., Ahern K. Bioquímica. Addison Wesley, tercera edición.
Madrid 2002.
4. Voet Donald, Voet Judith G. Bioquímica. 3a. ed. Panamericana. 2006

FIRMAS

M. en C. María Yazmín Soria Chico M. en C. Consuelo Martínez Ruiz


Responsable Colaborador

I.B.Q. Julio César Martínez Tellez Dra. María Isabel Neria González
Colaborador Colaborador

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MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
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PRÁCTICA No. 2

ASIMILACIÓN DE NITRÓGENO

8
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
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CARRERA (S): Ingeniería Bioquímica


NOMBRE DE LA ASIGNATURA Bioquímica del Nitrógeno y Regulación Genética.
NO. CRÉDITOS SATCA DE 2
PRÁCTICA
NOMBRE(S) DE LA(S) Metabolismo del Nitrógeno
UNIDAD(ES) DE APRENDIZAJE
TEMA(S) Ciclo del nitrógeno (asimilación)
COMPETENCIA A Competencias Específicas:
DESARROLLAR Comprender, identificar, analizar y relacionar el
metabolismo de aminoácidos.
Competencias Genéricas:
Sistémicas
• Aplicar los conocimientos a la práctica
• Habilidades de investigación
• Capacidad de aprender (aprender a aprender)
• Habilidad para trabajar en forma autónoma.

Interpersonales:
• Capacidad crítica y autocrítica
• Trabajo en equipo
• Habilidades interpersonales

Instrumentales:
• Análisis y Síntesis
• Organización y planificación
• Conocimientos básicos de la profesión
• Habilidad para buscar y analizar información
proveniente de fuentes diversas
• Comunicación oral y escrita (lengua propia)
• Toma de decisiones

NO. DE PRACTICA 2 DURACION 4


(HORAS)

9
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
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ANTECEDENTES

Asimilación del Nitrógeno


La asimilación constituye una parte importante del ciclo del nitrógeno, es el paso siguiente
a la fijación y se refiere a la incorporación del nitrógeno al metabolismo de los diferentes
organismos. Los primeros actores en la asimilación del nitrógeno son las plantas, las
cuales a través de sus raíces absorben el amoníaco (NH3) o el nitrato (NO3 -), e
incorporan el nitrógeno en proteínas, ácidos nucléicos y clorofila. Cuando los animales se
alimentan de vegetales consumen compuestos nitrogenados vegetales y los transforman
en compuestos nitrogenados animales.
Cuando dichos organismos se mueren, el nitrógeno reingresa al suelo completando el
ciclo. Este ciclo es complejo e involucra una serie de reacciones y organismos con
diferentes metabolismos. Siempre comienza con compuestos orgánicos sencillos (NH4+,
NO2-, NO3-, N2, NH3) y termina con compuestos orgánicos complejos; que a través de la
descomposición regresan a la etapa de compuestos sencillos.

PREGUNTA GENERADORA

¿Cómo puede evaluarse la asimilación del nitrógeno?

ACTIVIDADES A DESARROLLAR
Previas:
1. Investigación referente al ciclo del nitrógeno haciendo énfasis en el proceso de
asimilación del nitrógeno.
2. Resolver los siguientes cuestionamientos:
a) ¿Qué parámetros influyen en la asimilación del nitrógeno?
b) ¿Cuáles son los principales destinos del nitrógeno fijado?
c) ¿Qué papel juega y cuál es la importancia de la glutamato deshidrogenasa en el
proceso de asimilación del nitrógeno?
d) ¿Existe diferencia entre la asimilación de nitrógeno en plantas y animales?
e) ¿Qué destino tiene el nitrógeno asimilado?
3. De acuerdo a lo investigado proponga un experimento para evaluar la asimilación de
nitrógeno en un ser vivo y discútalo con el profesor para el visto bueno.
6. Diagrama de bloques de la actividad a desarrollar (previa aprobación del experimento
por parte del profesor) .
Durante la práctica:
1. Montaje y/o preparación de aparatos y/o equipos
2. Puesta en práctica del experimento y la o las técnicas que evidencien la asimilación de
nitrógeno en un ser vivo.
EVIDENCIAS A GENERAR EN EL DESARROLLO DE LA PRACTICA

Registrar los resultados obtenidos de la experimentación en la siguiente tabla.

10
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Ser vivo Nitrógeno asimilado


Vegetal
Animal

INSTRUMENTO DE EVALUACION (RUBRICA, LISTA DE COTEJO, ETC.)

1. Se empleará una lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno durante el
desarrollo de la práctica (60% de la evaluación total. Ver anexo)

2. Se empleará una rúbrica para evaluar el reporte de la presente práctica. (40% de la


evaluación total. Ver anexo)

BIBLIOGRAFIA
1. Campbell M., Farrell S. 2005. Bioquímica. Editorial Thomson. Cuarta edición.
México.
2. Horton R., Moran L., Ochs R., Rawn J., Scrimgeour K. 1995. Bioquímica. Prentice
Hall-Hispanoamericana, S.A. México.
3. Lehninger AL, Nelson, DL. Principios de bioquímica. 4a. ed. Barcelona: Ediciones
Omega; 2005
4. Mathews C., Van Holde K., Ahern K. Bioquímica. Addison Wesley, tercera edición.
Madrid 2002.
5. Voet Donald, Voet Judith G. Bioquímica. 3a. ed. Panamericana. 2006

11
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

FIRMAS

M. en C. María Yazmín Soria Chico M. en C. Consuelo Martínez Ruiz


Responsable Colaborador

I.B.Q. Julio César Martínez Tellez Dra. María Isabel Neria González
Colaborador Colaborador

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PRÁCTICA No. 3

DETERMINACIÓN DE PUNTO
ISOELÉCTRICO E IDENTIFICACIÓN
DE AMINOÁCIDOS

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CARRERA (S): Ingeniería Bioquímica


NOMBRE DE LA ASIGNATURA Bioquímica del Nitrógeno y Regulación Genética.
NO. CRÉDITOS SATCA DE 2
PRÁCTICA
NOMBRE(S) DE LA(S) Metabolismo del Nitrógeno
UNIDAD(ES) DE APRENDIZAJE
TEMA(S) Síntesis y degradación de aminoácidos
COMPETENCIA A Competencias Específicas:
DESARROLLAR Comprender, identificar, analizar y relacionar el
metabolismo de aminoácidos.
Competencias Genéricas:
Sistémicas
• Aplicar los conocimientos a la práctica
• Habilidades de investigación
• Capacidad de aprender (aprender a aprender)
• Habilidad para trabajar en forma autónoma.

Interpersonales:
• Capacidad crítica y autocrítica
• Trabajo en equipo
• Habilidades interpersonales

Instrumentales:
• Análisis y Síntesis
• Organización y planificación
• Conocimientos básicos de la profesión
• Habilidad para buscar y analizar información
proveniente de fuentes diversas
• Comunicación oral y escrita (lengua propia)
• Toma de decisiones

NO. DE PRACTICA 3 DURACION 4


(HORAS)

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MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

ANTECEDENTES

Todos los aminoácidos presentan al menos un grupo ácido (donador de protones) y un


grupo básico (aceptor de protones) que se ionizan cuando están en solución, por ello, los
aminoácidos poseen propiedades de ácido y de base, es decir son anfotéricos (Voet &
Voet, 2004). Cada grupo tiene un pK, el cual corresponde al pH en el que se encuentra la
misma cantidad de la forma no ionizada que de la ionizada (Gonzales et al, 2009;
Houston, 2006):
Los aminoácidos tienen al menos dos pK, por lo que tienen mayor capacidad
amortiguadora, ya que presentan de tres a cuatro formas iónicas diferentes. Cuando la
forma iónica tiene una carga neta de cero (zwitterion), se dice que se encuentra en su
punto isoeléctrico o pi. Al variar el pH, cambia la proporción de las formas iónicas y es
posible ver la capacidad amortiguadora de los aminoácidos. Cada aminoácido tiene sus
propios pK, puesto que presenta diferentes sustituyentes en sus cadenas laterales
(Gonzales et al, 2009).

Como ya se mencionó, en los aminoácidos los grupos carboxilo y amino se pueden


protonar y desprotonar. Esta característica y la estructura determinada de cada
aminoácido hacen que cada uno de ellos posea una curva de titulación específica.
La titulación es un proceso mediante el cual se introducen o se remueven protones al
agregar respectivamente ácidos (H+) o bases (OH-). Se utiliza para determinar la
cantidad de un ácido en una solución, empleando para ello un volumen conocido del
ácido el cual se titula con un álcali de concentración conocida, hasta obtener un pH
neutro. A medida que procede la titulación, ocurren cambios en la estructura de los
aminoácidos que involucran los grupos protonables.

El conocimiento de las propiedades ácido-base de los aminoácidos es muy importante


para comprender las propiedades físicas y biológicas de las proteínas ya que las
tecnologías de separación, identificación y cuantificación de los diferentes aminoácidos se
basan en estas propiedades.

PREGUNTA GENERADORA
¿Para qué y cómo se puede determinar experimentalmente el pK de los aminoácidos?

ACTIVIDADES A DESARROLLAR
Previas:
Dar respuesta al siguiente cuestionario
1. ¿Qué es el pK y qué relación guarda con respecto al pH?
2. ¿Cómo es el pKa de un ácido fuerte en comparación de un ácido débil?
3. ¿Por qué se dice que los aminoácidos tienen carácter anfotérico?.
4. Investiga las estructuras iónicas de los aminoácidos que establezca el profesor en sus
respectivos pKs y en su punto isoeléctrico.
5. ¿Qué representa el pK de un grupo carboxilo y de un grupo amino?

15
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

6. Establecer la metodología que se seguirá para obtener el pK de un aminoácido


mediante curva de titulación.
Durante la práctica:
1. Montaje y/o preparación de aparatos y/o equipos
2. Puesta en práctica de la o las técnicas
3. Identificación de aminoácidos.

EVIDENCIAS A GENERAR EN EL DESARROLLO DE LA PRACTICA

1. Llenar el siguiente cuadro con los datos que se hayan obtenido en la práctica:

AMINOÁCIDO pK
Arginina
Lisina
Timina
Tirosina
Solución problema (aminoácido)

Por lo tanto, la solución


problema es el
aminoácido llamado:
2. Comparar los valores de pK del aminoácido problema, obtenido experimentalmente,
con los valores teóricos de los demás aminoácidos, para su identificación.
3. Elaborar la curva de titulación empleando los datos de ml de NaOH gastados (en el
eje de las abscisas) vs. pH (eje de las ordenadas).

INSTRUMENTO DE EVALUACION (RUBRICA, LISTA DE COTEJO, ETC.)

1. Se empleará una lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno durante el
desarrollo de la práctica (60% de la evaluación total. Ver anexo)

2. Se empleará una rúbrica para evaluar el reporte de la presente práctica. (40% de la


evaluación total. Ver anexo)

BIBLIOGRAFIA
1. Day, R. A. Jr., Underwood, A. L. 1989. Química Analítica Cuantitativa 5ª
Ed.,Prentice-Hall Hispanoamericana, México
2. Bohinski, Robert C. Bioquímica. México, DF.5a. ed. Pearson Educación, 1998.
3. Pastemak, Jack J. Molecular Biotechnology: Principles and applications of
recombinent DNA. American Society for Microbiology. 3a. ed. 2003.

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MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

FIRMAS

M. en C. María Yazmín Soria Chico M. en C. Consuelo Martínez Ruiz


Responsable Colaborador

I.B.Q. Julio César Martínez Tellez Dra. María Isabel Neria González
Colaborador Colaborador

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PRÁCTICA No. 4

METABOLISMO DE PROTEÍNAS

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CARRERA (S): Ingeniería Bioquímica


NOMBRE DE LA ASIGNATURA Bioquímica del Nitrógeno y Regulación Genética.
NO. CRÉDITOS SATCA DE 2
PRÁCTICA
NOMBRE(S) DE LA(S) Control y regulación metabólica
UNIDAD(ES) DE APRENDIZAJE
TEMA(S) Regulación a nivel enzimático
COMPETENCIA A Competencias Específicas:
DESARROLLAR Comprender, identificar, analizar y relacionar el
metabolismo de aminoácidos.
Competencias Genéricas:
Sistémicas
• Aplicar los conocimientos a la práctica
• Habilidades de investigación
• Capacidad de aprender (aprender a aprender)
• Habilidad para trabajar en forma autónoma.

Interpersonales:
• Capacidad crítica y autocrítica
• Trabajo en equipo
• Habilidades interpersonales

Instrumentales:
• Análisis y Síntesis
• Organización y planificación
• Conocimientos básicos de la profesión
• Habilidad para buscar y analizar información
proveniente de fuentes diversas
• Comunicación oral y escrita (lengua propia)
• Toma de decisiones

NO. DE PRACTICA 4 DURACION 4


(HORAS)

19
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

ANTECEDENTES.

La síntesis de proteínas es el proceso que se lleva a cabo en el organismo generalmente


a partir de la proteína de la ingesta y del recambio fisiológico. Dentro del organismo, las
proteínas realizan las más diversas funciones, pero sin duda alguna la más importante, es
la función relacionada con los procesos anabólicos, es decir la relacionada con la síntesis
de materia viva, de construcción (metabolismo plástico).
Uno de los destinos anabólicos más frecuentes es la formación y mantenimiento de la
masa muscular. Este proceso se acelera cuando los músculos experimentan micro o
pequeños rasgones, producidos por el proceso de crecimiento o renovación. Las
pequeñas fibras se reparan a través de la síntesis de proteínas que conduce a las fibras
musculares a ser más grandes y fuertes.

La creatina endógena se sintetiza en el organismo a partir de 3 aminoácidos: la glicina, la


arginina y la metionina. La síntesis endógena de la creatina está regulada por la cantidad
de creatina o de sus precursores que sean ingeridos en la dieta.

La creatina es utilizada como forma de almacenamiento del fosfato de alta energía. El


fosfato del ATP es transferido a la creatina, generando fosfato de creatina, a través de la
acción de la creatin fosfocinasa. La reacción es reversible cuando la demanda energética
es alta (e.g. durante el esfuerzo muscular) la creatinfosfato dona su fosfato al ADP para
producir ATP.

La creatina y la creatinfosfato se encuentran en músculo, cerebro y sangre. La cantidad


de creatinina producida se relaciona con la masa muscular y se mantiene constante día a
día. Su exceso es excretado por los riñones.
La producción endógena y la excresión de creatinina reflejan indirectamente la masa
muscular corporal total. 1 g de creatinina urinaria representa aproximadamente 18 g de
masa muscular.

PREGUNTA GENERADORA

¿Es posible evaluar indirectamente el funcionamiento del metabolismo de las proteínas


en una persona?
ACTIVIDADES A DESARROLLAR
Previas:
1. Investigar acerca del metabolismo de las proteínas
2. Realizar un mapa del metabolismo de las proteínas
3. Investigar por qué es importante el metabolismo de la creatina
4. ¿Por qué la creatinina puede servir como un índice de valoración nutricional?
5. Investigar las técnicas y/o métodos (y sus fundamentos) para la determinación de
la creatinina.
6. Seleccionar en discusión grupal un método o técnica para la determinación de
creatinina.

20
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Modelo por Competencias Profesionales

7. Realizar un diagrama de bloques del método o técnica seleccionada.


Durante la práctica:
1. Montaje y/o preparación de aparatos y/o equipos
2. Puesta en práctica de la o las técnicas

EVIDENCIAS A GENERAR EN EL DESARROLLO DE LA PRACTICA


1. Realizar el procedimiento de valoración nutricional para un integrante del equipo de
trabajo.
2. Registrar observaciones y resultados de la técnica o método empleado.

INSTRUMENTO DE EVALUACION (RUBRICA, LISTA DE COTEJO, ETC.)

1. Se empleará una lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno durante el
desarrollo de la práctica (60% de la evaluación total. Ver anexo)

2. Se empleará una rúbrica para evaluar el reporte de la presente práctica. (40% de la


evaluación total. Ver anexo)

BIBLIOGRAFIA
1. Day, R. A. Jr., Underwood, A. L. 1989. Química Analítica Cuantitativa 5ª
Ed.,Prentice-Hall Hispanoamericana, México
2. Bohinski, Robert C. Bioquímica. México, DF.5a. ed. Pearson Educación, 1998.

3. Pastemak, Jack J. Molecular Biotechnology: Principles and applications of


recombinent DNA. American Society for Microbiology. 3a. ed. 2003.

4. MorenoE. Gargallo M., López de la Torre M. Diagnóstico y tratamiento de


enfermedades metabólicas. Ediciones Díaz de Santos, S. A. Madrid 1997

5. Bonilla D. (2013). Principios metabólicos de los efectos de la suplementación


con creatina sobre el rendimiento deportivo. Nutrición Deportiva. Disponible en
http://g-se.com/es/nutricion-deportiva/articulos/principios-metabolicos-de-los-
efectos-de-la-suplementacion-con-creatina-sobre-el-rendimiento-deportivo-1601

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FIRMAS

M. en C. María Yazmín Soria Chico M. en C. Consuelo Martínez Ruiz


Responsable Colaborador

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Colaborador Colaborador

22
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PRÁCTICA No. 5

AISLAMIENTO DE DNA

23
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CARRERA (S): Ingeniería Bioquímica


NOMBRE DE LA ASIGNATURA Bioquímica del Nitrógeno y Regulación Genética.
NO. CRÉDITOS SATCA DE 2
PRÁCTICA
NOMBRE(S) DE LA(S) Estructura de los ácidos nucléicos
UNIDAD(ES) DE APRENDIZAJE
TEMA(S) El ADN
COMPETENCIA A Competencias Específicas:
DESARROLLAR Comprender, identificar, analizar y relacionar el
metabolismo de aminoácidos.
Competencias Genéricas:
Sistémicas
• Aplicar los conocimientos a la práctica
• Habilidades de investigación
• Capacidad de aprender (aprender a aprender)
• Habilidad para trabajar en forma autónoma.

Interpersonales:
• Capacidad crítica y autocrítica
• Trabajo en equipo
• Habilidades interpersonales

Instrumentales:
• Análisis y Síntesis
• Organización y planificación
• Conocimientos básicos de la profesión
• Habilidad para buscar y analizar información
proveniente de fuentes diversas
• Comunicación oral y escrita (lengua propia)
• Toma de decisiones

NO. DE PRACTICA 4 DURACION 4


(HORAS)

24
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

ANTECEDENTES.

El ADN (Ácido desoxirribonucleico) es el material genético de todos los organismos


celulares (productores, consumidores, descomponedores y bacterias) y casi todos los
virus. Éste lleva la información necesaria para dirigir la síntesis de proteínas (producción
de las proteínas que necesita la célula o el virus para realizar sus actividades y
desarrollarse), y la replicación (reacciones por medio de las cuales el ADN se copia a sí
mismo).

Los organismos vivos formados por células que tienen núcleos verdaderos, es decir,
separados del citoplasma por una membrana doble bien diferenciada, se denominan
eucariontes o eucariotas. Estos organismos tienen bien definido su ADN del resto de la
célula. Estos organismos eucariotas pueden ser unicelulares, en el caso de los protozoos
y pluricelulares en el caso de los hongos (descomponedores), plantas (productores) y
metazoos (consumidores).

Por el contrario, los procariotas o procariontes, son organismos cuyos núcleos celulares
no están envueltos por una membrana nuclear, por lo que su ADN está en contacto con el
citoplasma. La mayoría de estos organismos procariotas son bacterias.

PREGUNTA GENERADORA
¿Es posible mostrar experimentalmente la presencia de ácidos nucléicos en organismos de
diferentes reinos?

ACTIVIDADES A DESARROLLAR
Previas:
1. Investigar acerca de las diferentes técnicas (con sus fundamentos) de extracción
de DNA.
2. En discusión grupal seleccionar un método o técnica de extracción de DNA.
3. Realizar un diagrama de bloques del método o técnica a realizar.

Durante la práctica:
1. Montaje y/o preparación de aparatos y/o equipos
2. Puesta en práctica de la o las técnicas
3. Extracción de ácidos nucléicos.

EVIDENCIAS A GENERAR EN EL DESARROLLO DE LA PRACTICA

De acuerdo a los resultados obtenidos en la experimentación llenar la siguiente tabla

25
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Modelo por Competencias Profesionales

Muestra de origen animal Muestra de origen vegetal


Extracción de
DNA

INSTRUMENTO DE EVALUACION (RUBRICA, LISTA DE COTEJO, ETC.)

1. Se empleará una lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno durante el
desarrollo de la práctica (60% de la evaluación total. Ver anexo)

2. Se empleará una rúbrica para evaluar el reporte de la presente práctica. (40% de la


evaluación total. Ver anexo)

BIBLIOGRAFIA
6. Bohinski, Robert C. Bioquímica. México, DF.5a. ed. Pearson Educación, 1998.
7. Campbell M., Farrell S. 2005. Bioquímica. Editorial Thomson. Cuarta edición.
México.
8. Horton R., Moran L., Ochs R., Rawn J., Scrimgeour K. 1995. Bioquímica. Prentice
Hall-Hispanoamericana, S.A. México.
9. Mathews C., Van Holde K., Ahern K. Bioquímica. Addison Wesley, tercera edición.
Madrid 2002.
10. Pastemak, Jack J. Molecular Biotechnology: Principles and applications of
recombinent DNA. American Society for Microbiology. 3a. ed. 2003.
11. Smith. C.A., Wood E.J. Biología Molecular y Biotecnología. Ed. Addison Wesley
Iberoamericana. México 1998.

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MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
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FIRMAS:

M. en C. María Yazmín Soria Chico M. en C. Consuelo Martínez Ruiz


Responsable Colaborador

I.B.Q. Julio César Martínez Tellez Dra. María Isabel Neria González
Colaborador Colaborador

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MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

PROYECTO

28
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales

CARRERA (S): Ingeniería Bioquímica


NOMBRE DE LA ASIGNATURA Bioquímica del Nitrógeno y Regulación Genética.
NO. CRÉDITOS SATCA DE 2
PRÁCTICA
NOMBRE(S) DE LA(S) Metabolismo del Nitrógeno
UNIDAD(ES) DE APRENDIZAJE
TEMA(S) Ciclo del Nitrógeno
COMPETENCIA A Competencias Específicas:
DESARROLLAR Comprender, identificar, analizar y relacionar el
metabolismo de aminoácidos.
Competencias Genéricas:
Sistémicas
• Aplicar los conocimientos a la práctica
• Habilidades de investigación
• Capacidad de aprender (aprender a aprender)
• Habilidad para trabajar en forma autónoma.

Interpersonales:
• Capacidad crítica y autocrítica
• Trabajo en equipo
• Habilidades interpersonales

Instrumentales:
• Análisis y Síntesis
• Organización y planificación
• Conocimientos básicos de la profesión
• Habilidad para buscar y analizar información
proveniente de fuentes diversas
• Comunicación oral y escrita (lengua propia)
• Toma de decisiones

NO. DE PRACTICA 6 DURACION Restantes del


(HORAS) semestre

29
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ANTECEDENTES.

El ciclo del nitrógeno al igual que los demás ciclos biogeoquímicos, tiene una trayectoria
definida, pero quizá aún más complicada que los demás, dado que tiene que seguir una
serie de procesos físicos, químicos y biológicos. Así, el nitrógeno está considerado como
el elemento más abundante en la atmósfera. Sin embargo, dada su estabilidad, es muy
difícil que reaccione con otros elementos y, por tanto, se tiene un bajo aprovechamiento,
razón por la cual, su abundancia pasa a segundo término A pesar de esto, gracias al
proceso biológico de algunas bacterias y cianobacterias, el nitrógeno que se encuentra en
la atmósfera puede ser asimilable, al “romper” la unión de sus enlaces por medios
enzimáticos y así poder producir compuestos nitrogenados, que pueden ser
aprovechados por la mayoría de los seres vivos, en especial las plantas, que forman
relaciones simbióticas con este tipo de bacterias. Ese nitrógeno fijado se transforma en
aminoácidos y proteínas vegetales, que son aprovechadas a su vez por los herbívoros,
quienes los van almacenando para finalmente pasarlos al último eslabón de la cadena
alimenticia, es decir a los carnívoros. Cabe mencionar, que el nitrógeno regresa de nuevo
al ciclo por medio de los desechos (tanto restos orgánicos, como productos finales del
metabolismo), ya que gracias a que las bacterias fijadoras los “retoman”, es que pueden
finalmente ser asimilados por las plantas, cosa que de otra manera sería imposible. Sin
embargo, hay pérdidas de nitrógeno por medio de otras bacterias que lo liberan a la
atmósfera. De esta forma se logra un equilibrio en el ciclo del nitrógeno.
PREGUNTA GENERADORA
¿Cómo podría demostrarse mediante un experimento el funcionamiento del ciclo del nitrógeno o
una parte de él?

ACTIVIDADES A DESARROLLAR
Previas:
1. Investigar acerca del ciclo del nitrógeno, su importancia y sus diferentes etapas.
2. En discusión con el profesor plantear un experimento que demuestre el
funcionamiento del ciclo del nitrógeno.
3. Realizar un diagrama de bloques del método o técnica a realizar.

Durante el proyecto:
1. Montaje y/o preparación de aparatos y/o equipos
2. Puesta en práctica de la o las técnicas

EVIDENCIAS A GENERAR EN EL DESARROLLO DE LA PRACTICA

Recabar evidencias como fotografías de la marcha del proyecto (montaje del proyecto,
toma de muestras, determinaciones, etc.) y mostrar resultados.

30
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
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INSTRUMENTO DE EVALUACION (RUBRICA, LISTA DE COTEJO, ETC.)

1. Se empleará una lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno durante el
desarrollo del proyecto (60% de la evaluación total. Ver anexo)

2. Se empleará una rúbrica para evaluar el reporte del presente proyecto. (40% de la
evaluación total. Ver anexo)

BIBLIOGRAFIA
1. Bohinski, Robert C. Bioquímica. México, DF.5a. ed. Pearson Educación, 1998.
2. Campbell M., Farrell S. 2005. Bioquímica. Editorial Thomson. Cuarta edición.
México.
3. Horton R., Moran L., Ochs R., Rawn J., Scrimgeour K. 1995. Bioquímica. Prentice
Hall-Hispanoamericana, S.A. México.
4. Mathews C., Van Holde K., Ahern K. Bioquímica. Addison Wesley, tercera edición.
Madrid 2002.

FIRMAS:

M. en C. María Yazmín Soria Chico M. en C. Consuelo Martínez Ruiz


Responsable Colaborador

I.B.Q. Julio César Martínez Tellez Dra. María Isabel Neria González
Colaborador Colaborador

31
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ANEXO

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Lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno en el laboratorio

Nombre del alumno: ________________________________________ Grupo:_____________


Asignatura: ___________________________________ Práctica a evaluar: ____________

CRITERIOS Sí No
Identifica la meta central de la práctica
Aplica sus conocimientos para la resolución del problema
experimental
Participa activamente en la organización de las actividades
experimentales del equipo
Aporta nuevas ideas sustentadas (es creativo) en los
conocimientos que ha adquirido, para el desarrollo óptimo de la
práctica.
Es analítico en sus opiniones y en la de sus compañeros
Se involucra en el trabajo experimental
Es hábil en el manejo de reactivos, materiales y equipo
Trabaja de manera ordenada y limpia en el laboratorio
Escucha con respeto la participación de los demás
Contribuye a generar un ambiente cordial durante el desarrollo
de las actividades realizadas en el laboratorio
PUNTAJE TOTAL

Escala de desempeño propuesta:


Si = 1punto
No = 0 puntos

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RÚBRICA DE EVALUACIÓN PARA PRÁCTICA DE LABORATORIO

Asignatura ______________________________ Semestre ______________________ Fecha de entrega ______________________


No. de equipo ___________________
Nombre de la práctica ___________________________________________________________________

ASPECTOS A COMPETENTE COMPETENTE COMPETENTE COMPETENTE NO APROBADO EVALUACIÓN


EVALUAR SOBRESALIENTE AVANZADO (9 INTERMEDIO (8 BÁSICO (7 puntos) (6 puntos) Autoeval. Evaluación TOTAL
(10 puntos) puntos) puntos) No. % No. % No.
Introducción Plantea clara, ordenada Plantea clara, Plantea clara y Plantea en forma No plantea
(10%) y correctamente el ordenada y ordenadamente el tema confusa el tema del introducción
tema del trabajo y su correctamente el del trabajo y su trabajo y su
importancia con tema del trabajo y su importancia sin importancia sin
suficiente sustento importancia con poco sustento teórico- sustento teórico-
teórico-científico. sustento teórico- científico. científico.
científico.
Procedimientos El 100% del o los El 90% del o los El 80% del o los El 70% del o los Menos del 70% del o
(20%) procedimientos están procedimientos estén procedimientos están procedimientos están los procedimientos
enlistados con pasos enlistados con pasos enlistados con pasos enlistados con pasos están enlistados con
claros y lógicos. claros y lógicos claros y lógicos. claros y lógicos. pasos claros y lógicos.
Diagramas (10%) El 100% del o los El 90% del o los El 80% del o los El 70% del o los Menos del 70% del o
diagramas están bien diagramas están bien diagramas están bien diagramas están bien los diagramas están
estructurados y estructurados y estructurados y estructurados y bien estructurados y
etiquetados de tal etiquetados de tal etiquetados de tal etiquetados de tal etiquetados.
manera que facilitan la manera que facilitan manera que facilitan la manera que facilitan
comprensión del la comprensión del comprensión del la comprensión del
experimento experimento experimento experimento
Resultados y Presenta el 100% de Presenta el 90% de Presenta el 80% de Presenta el 70% de Presenta menos del
cálculos (10%) resultados y cálculos de resultados y cálculos resultados y cálculos de resultados y cálculos 70% de resultados y
manera ordenada, de manera ordenada, manera ordenada, de manera ordenada, cálculos de manera
pertinentes y pertinentes y pertinentes y pertinentes y ordenada, pertinentes y
correctos. correctos. correctos. correctos. hay algunos errores.
Análisis de Se discute la relación Interpreta y analiza Interpreta y analiza los Interpreta y analiza No Interpreta ni analiza
resultados. (20%) entre variables, los resultados resultados obtenidos los resultados los resultados
interpreta y analiza los obtenidos pero no obtenidos pero no obtenidos y tampoco

34
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resultados obtenidos comparativamente comparativamente con comparativamente indica las aplicaciones


comparativamente con con la bibliografía la bibliografía con la bibliografía teóricas
la bibliografía consultada e indica consultada o no indica consultada ni indica
consultada e indica las las aplicaciones las aplicaciones las aplicaciones
aplicaciones teóricas teóricas teóricas teóricas

Conclusión (20%) Son congruentes y bien Son congruentes con Están relacionadas con Da una idea vaga de No existe relación con
estructuradas respecto el contenido del el trabajo los temas tratados. el contenido del trabajo
al contenido del trabajo trabajo o no presenta
conclusiones
Bibliografía, El 100% del El 90% del El 80% del documento El 70% del Menos del 70% del
referencias y documento presenta documento presenta presenta literatura documento presenta documento presenta
literatura citada. literatura citada en literatura citada en citada en forma literatura citada en literatura citada en
(10%) forma correcta y la forma correcta y la correcta y la forma correcta y forma correcta y la
bibliografía y bibliografía y bibliografía y existen fallas en la bibliografía y existen
referencias se referencias se referencias se presentación de fallas o no se presentan
presentan de forma presentan de forma presentan de forma bibliografía y bibliografía y
correcta. correcta. correcta. referencias. referencias.

35
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RÚBRICA DE EVALUACIÓN PARA PROYECTO

Asignatura ______________________________ Semestre ____________ Fecha de entrega ________________ No. de equipo ________
Nombre del proyecto: ___________________________________________________________________
ASPECTOS A COMPETENTE COMPETENTE COMPETENTE COMPETENTE NO APROBADO EVALUACIÓN
EVALUAR SOBRESALIENTE AVANZADO (9 INTERMEDIO (8 BÁSICO (7 puntos) (6 puntos) Autoeval. Evaluación TOTAL
(10 puntos) puntos) puntos) No. % No. % No.
Título (5%) El título del proyecto El título del proyecto El título del proyecto El título del proyecto El título del proyecto
refleja una relación refleja una relación refleja una relación refleja una relación no refleja relación
clara con el problema clara con el problema clara con el problema ambigua con el alguna con el problema
de investigación, el de investigación y el de investigación problema de de investigación, el
objetivo general y la objetivo general . investigación, y/o el objetivo general y la
pregunta central. objetivo general y/o pregunta central.
la pregunta central.
Introducción Incluye el 100% de los Incluye el 90% de los Incluye el 80% de los Incluye el 70% de los Presenta menos del
(10%) elementos elementos elementos elementos 70% de los elementos
(antecedentes, (antecedentes, (antecedentes, (antecedentes, (antecedentes,
definición del definición del definición del definición del definición del
problema, justificación, problema, problema, justificación, problema, problema, justificación,
objetivos e hipótesis) justificación, objetivos e hipótesis). justificación, objetivos e hipótesis).
objetivos e objetivos e
hipótesis). hipótesis).
Fundamentos Incluye el 100% de los Incluye el 90% de los Incluye el 80% de los Incluye el 70% de los Presente menos del
(20%) elementos elementos elementos elementos 70% de los elementos
(fundamentos (fundamentos (fundamentos (fundamentos (fundamentos
contextuales, contextuales, contextuales, contextuales, contextuales,
conceptuales, teóricos conceptuales, conceptuales, teóricos conceptuales, conceptuales, teóricos
y estado del arte) teóricos y estado del y estado del arte) teóricos y estado del y estado del arte)
arte) arte)
Procedimiento Describe con exactitud Describe con Describe con exactitud Describe con No describe con
(10%) e incluye el 100% del exactitud e incluye el pero solo incluye el exactitud pero solo exactitud e incluye
procedimiento paso 90% del 80% del procedimiento incluye el 70% del menos del 70% del
por paso (enfoque procedimiento paso paso por paso o procedimiento paso procedimiento paso
metodológico, por paso (enfoque visceversa (enfoque por paso o visceversa por paso (enfoque
identificación de metodológico, metodológico, (enfoque metodológico,
variables e indicadores, identificación de identificación de metodológico, identificación de

36
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universo o población, variables e variables e indicadores, identificación de variables e indicadores,


muestra o unidad de indicadores, universo universo o población, variables e universo o población,
análisis, método) o población, muestra muestra o unidad de indicadores, universo muestra o unidad de
o unidad de análisis, análisis, método) o población, muestra análisis, método)
método) o unidad de análisis,
método)
Resultados y su Presenta el 100% de Presenta el 90% de Presenta el 80% de los Presenta el 70% de Presenta menos del
análisis (30%) los resultados de los resultados de resultados de manera los resultados de 70% de los resultados
manera adecuada manera adecuada adecuada (cuadros, manera adecuada de manera adecuada
(cuadros, figuras, etc.), (cuadros, figuras, figuras, etc.), así como (cuadros, figuras, (cuadros, figuras, etc.),
así como una etc.), así como una una interpretación etc.), y/o la y la interpretación no
interpretación lógica en interpretación lógica lógica en consecuencia interpretación no es es lógica en
consecuencia de la en consecuencia de la de la experimentación, del todo lógica en consecuencia de la
experimentación, experimentación, consecuencia de la experimentación,
experimentación,
Síntesis, redacción Todo el documento Todo el documento El documento presenta El documento El documento presenta
y ortografía. presenta ideas claras y presenta ideas claras 10% de ideas poco presenta 20% de más de 20% de ideas
(10%) concisas sin errores de y concisas con menos claras y concisas con ideas poco claras y poco claras y concisas
gramática, ortografía y de 10 errores de menos de 20 errores de concisas con menos con más de 30 errores
puntuación gramática, ortografía gramática, ortografía y de 30 errores de de gramática,
y puntuación. puntuación. gramática, ortografía ortografía y
y puntuación. puntuación.
Conclusión (10%) Son congruentes y bien Son congruentes con Están relacionadas con Da una idea vaga de No existe relación con
estructuradas respecto el contenido del el trabajo los temas tratados. el contenido del trabajo
al contenido del trabajo trabajo o no presenta
conclusiones
Bibliografía, El 100% del El 90% del El 80% del documento El 70% del Menos del 70% del
referencias y documento presenta documento presenta presenta literatura documento presenta documento presenta
literatura citada. literatura citada en literatura citada en citada en forma literatura citada en literatura citada en
(5%) forma correcta y la forma correcta y la correcta y la forma correcta y forma correcta y la
bibliografía y bibliografía y bibliografía y existen fallas en la bibliografía y existen
referencias se referencias se referencias se presentación de fallas o no se presentan
presentan de forma presentan de forma presentan de forma bibliografía y bibliografía y
correcta. correcta. correcta. referencias. referencias.

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