GUÍA PARA TERCER PARCIAL DE ECOLOGÍA MICROBIANA

SUELO:
• Capa superficial, disgregada y de espesor variable, recubre la corteza terrestre
originado por meteorización de la roca preexistente, el aporte de materia orgánica y la
actividad de los organismos que lo habitan.
• Funciones:
1. Producción de alimentos
2. Secuestro y almacenamiento de carbono
3. Reserva de Biodiversidad
4. Almacén del patrimonio geológico y arqueológico
5. Reserva de agua, filtro y transformaciones de nutrientes
6. Producción de Biomasa
7. Soporte de las actividades humanas y fuente de materias primas
8. Intervine en el ciclo del agua; por lo tanto, el clima.
9. Evita la erosión: las plantas fijan el suelo e impiden el arrastre por lluvia o
viento
10. Enriquece la atmosfera de O2
• Componentes:
1. Materia orgánica procedente de restos y excrementos de los seres vivos.
Humus: restos de organismos y los productos de su transformación.
2. Minerales compuestos por granos de cuarzo, arcilla, carbonatos, etc. 50%
3. Aire: más 20 % del volumen total del suelo
4. Agua: relleno de huecos entre las partículas minerales y orgánicas.
5. Organismos vivos <1%:
• Clasificación de partículas
1. Arcilla
2. Limo
3. Arena
4. Grava
5. Guijarros
• Tipo de suelos
1. Arenosos: suelo fino, pequeño diámetro, muy compactos, baja permeabilidad
alta retención de agua, Suelos fósiles, pero difíciles de trabajar cuando están
secos. No retienen la humedad.
2. Limosos: textura moderada, tamaño intermedio, permeables, capaz de retener
agua y nutrientes, fértiles y fácil de trabajar.
3. Arcillosos: textura gruesa, gran tamaño, también llamados …, alta
permeabilidad, escasa retención de agua y nutrientes, poco fértiles. Blandos,
retienen humedad.
• Perfil de suelo: conjunto de horizontes y su estudio permite clasificar los distintos tipos
de suelo. Corte transversal en el terreno, superficie hasta la roca madre.
1. Horizonte 0: Material orgánica sin alterar y parcialmente alterada.
2. Horizonte A: Abundante Humus, densidad de raíces de plantas,
microorganismos y fauna edáfica, color oscuro.
 3. Horizonte B: Pobre de Humus. Tiene pocas raíces. Color más claro. Raíces de
árboles, arbustos, herbáceas.
4. Horizonte C: Fragmentos de roca madre parcialmente alterada, debajo se
encuentra el substrato rocoso.
5. Rocoso, Horizonte R: roca madre sin alterar.
• Suelo rocoso: Sin horizonte A Y B, roca en la superficie. Duros e impermeables, secos.
• TIPOS DE SUELO
1. ZONALES: Dependen del clima: Podsoles, Pardos, Rojos, Leteritas
2. AZONALES: No dependen del clima: Ranker, Rendsinas, Gley

 Podsoles: Horizonte superficial, aspecto de ceniza, bajo el horizonte rico en

complejos organometálicos, original alteración de rocas siliceas, depósitos
glaciares, aluviales y coluviales. Ácido, no apto para cultivo.
 Pardos: Península ibérica, totalmente formados mezcla de materia orgánica
con compuestos de hierro. Apto para el cultivo.
 Pardos: deshidratación de óxidos de hierro ------> Rojos: clima arido, escasas
precipitaciones, nivel B se acumula arcilla y carbonato calcico.
 Lateritas: Cuando se erosiona el horizonte A de suelos tropicales, pobre en
humus.
 Ranker: Suelo en estado joven sobre sustrato silíceo.
 Rendsina: suelo azonal sobre roca caliza.
 Gley: Lugares fríos y encharcados, humus ácido a la descomposición
anaerobia. Se forma turba y acumula arcilla gris-azulada, hierro reducido.
❖ Formación:
Roca madre empieza a colonizar los seres vivos, los restos de animales y plantas alimentan
bacterias y hongos, los descomponen y transforman en compuestos simples.
❖ FACTORES:
1. MATERIAL ORGANICO
2. CLIMA
3. TOPOGRAFIA
4. ORGANISMOS VIVOS
5. TIEMPO

NO RENOVABLE, FORMA 1CM CADA 500 AÑOS.

❖ FACTORES # Y TIPO MO´s:

1. Composición del suelo (cantidad y tipo de nutrietes)
2. características físicas del suelo (grado de aireación, humedad, pH, temperatura)
3. Tipo de plantas (las raíces influyen en el # y tipo de organismos presentes.
❖ Organismos
1. Bacterias: descomposición de la materia organica
2. Virus: virus de plantas, bacteriófagos y actinofagos
3. Hongos: descomposición de macromoléculas: celulosa, almidón y proteínas
4. Algas: Materia organica de materia inorgánica a través de fotosíntesis, inicio de
formación de suelo.
5. Actinomicetos: descomposición de celulosa y compuestos orgánicos resistentes,
humificación de M.Org. Asociaciones simbióticas hongos-liquenes.
6. Protozoarios: Pequeña cantidad, mayoría saprofitos o fotótrofos.
AIRE:
1. EXTRATÓSFERA: NAVES ESPACIALES, COSMO.
2. IONOSFERA: radiación U.V y X, ionización de átomos sodio y moléculas. Elevan la
temperatura. Partículas se cargan de energía del sol, formación de auroras (boreales o
australes).
3. EXOSFERA: SATELITES, CASI SIN N y O, temperatura estable.
4. TROPOSFERA: AVIONES, temperatura disminuye al aumentar altitud, limítrofe separa
troposfer-estratosfera: tropopausa. Regulación térmica.

❖ Formación de auroras: Por la disposición del campo magnético, ambos flujos de partículas
de gas llegan a los polos, finalmente chocan con la magnetósfera, produciendo el fenómeno
luminoso.
1. Oxigeno: Verde, Nitrógeno: Azul e Hidrogeno:Rojo/purpura.
❖ Humedad relativa: disminuye la humedad relativa= disminuye el agua para los MO´s, causa
deshidratación y por tanto la inactivación.

❖ Bioprecipitación: aerobacterias asociadas con los nucleos de condensación y con su

enriquecimiento por efecto de la niebla.

❖ ORIGEN DE LOS MICROORGANISMOS

Corrinete de aire que levante polvo del suelo o agua de los depósitos (mares o ríos), plantas
(polen, esporas) y animales en los actos respiratorios normales y anormales (estornudos,
gotas de pflugge).
❖ TIPOS DE MICROORGANISMOS
1. BACTERIAS ESPORULADAS Bacillus, clostridiu y actinomicetos, gran – menor
proporción
2. CLADOSPORIUM hongo más predominate, aspergillus, penicilium
❖ 70% de las particulas suspendidas integran contaminantes.
❖ 40% los MO´s de los contaminantes
❖ LOS MO´S AFECTAN
1. CALIDAD DE LOS PRODUCTOS
2. CONTAMINACIÓN DE LOS PRODUCTOS
3. DETERIORO DE LOS MATERIALES
4. MALOS OLORES
5. SALUD
❖ PROBLEMAS DE LA CALIDAD DE AIRE INTERIOR
1. CONSENTACION DE # DE PERSONAS EN AREAS CON POCA VENTILACIÓN, AFECTA
PRODUCTIVIDAD Y RENDIMIENTO DEL PERSONAL.
2. SINDROME DEL EDIFICIO ENFERMO, AFECTA ESPACIOS SELLADOS CON ESCASA O
NULA VENTILACIÓN.
▪ SINTOMAS: DOLOR DE ABEZA, ARDOR DE OJOS, ESTORNUDOS, COMEZON,
PROBLEMAS DE APARATO RESPIRATORIO, NAUSEAS, FATIGA, VISION BORROSA.
▪ DEFICIENCIA EN EL CONTROL DE MO´S
❖ VÍAS DE DISPERSIÓN
1. ACTIVIDAD HUMANA
 2. AEROSOLES Y NUCLEOS DE AEROSOLES
3. PARTICULAS DE POLVO
4. ESPUTO (HABLAR, TOSER O ESTORNUDAR)
5. SISTEMA DE EXTRACCIÓN
6. PIEL
7. CORRIENTE DE AIRE
8. CORRIENTE DE CONVECCIÓN POR FUENTES DE CALOR
9. ROPA
10. VENTILACIÓN.
❖ REDUCCIÓN DE MICROORGANISMOS
1. FILTRACIÓN
2. DESINFECCIÓN QUÍMICA
3. IRRADIACIÓN
4. REDUCCIÓN DE PERSONAL EN AREAS DE TRABAJO
5. PROGRAMAS DE LIMPIEZA O SANITIZACIÓN.
❖ SISTEMA DE PRESIÓN POSITIVA
➢ POSITIVA: INYECTAR AIRE LIMPIO PARA REALIZAR BARRIDO DEL AIRE Y RETIRAR
CUALQUIER PARTICULA CONTAMINANTE EN EL AIRE, CONTROLAR HUMEDAD Y
TEMPERATURA
➢ POSITIVO----> SALE NEGATIVO-------> ENTRA
❖ AMBIENTE CERRADO
NO RELACION CON EL MEDIO AMBIENTE, PUEDE SER
1. NO CONTROLADO COMO ESCULEAS, OFICINAS, CASAS, EDIFICIOS, TEATROS, ETC.
2. CONTROLADO Clean romos, puede controlar parámetros como humedad, ruido,
iluminación, temperatura.
❖ PROCEDENCIA Y RESERVORIO DE MO´S
1. EQUIPO
2. MATERIALES
3. ACCESORIOS
4. ANIMALES
5. PLANTAS
6. PERSONAL
7. SISTEMA DE AIRE ACONDICIONADO
❖ VÍAS DE EXPOSICIÓN HUMANA
1. INHALACIÓN
2. INGESTIÓN
3. CONTACTO CON LA PIEL
TOXICIDAD
Propiedad de una sustancia, elemento, compuesto o factor ambiental de causar un efecto letal
(agudo) u otro efecto nocivo a un organismo vivo (subletal).

❖ Toxicidad aguda
Efectos adversos que se producen dentro de un corto tiempo después de la exposición
a una determinada concentración de un agente tóxico.
❖ Concentración letal 50 (LC50…hrs)
Dosis o concentración de una agente que produzca la muerte del 50% de la población
después de un periodo de exposición.
❖ TOXICIDAD CRONICA
Exposición de los organismos durante todo o parte de su ciclo de vida a los
contaminantes ambientales. Se observa los límites de tolerancia de los organismos para
la presencia toxica en agua, suelo, aire, ambiente, laboral, etc.
❖ TÓXICO
Sustancia ajena a un organismo que puede interferir con alguna función ocasionando
algún efecto mínimo o hasta la muerte.
❖ 75% CARECE DE INFORMACIÓN SOBRE SU TOXICIDAD: ANALISIS DISICO-QUÍMICO
❖ PRUEBA DE TOXICIDAD
Bioensayos o ensayos de toxicidad, consiste en la exposición de organismos vivos o
soluciones preparadas o muestras naturales con el fin de evaluar en ella la presencia de
algún compuesto tóxico.
1. In vitro: efectos sobre la salud
2. In situ: efectos ecológicos
❖ BIOENSAYOS
1. Efectos en la salud: uso de componentes subcelulares (enzimas. DNA, RNA),
células aisladas (cultivo de células), secciones de tejido u órganos aislados.
2. Efecto ecológico: determinar toxicidad aguda de compuestos químicos sobre los
organismos acuáticos que se presentan en los diferentes niveles tróficos de la
cadena alimentaria.
• REQUIERE TIEMPO RELA. AMPLIO (48HR-30 A 40 DÍAS) AUMENTANDO SU
COSTO
• BIOENSAYOS MICROBIANOS: CONFIABLES Y REPRODUCIBLES PARA
EVALUAR LA TOXICIDAD AGUDA DE MUESTRAS AMBIENTALES (AGUA,
SEDIMENTO Y EFLUENTES INDUSTRIALE), RÁPIDOS, SENSIBLES Y
ECONÓMICOS.
VENTAJAS:
• CICLOS DE VIDA CORTOS
• RESPONDEN RÁPIDAMENTE A LOS CAMBIOS EN EL MEDIO AMBIENTE
• SE PUEDEN TOMAR POBLACIONES MÁS NUMEROSAS DE BACTERIAS
• NO ESTNA PROTEGIDOS POR LA LEGISLACIÓN
• TASA DE CRECIMIENTO RÁPIDA
• MÁS ECONOMICA POR LOS CULTIVOS EN LABORATORIO
• RUTAS BIOQUÍMICAS SIMILARES A LA DE LOS ORGANISMOS SUPERIORES
❖ MICROBIOENSAYOS
EXPOSICIÓN DE UN ORGANISMO PEQUEÑO (UNICELULAR O MULTICELULAR) A UNA
MUESTRA PARA MEDIR SU EFECTO ESPECÍFICO.
 GAMA AMPLIA DE MICROORGANISMOS QUE PUEDEN SER UTILIZADOS PARA ESTUDIO
DE TOXICIDAD.
1. BACTERIAS
2. PROTOZOARIOSALGAS MICROSCÓPICAS
3. HONGOS
4. LEVADURAS
5. INVERTEBRADOS PEQUEÑOS (ROTÍFEROS, PULGAS DE AGUA Y NEMATODOS).
❖ EFECTO DE MO´s TÓXICOS
1. ANIVEL MATERIAL GENETICO O DESNATURALIZACIÓN DE PROTEINAS
(HALOGENOS).
2. ALTERACIÓN DE LA MEMBRANA BACTERIANA, LIBERACIÓN DE RNA, DNA,
PROTEÍNAS Y OTROS COMPUESTOSORGANICOS
3. DESPLAZA CATIONES (Na+,Ca++) DE SITIOS DE ADSORCIÓN
4. ACTIVIDAD ENZIMATICA
5. CONTENIDO DE ATP
6. BIOLUMINISENCIA
❖ ENSAYOS ENZIMÁTICOS
La inhibición de su actividad puede ser correlacionada con algún factor de toxicidad para
la célula.
1. Oxidorreductasas(deshidrogenasa, catalasa, peroxidasa).
2. Hidrolasas (lipasa, fosfatasa, ureasa)
3. B-galactosidasa (escherichia coli: TOXI-chrometest)

Indicador indirecto de la actividad microbiana e indica el potencial de los MO´s del

suelo a degradar compuestos óganicos.

❖ TOXI- Chromotest
Detecta sustancias toxicas en el agua (productos químicos, farmacéuticos, etc).
Es un ensayo bacteriano basado en la capacidad de compuestos tóxicos y antibióticos
para inhibir la síntesis de una enzima inducible (de novo) de la beta-galactosidasa, de la
cepa Escherichia coli.
Interrumpe muchas funciones metabólicas y así con la síntesis de enzima, resultado en
un decremento del color desarrollado.
❖ ENSAYOS CON NIVELES DE ATP
Mecanismo de reacciones bioluminiscentes permitió estudio de ensayos ATP.
LOMINICENCIA BACTERIANA: MO´s marinos. Photobacterium (Vibrio) fisheri,
Photobacterium phosphoreum, Beneckea herveyi.
❖ MICROTOX
Catalizada por la luciferasa en bacterias, oxidación por oxigeno molecular de un aldehído
mirístico o tetradecanal y un flavin-mononucleotido reducido (FMNH2), emisión de luz
color verdeazulado, emisión in vitro 490 nm.
1. Bioluminiscencia bacteriana ligada al sistema de transporte de electrones en la
respiración celular, disminución de luminiscencia---disminución en la
respiración.
❖ AMES TEST
Estudia el efecto de compuestos químicos con actividad mutagénica.
Técnica de inducción de reversión de un gene por mutágenos de la cepa typhimurium
auxitrofa para histidina.
 ❖ SOS CHROMO TEST
Eventos celulares en bacterias sos es expuesta a un agente genotóxico.
1. Utiliza cepa E.coli genéticamente modificada
2. El gene SOS repara la región protonada del genoma que es responsable de la
actividad de genes SOS unidos al gene beta-gal responsable de la producción de
la enzima beta-galactosidasa.
❖ MOVILIDAD
Bacteria Spirillumvolutans es extremadamente móvil, si se altera pierde su coordinación
flagelada y movilidad típica frente a sustancias tóxicas.

AGUA
ORIGEN

1. AGUAS DULCES NATURALES

• LLUVIA
• SUPERFICIALES: DESHIELOS, LAGOS, RIOS, MARES
• PROFUNDAS: POZOS: FREÁTICA, SEMISURGENTE, SURGENTE
2. ECOSISTEMA DE AGUA DULCE (LIMNOBIOS) : LAGOS Y ESTANQUES: ARROYOS Y RÍOS:
HUMEDALES Y EMBALSES
3. AGUA SALADA (HALOBIOS): OCÉANOS: MARISMAS Y MANGLARES: ARRECIFE DE CORAL
❖ SISTEMA DUCEAXUÍCOLAS

LENTICOS:

1. NO TIENE DIRECCIÓN DEFINIDA DE CIRCULACIÓN DEL AGUA

2. DEPENDE DEL VIENTO
3. NO HAY DIMENSIÓN ESPACIAL PREPONDERANTE
4. LOS CAMBIOS ESPACIALES EN LAS COMUNIDADES Y CARACTERISTICAS FISICOQUIMICAS
NO SON TAN MARCADOS
5. PUEDEN PRESENTAR ESTRATIFICACION VERTICAL DE PROPIEDADES ABIÓTICAS Y
COMUNIDADES

LOTICOS

1. AGUA SE DESPLAZA EN DIRECCIÓN DEFINIDA

2. DIMENSION LONGITUDINAL PREDOMINA EL ANCHO
3. CAMBIO GRADUAL DESDE LA NACIENTE HACIA LA DESENBOCADURA, PROPIEDADES
FISICOQUIMICAS COMO COMUNIDADES
4. ESTRATIFICACION VERTICAL ES MENOS FRECUENTE DEBIDO AL FLUJO TURBULENTO

❖ CARACTERISTICAS DE LOS LAGOS

1. ACUMULACIÓN DE MATERIAL ORGANICO
2. DEPENDE DE LA ESTACIÓN SE PUEDE DIVIDIR EN EPILIMNIO O HIPOLIMNIO
3. ELEVADA PRODUCTIVIDAD DE MACROFITOS (PLANTAS ACUATICAS)
4. TERMOCLIMA: ZONA DE DESCENSO RAPIDO DE TEMPERATURA
5. CONCENTRACIÓN DE OXIGENO Y NUTRIENTES INORGANICOS FAVORABLES
 6. LIMITACIONES DE CANTIDAD DE OXÍGENO
7. PRODUCTIVIDAD: OLIGOTROFICOS Y EUTRÓFICOS
8. PH ALCALINOS, FAVORECE ACTIVIDAD PRIMARIA
9. DEGRADACIÓN DE IGNOCELULOSA LIMITADA
10. VARIACIÓN DE PH
❖ SISTEMÁS SALOBRES: agua que tiene más sal disuelta que el agua normal de ríos y lagos,
pero menos que el océano.
❖ ESTUARIO: Desenbocadura, en el mar, de un rio amplio y profundo en intercambia con
esta agua salada y agua dulce, debido a las mareas.
1. Productividad alta
2. Fotosíntesis casi supera a la actividad respiratoria
❖ ESTRATIFICACIONES: Arreglo que presenta los organismos que aparecen dentro de un
ecosistema.
1. vertical: Zona limnética------>profunda nivel de compensación luminico
2. horizontal: zona litoral ---->pelágica= oceanica

términos de separación periocidad.

❖ Clasificaciones penetración de luz

1. Zona fótica: presencia de luz
• eufotica lugar una penetración eficaz de la luz hasta el nivel de compensación.
• Sedimento superficial: alta concentración en O2, NO3, Fe III.
• Productividad primaria--- pelagico limitada por falta de nutrientes minerales.
• Primaria: bacterias y algas microscópicas
• EPIPELAGICA: 0-200 m, calida
• Invertebrados y peces habitan en ambiente homogéneo y transparente
2. COMPENSACIÓN
• Intensidad de luz en el mar dependiente de la turbidez y profundidad
• Escasa luminosidad, fotosisntesis neta =0
3. AFÓTICA
• Por debajo de la zona de compensación
• Betipelagica : 200-6000 mts oscuras y fría

❖ Zona reducida: concentración de O2 nula, hay H2S, no natación rápida de peces,

alimento escaso, metabolismo lento, baja temperatura, elevada presión en fondos
oceánicos.
❖ TEMPERATURA
1. EPILIMNION: AGUAS SUPERFICIALES CÁLIDAS, DE BAJA DENSIDAD.
2. TERMOCLINA: ZONA DE CAMBIO RÁPIDO DE TEMPERATURA
3. HIPOLIMNIO: AGUAS PROFUNDAS FRÍAS DE ALTA DENSIDAD

❖ EUTROFICACIÓN
El enriquecimiento de las aguas con compuestos ricos en nitrógeno y fosforo,
generalmente provenientes de actividades humanas.
❖ OLIGOTROFICOS: Pobre en nutrientes
1. Baja concentración de nutrientes
2. Productividad primaria baja
3. Mayor profundidad
 4. Ricos en oxígeno.
❖ Lago oligotrófico
1. Baja productividad primaria
2. Baja producción de algas
3. Aguas sumamente claras (alta calidad de agua potable)
4. Aguas con mucho oxígeno. Su contenido de oxígeno es mayor en lagos
profundos, por tener volúmenes hipolimnéticos más grandes.
5. Actividad biológica mínima
6. Mucha penetración de luz
❖ LAGO MESOTRÓFICO
1. Aumento de la concentración de nutrientes
2. Desarrollo de fitoplancton
3. Aumento de turbidez
4. Reducción de comunidad vegetal sumergida
5. Agua clara
6. Aumento de la actividad biológica
7. Concentración de O2 media
8. Penetración de Luz
❖ LAGO EUTRÓFICO
1. Acumulación excesiva de nutrientes (N y P)
2. Productivos
3. Turbios
4. Ricos en algas
5. Fluctuaciones de oxígeno disuelto en superficie y profundidad
6. Altos niveles de productividad
7. Baja diversidad
8. Poca penetración de luz
❖ ORGANISMOS ACUÁTICOS
1. Fitoplancton
2. Zooplancton
3. Necton: nadan libremente, moverse de un lugar a otras grandes distancias
(migraciones). Aguas dulces: peces, algunos anfibios y otros grupos.
4. Bentos: Viven en el fondo o fijos a él, dependen de éste para su existencia,
mayoría invertebrados.
5. Neuston: organismos nadan o caminan sobre la superficie del agua. Insectos la
mayoría.
6. Pleuston
7. Seston: toda materia suspendida en la columna de agua, tanto viva como
muerta. 1.-Plancton: Fitoplancton y zooplancton ORGANISMOS SUSPENDIDOS,
CARECE DE MEDIOS LOCOMOCION, MUEVEN EN EL MOVIMIENTO DE LAS
MASAS DE AGUA O CORRIENTES. 2.-Tripton. ORGANISMOS EN SUSPENCIÓN Y
RESTOS ORGANICOS COMO MUDAS DE COPÉPODOS, PELLETS, ETC.
8. Perifiton: organismos vegetales y animales que se adhieren a los tallos y hojas
de plantas con raíces fijas en los fondos.
9. Psammon: clasificación de los tipos biológicos de organismos acuáticos
errantes, del movimiento de los materiales de fondo que dejen intersticios entre
los granos de arena.
SIMBIOSIS:
vida en conjunto do dos organismos disimilares, normalmente en intima asociación, y por lo
general con efectos benéficos para al menos uno de ellos.

1. Interacciones intraespecíficas: PRINCIPIO DE ALLEE

Dentro de la misma población. Interacciones positivas: cooperación y negativas:
competencia.
❖ POSITIVA: Prolongado periodo de latencia o falla de crecimiento cuando sembramos con
un inóculo muy pequeño (problema en generar colonias a partir de una sola célula).
QUORUM SENSING.
❖ DOSIS MINIMA INFECCIOSA DE POBLACIONES PATÓGENAS: # MÍNIMO DE MO´s QUE
CAUSAN INFECCIÓN.
❖ NEGATIVAS: Disminuyen la velocidad de crecimiento de una población, predomina
cuando la densidad de población es alta. Compiten por el mismo sustrato.
GENES SUICIDAS: ESCHERICHIA COLI GEN HOK: codifica péptido hok, daña membrana y
muere la célula .
Acumulación de productos metabólicos actuando con mecanismo de retroalimentación
negativo