Realización de Un Árbol Filogenético Con El Programa Mega

1
R Re ea al li iz za ac ci i n n d de e u un n r rb bo ol l f fi il lo og ge en n t ti ic co o c co on n e el l p pr ro og gr ra am ma a m me eg ga a
Lai alfaro tang 2012161002, Viviana Estupian Garzn 2012161021 y Karen Sampayo caas
2012161044
Estudiantes de medicina de la universidad del magdalena

Resumen:
El da viernes trece de septiembre del
2013, se realizo en el laboratorio de
Histopatologa, la practica nmero
cuatro de gentica, en donde se
hicieron unas series de exposiciones,
entre las cuales se encontraba la del
programa MEGA, en la que se
explicaba su importancia, la forma de
obtenerlo y la manera de utilizarlo.
Despus de esto el docente lvaro
Acosta, con el fin de que cada grupo
de laboratorio aprendiera a utilizar el
programa los coloco la tarea de
realizar un rbol filogentico con dicha
herramienta, el cual est presente en
este artculo.
Palabras claves:
MEGA, rbol filogentico y
alineamiento de secuencias.

aBSTRACT:
On Friday, September 13, 2013, was
conducted in the laboratory of
Histopathology, practice genetic
number four, where he made a series
of exhibitions, among whom was the
MEGA program, which explained its
importance , how to get and how to
use it. After this the teacher Alvaro
Acosta, so that each lab group learned
to use the program placed the task of
performing a phylogenetic tree with
this tool, which is present in this article.
Keywords:
MEGA, phylogenetic tree and
sequence alignment.

Introduccin:
Las siglas MEGA significan Molecular
Evolutionary Genetic Analysis
(Molecular Evolutiva Anlisis De
Gentica) es un programa que se
utiliza para llevar a cabo la alineacin
de secuencias, inferir rboles
filogenticos, bases de datos basadas
en la web, las tasas de estimacin de
la evolucin molecular, inferir
secuencias ancestrales, y las pruebas
de hiptesis evolutivas.
Un alineamiento de secuencias es la
herramienta ms usada en
bioinformtica y uso va desde la
identificacin de regiones o dominios
en un par de secuencias hasta la
comparacin de un grupo de
secuencias para anlisis evolutivos y
de filogenia
3
. Es una forma de
representar y comparar dos o ms
secuencias o cadenas de ADN, ARN,
o estructuras primarias proteicas para
resaltar sus zonas de similitud, que
E El la ab bo or ra ac ci i n n d de e r rb bo ol l F Fi il lo og ge en n t ti ic co o c co on n M ME EG GA A

2
podran indicar relaciones funcionales
o evolutivas entre los genes o
protenas consultados. El alineamiento
de secuencias biolgicas consiste en
establecer un segmento entre ellas
donde el nmero de coincidencias sea
mximo. Cuando se analizan
secuencias es comn utilizar los
trminos similitud y homologa de
forma indiscriminada, pero estos dos
trminos hacen referencia a conceptos
distintos
4
.
Un rbol filogentico es un rbol que
muestra las relaciones evolutivas entre
varias especies u otras entidades que
se cree que tienen una ascendencia
comn
2
. Como su nombre indica, se
trata de dibujos con aspecto de rbol;
en la base del tronco estara el
antepasado comn de todos los
organismos, y de l partiran unas
ramas, de las cuales saldran ramas
ms finas, y de stas ramitas, etc.,
hasta llegar a las especies actuales,
dispuestas en los extremos de las
ltimas ramificaciones
5
. Es
una clasificacin cientfica de
las especies basada nicamente en
las relaciones de proximidad evolutiva
entre las distintas especies,
reconstruyendo la historia de su
diversificacin (filognesis) desde el
origen de la vida en la Tierra hasta la
actualidad. Para construir este tipo de
clasificacin se recurre ahora
generalmente al mtodo cladstico,
ideado por Willi Hennig.

Materiales:
Tener la herramienta MEGA instalado
en un computador.

Mtodos:
Arboles filogenticos con
informacin del MEGA.
1. Se le da click a philogen, luego
de le da click a constuct/test
neighboor
2. Se busca el ejemplo del MEGA
que se desee utilizar, se le da
aceptar, luego aparece un
cuadro en donde se le da click
a compute.
3. Y aparece el rbol filogentico.

rbol filogentico, con la
informacin del BLAST:
1. Click en BLAST seleccionar
secuencia. Se busca la
secuencia que se quiere utilizar.
2. Dar click en FAST, luego en
Add to alignment
3. De da click en secuencia de
protena, seguido de FAST
nuevamente. As
sucesivamente.
4. Luego se le da click n
alineamiento en el icono de la
w.
5. Se guarda.
6. Se le da click a philogen, luego
de le da click a constuct/test
neighboor.
7. Se busca lo guardado
anteriormente. Luego aparece
un cuadro en donde se le da
click a compute.
8. Y aparece el rbol filogentico.


3
Resultados:
La elastina humana gen del exn 13

Especies y alineamiento:


4

Discusin y Conclusin:
Salieron dos subgrupos. La elastina
humana en su exon 13 se parece ms
a la del cerdo (sus scrofa) especies
como el ratn, el toro y otra especie
bovina estn en otro subgrupo y tienen
menor relacin con la elastina
humana.
El ratn novergicus y el felis catus
(gato) tienen similitud para el exn de
esa protena pues estn en la misma
lnea.
Pan troglodites (especie de
chimpance) est en el mismo
subgrupo de la elastina 13 humana y
tiene un ancestro comn para ese
grupo.

Bibliografa:
1. Disponible en:
http://www.megasoftware.net/
2. Filogenia Arbol Filogenetico y
Clandroma. Disponible en:
http://igbio.net84.net/Actividade
s%20web%20Lim/1bcarbolfilog
enetico/1bcarbolfilogenetico.ht
ml
3. Universidad de los Andes.
Venezuela. Bioinformatica.
Alineamientos de Secuencias:
Http://Eventos.Redclara.Net/Indi
co/Getfile.Py/Access?Resid=21
&Materialid=Slides&Confid=224
4. Universidad Nacional E
Colombia Bogot. Biblioteca
computacional .Alineamiento
De Secuencia. Disponible en:
http://www.virtual.unal.edu.co/c
ursos/ingenieria/2001832/leccio
nes/alineamiento.html
5. Universidad De Almera. Area
De Botnica. Evolucin,
Filogenia, Cladstica. Disponible
en:http://www.ual.es/GruposInv/
myco-ual/clados.htm

5

Realización de Un Árbol Filogenético Con El Programa Mega

Cargado por

Copyright:

Formatos disponibles

Realización de Un Árbol Filogenético Con El Programa Mega

Cargado por

Información del documento

Derechos de autor

Formatos disponibles

Compartir este documento

Compartir o incrustar documentos

Opciones para compartir

¿Le pareció útil este documento?

¿Este contenido es inapropiado?

Copyright:

Formatos disponibles

Realización de Un Árbol Filogenético Con El Programa Mega

Cargado por

Copyright:

Formatos disponibles

1

También podría gustarte