Informatica para Biologos

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Informática Aplicada a Biología

Presentación de la asignatura

Departamento de Ciencias de la
Computación e Inteligencia Artificial
Grupo A
Profesor teoría:
• Rafael Alcalá Fernández ([email protected])

Profesores prácticas:
• Rafael Alcalá Fernández ([email protected])
• Jesús Alcalá Fernández ([email protected])
Horarios
TEORÍA
 X 11:00 – 12:00 hrs
 J 11:00 – 12:00 hrs

TUTORÍAS (Edif. Mecenas — Módulo B)


 L 14:00-14:30
 M 10:00-11:00 y 12:00-12:30
 J 10:00-11:00 y 12:00-12:30
 V 12:00-14:30
Horarios prácticas
Cuatro Grupos
 Lunes: 12:00 – 14:00 (A1) – Prof. Rafael Alcalá
 Martes: 12:00 – 14:00 (A2) – Prof. Jesús Alcalá
 Miércoles: 12:00 – 14:00 (A3) – Prof. Jesús Alcalá
 Jueves: 12:00 – 14:00 (A4) – Prof. Jesús Alcalá

Los grupos se organizarán por orden alfabético.


Aula del decanato: Aula-Inf O01.
Nota: Revisar el grupo de prácticas asignado el
Viernes 15 de Septiembre en prado porque el
Lunes 18 de Septiembre empiezan las prácticas.
Nota: No se guarda la nota de prácticas del año
pasado.
Why Biology trainees should gain
computational skills?
La informática es:
1.Competencia clave para la biología del S.XXI
 La biología es una ciencia cada vez más cuantitativa.
 Nuevos descubrimientos requieren lidiar con enormes cantidades de
datos y métodos de análisis avanzados.
2.Habilidad transversal.
3.Promueve el desarrollo de habilidades científicas
(planificación lógica, consistencia, reproducible research, análisis
estadístico)
4.Oportunidad para diferenciarse en el mercado laboral
 (Todavía) pocos biólogos tienen habilidades computacionales
avanzadas

Fuente: Dr. C. Bergman, Univ. of Mancherster (UK)


https://caseybergman.wordpress.com/2012/07/31/top-n-reasons-to-do-a-ph-d-or-post-doc-in-bioinformaticscomputational-biology/
Objetivos de la asignatura
El objetivo general de esta asignatura es proporcionar
una formación básica en el campo de la Informática
para su potencial aplicación a la Biología.

Algunos ejemplos serían:


•Realizar búsquedas de información en Navegadores y
Bases de datos especializadas.
•Manejar Herramientas Ofimáticas para tratamiento y
análisis de datos.
•Conocer y manejar software de Base de Datos.
•Realizar programas de ordenador sencillos para
resolver problemas concretos en biología.
Estructura de la asignatura
Introducción a la
Informática para su
aplicación en Biología

¿Cómo funciona un ¿Cómo se usan en


ordenador? biotecnología

Bioinformática

Historia de la
Hojas de
Informática
Cálculo

Python Bases de Datos


¿Qué hay dentro de un
ordenador?

¿Qué hace un
ordenador

7
Estructura de la asignatura
Python

Datos

Programación
Vectores y
Variables y Matrices
operaciones

Listas, Tuplas, Condicionales:


if-elseif-else Funciones
Diccionarios

Bucles:
for y while
Contenidos de Teoría
TEMA 1. INTRODUCCIÓN A LA INFORMÁTICA.
Historia. Arquitectura de un ordenador. Tipos de ordenadores.
Hardware y Software. Redes de ordenadores. Internet.
TEMA 2. REPRESENTACIÓN DE LA INFORMACIÓN.
Representación de texto, datos numéricos e imágenes.
TEMA 3. BASES DE DATOS.
Conceptos básicos. Diseño de BD Relacionales.
TEMA 4. FUNDAMENTOS DE PROGRAMACIÓN.
Etapas de la programación. Concepto de Algoritmo. Lenguajes de
programación.
TEMA 5. FUNDAMENTOS DE PROGRAMACIÓN EN
Python.
Introducción a la programación en Python.
TEMA 6. INTRODUCCIÓN A LA BIOINFORMÁTICA.
Introducción, tecnologías y visión general de la Bioinformática.
Especialización en Biotecnología

MÁSTER UNIVERSITARIO EN BIOLOGÍA MOLECULAR APLICADA A


EMPRESAS BIOTECNOLÓGICAS (BIOENTERPRISE).

• El eje central es el desarrollo y la innovación en biotecnología, y en su caso


la investigación aplicada.
• Se combinan enseñanzas avanzadas de Biología Molecular aplicada y de
empresa, lo que junto a las prácticas empresariales, en las que se
desarrollará un mini proyecto, aseguran la preparación para la inserción
profesional.
• Algunas asignaturas directamente relacionadas con la informática:
ANÁLISIS INFORMÁTICO EN BIOLOGÍA DE SISTEMAS (OBLIGATORIO)
ALGORITMOS EN BIOINFORMÁTICA (OPTATIVO)

Enlaces de interés:
http://masteres.ugr.es/bioenterprise/
Contenidos de Prácticas

Prácticas Excel: 3 sesiones


Prácticas Bases de Datos: 2 sesiones
Prácticas de Python: 6 sesiones.
Seminario de Python.

Trabajos a entregar: Excel y Python


Cada semana
2 hs. de Teoría
2 hs. de Prácticas
4 hs. de trabajo autónomo

Suficiente para
aprender la asignatura
Evaluación
Actividades
Ponderación Item Ponderación
formativas

Examen parcial 40 %
Parte teórica 50 %
Examen final 60 %
Evaluación
33 %
contínua individual
Parte práctica 50 % Entrega Excel 33 %

Entrega Python 33 %

Es necesario aprobar cada parte (Parte teórica y Parte


práctica) por separado. Mínimo de 4 para hacer media.
Fechas de exámenes

Después del tema de


Examen Parcial
BD. A fijar.

Convocatoria ordinaria 15 Enero (M1)

Convocatoria extraordinaria 5 Febrero (T1)


Información adicional
PRADO (http://prado.ugr.es)

Correo de ugr

 https://webmailest.ugr.es/

Cuenta de correo de ugr


 http://csirc.ugr.es/informatica/correoelectronico
thehourofcode.com
https://studio.code.org
Laberinto clásico

https://studio.code.org/hoc/6
MineCraft

https://studio.code.org/s/mc/stage/1/puzzle/7
Al final del cuatrimestre…

https://studio.code.org/s/20-hour/stage/19/puzzle/4

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