Manual Bioquimica Del Nitrogeno
Manual Bioquimica Del Nitrogeno
Manual Bioquimica Del Nitrogeno
INGENIERÍA BIOQUÍMICA
QUINTO SEMESTRE
1
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
INDICE
PROYECTO 29
2
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
PRESENTACIÓN
manera que contribuya a la formación integral de los alumnos que les permita
3
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
PRÁCTICA No. 1
FIJACIÓN DE NITRÓGENO Y SU
IMPACTO EN LA CALIDAD DE LOS
SUELOS
4
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
Interpersonales:
• Capacidad crítica y autocrítica
• Trabajo en equipo
• Habilidades interpersonales
Instrumentales:
• Análisis y Síntesis
• Organización y planificación
• Conocimientos generales básicos
• Conocimientos básicos de la profesión
• Comunicación oral y escrita (lengua propia)
5
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
ANTECEDENTES
Fijación de nitrógeno.
El nitrógeno es un elemento indispensable para la vida, forma parte de las principales
biomoléculas de todos los seres vivos. Es también uno de los elementos más abundantes
de la Tierra, pues en su forma gaseosa (N 2) constituye 78% de la atmósfera. El nitrógeno
puede llegar al suelo gracias a los aportes de materia orgánica y a la fijación bacteriana a
partir del aire. Sin embargo, la cantidad de nitrógeno presente en muchos suelos es
escasa, debido a su propia dinámica y a su ciclo biogeoquímico. La disponibilidad de
nitrógeno es el factor que limita la fertilidad de la mayor parte de los suelos
PREGUNTA GENERADORA
¿La fijación de nitrógeno es igual en todos los tipos de suelo?
ACTIVIDADES A DESARROLLAR
Previas:
1. Investigación referente al ciclo del nitrógeno haciendo énfasis en el proceso de fijación
de nitrógeno.
2. Resolver los siguientes cuestionamientos:
a) ¿Cuáles son los tipos de fijación de nitrógeno y cuál es la más frecuente?
b) ¿Qué importancia tiene la nitrogenasa y cuál es su papel en la fijación del
nitrógeno?
c) ¿Qué factores afectan la actividad de la nitrogenasa?
3. Investigación acerca de técnicas de determinación de nitrógeno total
4. Realizar diagrama de bloques del método o técnica a utilizar
Durante la práctica:
1. Montaje y/o preparación de aparatos y/o equipos
2. Puesta en práctica de la o las técnicas
3. Determinación de nitrógeno total en diferentes muestras de tierra.
Muestras de tierra
Cantidad de
nitrógeno
6
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
1. Se empleará una lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno durante el
desarrollo de la práctica (60% de la evaluación total. Ver anexo)
BIBLIOGRAFIA
1. Horton R., Moran L., Ochs R., Rawn J., Scrimgeour K. 1995. Bioquímica. Prentice
Hall-Hispanoamericana, S.A. México.
2. Lehninger AL, Nelson, DL. Principios de bioquímica. 4a. ed. Barcelona: Ediciones
Omega; 2005
3. Mathews C., Van Holde K., Ahern K. Bioquímica. Addison Wesley, tercera edición.
Madrid 2002.
4. Voet Donald, Voet Judith G. Bioquímica. 3a. ed. Panamericana. 2006
FIRMAS
I.B.Q. Julio César Martínez Tellez Dra. María Isabel Neria González
Colaborador Colaborador
7
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
PRÁCTICA No. 2
ASIMILACIÓN DE NITRÓGENO
8
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
Interpersonales:
• Capacidad crítica y autocrítica
• Trabajo en equipo
• Habilidades interpersonales
Instrumentales:
• Análisis y Síntesis
• Organización y planificación
• Conocimientos básicos de la profesión
• Habilidad para buscar y analizar información
proveniente de fuentes diversas
• Comunicación oral y escrita (lengua propia)
• Toma de decisiones
9
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
ANTECEDENTES
PREGUNTA GENERADORA
ACTIVIDADES A DESARROLLAR
Previas:
1. Investigación referente al ciclo del nitrógeno haciendo énfasis en el proceso de
asimilación del nitrógeno.
2. Resolver los siguientes cuestionamientos:
a) ¿Qué parámetros influyen en la asimilación del nitrógeno?
b) ¿Cuáles son los principales destinos del nitrógeno fijado?
c) ¿Qué papel juega y cuál es la importancia de la glutamato deshidrogenasa en el
proceso de asimilación del nitrógeno?
d) ¿Existe diferencia entre la asimilación de nitrógeno en plantas y animales?
e) ¿Qué destino tiene el nitrógeno asimilado?
3. De acuerdo a lo investigado proponga un experimento para evaluar la asimilación de
nitrógeno en un ser vivo y discútalo con el profesor para el visto bueno.
6. Diagrama de bloques de la actividad a desarrollar (previa aprobación del experimento
por parte del profesor) .
Durante la práctica:
1. Montaje y/o preparación de aparatos y/o equipos
2. Puesta en práctica del experimento y la o las técnicas que evidencien la asimilación de
nitrógeno en un ser vivo.
EVIDENCIAS A GENERAR EN EL DESARROLLO DE LA PRACTICA
10
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
1. Se empleará una lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno durante el
desarrollo de la práctica (60% de la evaluación total. Ver anexo)
BIBLIOGRAFIA
1. Campbell M., Farrell S. 2005. Bioquímica. Editorial Thomson. Cuarta edición.
México.
2. Horton R., Moran L., Ochs R., Rawn J., Scrimgeour K. 1995. Bioquímica. Prentice
Hall-Hispanoamericana, S.A. México.
3. Lehninger AL, Nelson, DL. Principios de bioquímica. 4a. ed. Barcelona: Ediciones
Omega; 2005
4. Mathews C., Van Holde K., Ahern K. Bioquímica. Addison Wesley, tercera edición.
Madrid 2002.
5. Voet Donald, Voet Judith G. Bioquímica. 3a. ed. Panamericana. 2006
11
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
FIRMAS
I.B.Q. Julio César Martínez Tellez Dra. María Isabel Neria González
Colaborador Colaborador
12
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
PRÁCTICA No. 3
DETERMINACIÓN DE PUNTO
ISOELÉCTRICO E IDENTIFICACIÓN
DE AMINOÁCIDOS
13
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
Interpersonales:
• Capacidad crítica y autocrítica
• Trabajo en equipo
• Habilidades interpersonales
Instrumentales:
• Análisis y Síntesis
• Organización y planificación
• Conocimientos básicos de la profesión
• Habilidad para buscar y analizar información
proveniente de fuentes diversas
• Comunicación oral y escrita (lengua propia)
• Toma de decisiones
14
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
ANTECEDENTES
PREGUNTA GENERADORA
¿Para qué y cómo se puede determinar experimentalmente el pK de los aminoácidos?
ACTIVIDADES A DESARROLLAR
Previas:
Dar respuesta al siguiente cuestionario
1. ¿Qué es el pK y qué relación guarda con respecto al pH?
2. ¿Cómo es el pKa de un ácido fuerte en comparación de un ácido débil?
3. ¿Por qué se dice que los aminoácidos tienen carácter anfotérico?.
4. Investiga las estructuras iónicas de los aminoácidos que establezca el profesor en sus
respectivos pKs y en su punto isoeléctrico.
5. ¿Qué representa el pK de un grupo carboxilo y de un grupo amino?
15
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
1. Llenar el siguiente cuadro con los datos que se hayan obtenido en la práctica:
AMINOÁCIDO pK
Arginina
Lisina
Timina
Tirosina
Solución problema (aminoácido)
1. Se empleará una lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno durante el
desarrollo de la práctica (60% de la evaluación total. Ver anexo)
BIBLIOGRAFIA
1. Day, R. A. Jr., Underwood, A. L. 1989. Química Analítica Cuantitativa 5ª
Ed.,Prentice-Hall Hispanoamericana, México
2. Bohinski, Robert C. Bioquímica. México, DF.5a. ed. Pearson Educación, 1998.
3. Pastemak, Jack J. Molecular Biotechnology: Principles and applications of
recombinent DNA. American Society for Microbiology. 3a. ed. 2003.
16
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
FIRMAS
I.B.Q. Julio César Martínez Tellez Dra. María Isabel Neria González
Colaborador Colaborador
17
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
PRÁCTICA No. 4
METABOLISMO DE PROTEÍNAS
18
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
Interpersonales:
• Capacidad crítica y autocrítica
• Trabajo en equipo
• Habilidades interpersonales
Instrumentales:
• Análisis y Síntesis
• Organización y planificación
• Conocimientos básicos de la profesión
• Habilidad para buscar y analizar información
proveniente de fuentes diversas
• Comunicación oral y escrita (lengua propia)
• Toma de decisiones
19
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
ANTECEDENTES.
PREGUNTA GENERADORA
20
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
1. Se empleará una lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno durante el
desarrollo de la práctica (60% de la evaluación total. Ver anexo)
BIBLIOGRAFIA
1. Day, R. A. Jr., Underwood, A. L. 1989. Química Analítica Cuantitativa 5ª
Ed.,Prentice-Hall Hispanoamericana, México
2. Bohinski, Robert C. Bioquímica. México, DF.5a. ed. Pearson Educación, 1998.
21
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
FIRMAS
I.B.Q. Julio César Martínez Tellez Dra. María Isabel Neria González
Colaborador Colaborador
22
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
PRÁCTICA No. 5
AISLAMIENTO DE DNA
23
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
Interpersonales:
• Capacidad crítica y autocrítica
• Trabajo en equipo
• Habilidades interpersonales
Instrumentales:
• Análisis y Síntesis
• Organización y planificación
• Conocimientos básicos de la profesión
• Habilidad para buscar y analizar información
proveniente de fuentes diversas
• Comunicación oral y escrita (lengua propia)
• Toma de decisiones
24
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
ANTECEDENTES.
Los organismos vivos formados por células que tienen núcleos verdaderos, es decir,
separados del citoplasma por una membrana doble bien diferenciada, se denominan
eucariontes o eucariotas. Estos organismos tienen bien definido su ADN del resto de la
célula. Estos organismos eucariotas pueden ser unicelulares, en el caso de los protozoos
y pluricelulares en el caso de los hongos (descomponedores), plantas (productores) y
metazoos (consumidores).
Por el contrario, los procariotas o procariontes, son organismos cuyos núcleos celulares
no están envueltos por una membrana nuclear, por lo que su ADN está en contacto con el
citoplasma. La mayoría de estos organismos procariotas son bacterias.
PREGUNTA GENERADORA
¿Es posible mostrar experimentalmente la presencia de ácidos nucléicos en organismos de
diferentes reinos?
ACTIVIDADES A DESARROLLAR
Previas:
1. Investigar acerca de las diferentes técnicas (con sus fundamentos) de extracción
de DNA.
2. En discusión grupal seleccionar un método o técnica de extracción de DNA.
3. Realizar un diagrama de bloques del método o técnica a realizar.
Durante la práctica:
1. Montaje y/o preparación de aparatos y/o equipos
2. Puesta en práctica de la o las técnicas
3. Extracción de ácidos nucléicos.
25
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
1. Se empleará una lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno durante el
desarrollo de la práctica (60% de la evaluación total. Ver anexo)
BIBLIOGRAFIA
6. Bohinski, Robert C. Bioquímica. México, DF.5a. ed. Pearson Educación, 1998.
7. Campbell M., Farrell S. 2005. Bioquímica. Editorial Thomson. Cuarta edición.
México.
8. Horton R., Moran L., Ochs R., Rawn J., Scrimgeour K. 1995. Bioquímica. Prentice
Hall-Hispanoamericana, S.A. México.
9. Mathews C., Van Holde K., Ahern K. Bioquímica. Addison Wesley, tercera edición.
Madrid 2002.
10. Pastemak, Jack J. Molecular Biotechnology: Principles and applications of
recombinent DNA. American Society for Microbiology. 3a. ed. 2003.
11. Smith. C.A., Wood E.J. Biología Molecular y Biotecnología. Ed. Addison Wesley
Iberoamericana. México 1998.
26
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
FIRMAS:
I.B.Q. Julio César Martínez Tellez Dra. María Isabel Neria González
Colaborador Colaborador
27
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
PROYECTO
28
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
Interpersonales:
• Capacidad crítica y autocrítica
• Trabajo en equipo
• Habilidades interpersonales
Instrumentales:
• Análisis y Síntesis
• Organización y planificación
• Conocimientos básicos de la profesión
• Habilidad para buscar y analizar información
proveniente de fuentes diversas
• Comunicación oral y escrita (lengua propia)
• Toma de decisiones
29
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
ANTECEDENTES.
El ciclo del nitrógeno al igual que los demás ciclos biogeoquímicos, tiene una trayectoria
definida, pero quizá aún más complicada que los demás, dado que tiene que seguir una
serie de procesos físicos, químicos y biológicos. Así, el nitrógeno está considerado como
el elemento más abundante en la atmósfera. Sin embargo, dada su estabilidad, es muy
difícil que reaccione con otros elementos y, por tanto, se tiene un bajo aprovechamiento,
razón por la cual, su abundancia pasa a segundo término A pesar de esto, gracias al
proceso biológico de algunas bacterias y cianobacterias, el nitrógeno que se encuentra en
la atmósfera puede ser asimilable, al “romper” la unión de sus enlaces por medios
enzimáticos y así poder producir compuestos nitrogenados, que pueden ser
aprovechados por la mayoría de los seres vivos, en especial las plantas, que forman
relaciones simbióticas con este tipo de bacterias. Ese nitrógeno fijado se transforma en
aminoácidos y proteínas vegetales, que son aprovechadas a su vez por los herbívoros,
quienes los van almacenando para finalmente pasarlos al último eslabón de la cadena
alimenticia, es decir a los carnívoros. Cabe mencionar, que el nitrógeno regresa de nuevo
al ciclo por medio de los desechos (tanto restos orgánicos, como productos finales del
metabolismo), ya que gracias a que las bacterias fijadoras los “retoman”, es que pueden
finalmente ser asimilados por las plantas, cosa que de otra manera sería imposible. Sin
embargo, hay pérdidas de nitrógeno por medio de otras bacterias que lo liberan a la
atmósfera. De esta forma se logra un equilibrio en el ciclo del nitrógeno.
PREGUNTA GENERADORA
¿Cómo podría demostrarse mediante un experimento el funcionamiento del ciclo del nitrógeno o
una parte de él?
ACTIVIDADES A DESARROLLAR
Previas:
1. Investigar acerca del ciclo del nitrógeno, su importancia y sus diferentes etapas.
2. En discusión con el profesor plantear un experimento que demuestre el
funcionamiento del ciclo del nitrógeno.
3. Realizar un diagrama de bloques del método o técnica a realizar.
Durante el proyecto:
1. Montaje y/o preparación de aparatos y/o equipos
2. Puesta en práctica de la o las técnicas
Recabar evidencias como fotografías de la marcha del proyecto (montaje del proyecto,
toma de muestras, determinaciones, etc.) y mostrar resultados.
30
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
1. Se empleará una lista de cotejo para evaluar el desempeño del alumno durante el
desarrollo del proyecto (60% de la evaluación total. Ver anexo)
2. Se empleará una rúbrica para evaluar el reporte del presente proyecto. (40% de la
evaluación total. Ver anexo)
BIBLIOGRAFIA
1. Bohinski, Robert C. Bioquímica. México, DF.5a. ed. Pearson Educación, 1998.
2. Campbell M., Farrell S. 2005. Bioquímica. Editorial Thomson. Cuarta edición.
México.
3. Horton R., Moran L., Ochs R., Rawn J., Scrimgeour K. 1995. Bioquímica. Prentice
Hall-Hispanoamericana, S.A. México.
4. Mathews C., Van Holde K., Ahern K. Bioquímica. Addison Wesley, tercera edición.
Madrid 2002.
FIRMAS:
I.B.Q. Julio César Martínez Tellez Dra. María Isabel Neria González
Colaborador Colaborador
31
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
ANEXO
32
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
CRITERIOS Sí No
Identifica la meta central de la práctica
Aplica sus conocimientos para la resolución del problema
experimental
Participa activamente en la organización de las actividades
experimentales del equipo
Aporta nuevas ideas sustentadas (es creativo) en los
conocimientos que ha adquirido, para el desarrollo óptimo de la
práctica.
Es analítico en sus opiniones y en la de sus compañeros
Se involucra en el trabajo experimental
Es hábil en el manejo de reactivos, materiales y equipo
Trabaja de manera ordenada y limpia en el laboratorio
Escucha con respeto la participación de los demás
Contribuye a generar un ambiente cordial durante el desarrollo
de las actividades realizadas en el laboratorio
PUNTAJE TOTAL
33
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
34
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
Conclusión (20%) Son congruentes y bien Son congruentes con Están relacionadas con Da una idea vaga de No existe relación con
estructuradas respecto el contenido del el trabajo los temas tratados. el contenido del trabajo
al contenido del trabajo trabajo o no presenta
conclusiones
Bibliografía, El 100% del El 90% del El 80% del documento El 70% del Menos del 70% del
referencias y documento presenta documento presenta presenta literatura documento presenta documento presenta
literatura citada. literatura citada en literatura citada en citada en forma literatura citada en literatura citada en
(10%) forma correcta y la forma correcta y la correcta y la forma correcta y forma correcta y la
bibliografía y bibliografía y bibliografía y existen fallas en la bibliografía y existen
referencias se referencias se referencias se presentación de fallas o no se presentan
presentan de forma presentan de forma presentan de forma bibliografía y bibliografía y
correcta. correcta. correcta. referencias. referencias.
35
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
Asignatura ______________________________ Semestre ____________ Fecha de entrega ________________ No. de equipo ________
Nombre del proyecto: ___________________________________________________________________
ASPECTOS A COMPETENTE COMPETENTE COMPETENTE COMPETENTE NO APROBADO EVALUACIÓN
EVALUAR SOBRESALIENTE AVANZADO (9 INTERMEDIO (8 BÁSICO (7 puntos) (6 puntos) Autoeval. Evaluación TOTAL
(10 puntos) puntos) puntos) No. % No. % No.
Título (5%) El título del proyecto El título del proyecto El título del proyecto El título del proyecto El título del proyecto
refleja una relación refleja una relación refleja una relación refleja una relación no refleja relación
clara con el problema clara con el problema clara con el problema ambigua con el alguna con el problema
de investigación, el de investigación y el de investigación problema de de investigación, el
objetivo general y la objetivo general . investigación, y/o el objetivo general y la
pregunta central. objetivo general y/o pregunta central.
la pregunta central.
Introducción Incluye el 100% de los Incluye el 90% de los Incluye el 80% de los Incluye el 70% de los Presenta menos del
(10%) elementos elementos elementos elementos 70% de los elementos
(antecedentes, (antecedentes, (antecedentes, (antecedentes, (antecedentes,
definición del definición del definición del definición del definición del
problema, justificación, problema, problema, justificación, problema, problema, justificación,
objetivos e hipótesis) justificación, objetivos e hipótesis). justificación, objetivos e hipótesis).
objetivos e objetivos e
hipótesis). hipótesis).
Fundamentos Incluye el 100% de los Incluye el 90% de los Incluye el 80% de los Incluye el 70% de los Presente menos del
(20%) elementos elementos elementos elementos 70% de los elementos
(fundamentos (fundamentos (fundamentos (fundamentos (fundamentos
contextuales, contextuales, contextuales, contextuales, contextuales,
conceptuales, teóricos conceptuales, conceptuales, teóricos conceptuales, conceptuales, teóricos
y estado del arte) teóricos y estado del y estado del arte) teóricos y estado del y estado del arte)
arte) arte)
Procedimiento Describe con exactitud Describe con Describe con exactitud Describe con No describe con
(10%) e incluye el 100% del exactitud e incluye el pero solo incluye el exactitud pero solo exactitud e incluye
procedimiento paso 90% del 80% del procedimiento incluye el 70% del menos del 70% del
por paso (enfoque procedimiento paso paso por paso o procedimiento paso procedimiento paso
metodológico, por paso (enfoque visceversa (enfoque por paso o visceversa por paso (enfoque
identificación de metodológico, metodológico, (enfoque metodológico,
variables e indicadores, identificación de identificación de metodológico, identificación de
36
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
37
MANUAL DE PRACTICAS DE LABORATORIO
Modelo por Competencias Profesionales
38