Ecologia Micro

ECOLOGA MICROBIANA
Mara Cecilia Arango Jaramillo
Microbiologa del ambiente o Ecologa microbiana: Estudio de las interrelaciones entre los microorganismos, entre ellos con otros organismos y con el ambiente que los rodea
Los microbios son las criaturas ms minsculas en la tierra, pero tienen un impacto enorme en nosotros y en nuestro ambiente:
Estn en cualquier lugar de nuestro entorno: suelo, agua y aire. Son los que estn en mayor nmero y poseen la mayor capacidad para efectuar cambios en cualquier ecosistema
La ecologa microbiana es compleja debido a la mltiples interacciones de los microorganismos.
CARACTERSTICAS DE LOS ECOSISTEMAS MICROBIANOS

Caractersticas de los ecosistemas microbianos:
Capacidad de los microorganismos para transformar el ambiente Adaptacin y mutacin de los microorganismos Tamao del hbitat Suministro de alimento Diversidad de especies microbianas Dinmica de poblaciones Asociaciones microbianas en ecosistemas
Capacidad de los microorganismos para transformar el ambiente

La naturaleza y la gran magnitud de las actividades metablicas de los microorganismos
Producen importantes cambios en el ambiente

Cambios iniciales:
Transformacin del sustrato Agotamiento de alimentos Elaboracin de productos finales
Los microorganismos que participan en el primer nivel de cambio productos inadecuados para su utilizacin posterior Otros microorganismos los utilizan reponen los nutrientes
Caractersticas de los microorganismos para desarrollar su actividad de transformacin ambiental: rea grande en contacto con el sustrato que facilita la accin enzimtica (Volumen/rea) Rpido ndice de desarrollo Gran capacidad de los diferentes microorganismos para degradar todos los compuestos naturales en el ambiente
Adaptacin y mutacin
La supervivencia y el crecimiento de una especie dentro de una comunidad biolgica requieren Capacidad para ajustarse a las condiciones ambientales cambiantes.
Genotipo: La informacin gentica de cada individuo Fenotipo:La expresin del genoma afectada por el medio ambiente
Los microorganismos se acomodan a los cambios temporales del ambiente Mediante la adaptacin fenotpica: Respuesta del microorganismo a cambios temporales Est limitada por el genotipo.
Las condiciones ambientales determinan que diferentes tipos genticos de microorganismos puedan competir con otros Slo los mejor ajustados pueden sobrevivir
Muchos microorganismos pueden crecer a lo largo de una amplia gama de temperaturas. Su efectividad metablica no es la misma a las temperaturas extremas.
ptima
La capacidad adaptativa est entre los lmites del genotipo.
Temperatura
Cuando sucece un cambio fsico o qumico como: Teminacin del alimento Cambios drsticos de temperatura o pH
Las condiciones se hacen ms favorables para otra especie

La primera dejar su lugar a la mejor adaptada
Accin selectiva de los factores ambientales sobre las poblaciones de microorganismos

Bacterias
Sucesin ecolgica
Ciliados vida libre Zooflagelados Fitoflagelados Ciliados fijos
Sarcodina Suctoria
Tiempo
Predominio relativo de microorganismos de un lote de Mara Cecilia Arango Jaramillo desperdicios orgnicos (modificado de Pelczar, 1982)
La capacidad de un microorganismo de adaptarse al ambiente es hereditaria , pero el estado fenotpico que resulta de la adaptacin, puede no ser heredado.
La adaptacin puede ser: Evolutiva Fenotpica o fisiolgica
1. Adaptacin evolutiva
Esta adaptacin incluye los cambios del genotipo por seleccin Estos cambios se producen por: Mutacin espontnea Intercambio gentico bacteriano
Mutacin espontnea o inducida
Hay oportunidades para un cambio en el genotipo como resultado de una mutacin.

AAT G C AT T G C TA AAT G C AT T G C TA AAT G G AT T G C TA
El mutante es un organismo cambiado permanentemente. Si es capaz de prosperar en el ambiente, el mutante se perpeturar, de lo contrario perecer.
Intercambio gentico bacteriano Los cambios genotpicos en las clulas tambin se efectan por el intercambio de genes bacterianos en la naturaleza Transformacin Transduccin Conjugacin
Transferencia gnica mediante transduccin.

Transduccin: un bacterifago se adhiere a una bacteria y le inyecta su ADN
Se produce entre bacterias que viven en el epiliton, o pelcula gelatinosa que recubre las rocas sumergidas de los ros
Mara Cecilia Arango Jaramillo Robert V. Miller, Scientifican american,1998
Mara Cecilia Arango Jaramillo Robert V. Miller, Scientifican american,1998
Transferencia de plsmidos por conjugacin

En las bacterias gramnegativas, una clula donadora establecen contacto con una clula receptora mediante un pili, facilitando as el acercamiento de las dos bacterias Se forma un puente (poro) entre las dos clulas.
Robert V. Miller, Scientifican amarican,1998
Robert V. Miller, Scientifican amarican,1998
En la bacterias gram-positivas la conjugacin es similar. Pero, para atraerse, las bacterias no utilizan pili sino seales qumicas.
Transferencia de genes por transformacin

Las clulas absorben ADN libre liberado por una bacteria muerta. El ADN es atrapado e introducido por un complejo protenico en la superficie de la bacteria. Enzimas degradan una de las dos cadenas de la molcula. La otra cadena puede acabar integrndose en el cromosoma de la bacteria
Tambin puede ocurrir en bacterias gramnegativas a travs de un mecanismo distinto.
Transformacin en una bacteria gram-positiva

Mara Cecilia Arango Jaramillo Robert V. Miller, Scientifican amarican,1998
Robert V. Miller, Scientifican amarican,1998 Mara Cecilia Arango Jaramillo http://193.146.205.151/web/articulos/articulos.htm
2. Adaptacin fisiolgica o fenotpica

Es la respuesta de los organismos a los cambios temporales Esta adaptacin o ajuste se da entre los lmites del genotipo
Ocurren en todos los individuos de una poblacin expuestos al cambio
En altas temperaturas todos los microorganismos pierden sus flagelos y esta condicin permanece por varias generaciones Cuando son incubados a temperatura normal, recuperan los flagelos
Interacciones genoma - ambiente

Genoma fijo en ambiente variable Genoma variable en ambiente fijo Genoma variable en ambiente variable
Genoma fijo en ambiente variable La adaptacin en este Microorganismos capaces de crecer en caso es fisiolgica o un medio mnimo a fenotpica temperatura moderada Los microorganismos deben adaptarse a la pueden crecer a temperaturas elevadas variabilidad de las si se les proporcionan condiciones para factores de crecimiento sobrevivir adicionales
Genoma variable en ambiente fijo Adaptacin gentica : Los factores ambientales no cambian, el genoma es el factor variable: Por mutacin espontnea o inducida Por intercambio gentico
Genoma variable en ambiente variable Es una adaptacin evolutiva La supervivencia de los microorganismos mejor adaptados a los cambios permiten la seleccin de un genoma ms que otro. Las mutaciones y el intercambio de genes intervienen en la adaptacin La naturaleza selecciona los mejor adaptados
Dinmica de poblaciones
Un tipo de microorganismos prospera en su ambiente slo mientras las condiciones son favorables para su crecimiento y supervivencia.
Un cambio fsico o qumico:

agotamiento de nutrientes cambio en el pH o temperatura concentracin de oxgeno
H
hace las condiciones de crecimiento ms favorables para otra especie
H
el organismo adaptado a las condiciones que prevalecan antes, cede su lugar a un organismo mejor adaptado a las Mara Cecilia Arango Jaramillo nuevas.
Las condiciones ambientales tienen efecto selectivo sobre las poblaciones microbianas.
Tamao del hbitat

Son de diferentes tamaos:
Una laguna o un estanque La rizosfera Microhbitats dentro de ellos donde una comunidad se establezca La boca o los dientes de los animales El rumen de los herbvoros Un tronco cado
La localizacin y delimitacin de los hbitats microbianos no siempre son fciles de precisar

Suministro de alimento
En los hbitats naturales la cantidad de alimento es mucho menor que en medios de laboratorio Los cambios en la naturaleza qumica y en la composicin de los materiales nutritivos tienen influencia selectiva en la microbiota
Como la concentracin de nutrientes flucta, resultan alzas y bajas en el desarrollo
Adems, una especie puede depender de otra para la transformar los sustratos en alimento disponible o degradar sustancias txicas
Diversidad de especies microbianas

Los microbios nos rodean por todas partes: aire, agua, suelo. 1 gramo de suelo frtil
contiene 1.000.000.000 microbios miles de especies.

Muchos aos de evolucin han creado una impresionante e inimaginable diversidad de microbios.
A pesar de su abundancia: La mayora de los tipos de microbios siguen siendo desconocidos. Se estima que conocemos menos el de 1 % de las especie microbianas en la tierra. De ms de un milln de especies de bacterias que se sospecha que existen, solo cerca de 4200 estn descritas.
Microorganismos en ambiente natural raramente se encuentran en cultivos puros. Las transformaciones qumicas realizadas por consorcios de microorganismos no pueden determinarse recopilando las propiedades bioqumicas de cada especie en cultivo puro Esto se debe a ocurren varios tipos de interaccin entre especies, que no se dan en cultivo puro.
Asociaciones microbianas en ecosistemas

Los microorganismos de un ecosistema presentan asociaciones e interacciones : Entre microorganismos Entre microorganismos y de organismos superiores.
Entre microorganismos diferentes: Neutralismo, 0/0: Dos organismos tan diferentes que no compitan por alimento ni se inhiben aunque ocupen el mismo espacio Es muy difcil que dos poblaciones de microorganismo que estn en contacto ntimo no se afecten
Competencia, -/-: Los organismos que se establecen el mismo nicho ecolgico Necesitan los mismos alimentos y condiciones ambientales tienen gran influencia entre s El mejor adaptado predomina o elimina completamente a los otros
Las colonias que en En las una placa estn fermentaciones muy juntas compiten lcticas al principio por alimento y hay muchos tipos de espacio bacterias pero al final predominan una o dos
En cobayos Entamoeba histolytica es incapaz de producir amebiasis clnica cuando Escherichia coli est presente
Antagonismo, +/-: un caso de competencia? Antibiosis: Una mixobacteria aislada de un estanque de peces lisa muchas especies de algas verdeazules unicelulares o filamentosas y otras bacterias.
Pseudomonas aeruginosa produce pigmentos que inhiben la germinacin de Aspergillus terreus

Staphylococcus aureus produce sustancias antifngicas que causan alteraciones e hinchazn en las hifas de Aspergillus terreus
Lactobacillus produce y tolera condicianes marcadas de acidez Otros microorganismos no son capaces de desarrollarse en las condiciones establecidas por los lactobacilos
Escherichia coli y Staphylococcus aureus crecen bien en cultivo puro pero cuando crecen juntas, S. aureus crece menos, porque E. coli tiene un tiempo de generacin ms corto y agota rpidamente los nutrientes
El hongo Geotrichum candidum Metaboliza cido lctico que si se acumula No permite el crecimiento de otros microorganismos
Mutualismo, +/+: Cuando la relacin no es obligatoria se le llama cooperacin
Simbiosis en que ambos organismos resulta benefiados
Intercambio de alimentos entre dos especies, sintrofismo:

Lactobacillus arabinosus y Streptococcus fecalis
Ambas bacterias crecen en simbiosis
Lactobacillus arabinosus Streptococcus fecalis
Incubacin en horas
Saccharomyces cereviciae produce ornitina a partir de arginina Escherichia coli transforma la ornitina en putrescina
Escherichia coli y Steeptococcus fecalis: Creciendo juntas producen putrescina a partir de la arginina Separadas no la producen
Streptococcus cremoris y Streptococcus lactis, creciendo juntas producen mayor cantidad de cido lctico que cuando crecen separadas
Thiobacillus ferroxidans y Beijerinkia lactocogenes, en simbiosis
Thiobacillus ferroxidans cultivo puro Beijerinkia lactocogenes cultivo puro
Tiempo en horas
Produccin de metabolitos diferentes. Thiobacillus ferroxidans y Beijerinkia lactocogenes en la descomposicin de triturado

Mara Cecilia Arango Jaramillo de metales sin fuente de nitrgeno y carbono
Aire O2
Triturado, mezcla y filtrado S, P y huellas de metales Bacterias fijadoras de N2 Beijerinkia lactocogenes Bacterias fijadoras de
N2
CO2
CO2,
Thiobacillus ferroxidans
Compuestos nitrogenados Carbono orgnico
Proteus vulgaris y Staphylococcus aureus, fermentan lactosa. En cultivo puro Producen cido y no producen gas Si crecen juntas producen cido y gas
La misma relacin se da entre Staphylococcus aureus y Escherichia coli
Saccharomyces Las bacterias cereviciae produce anaerobias cido nicotnico productoras de necesario para el metano le crecimiento de proporcionan la Proteus vulgaris materia prima necesaria a las que oxidan metano Las bacterias hetertrofas producen iones amonio necesarios para Nitrosomonas
Influenza porcina slo se produce si estn presentes simultneamente: Tarpeia suis (virus) Haemophilus suis (bacteria)
Lquen: El hongo obtiene del alga productos metablicos como glucosa y alcoholes El alga se beneficia de la capacidad que tienen las paredes del hongo para retener agua
Comensalismo, +/0: Levaduras/bacterias Cuando el medio tiene alta concentracin de azcar las levaduras crecen pero no las bacterias Cuando los hongos han metabolizado parte del azcar, el medio queda acondicionado para que las bacterias se desarrollen Las levaduras tambin producen vitaminas favorables a las bacterias
Las asociaciones comensales permiten el desarrollo de especies anaerobias y facultativas en medios aerbicos
Staphylococcus aureus y Hemophilus influenzae fueron tomadas de un frotis de garganta
Colonias de Hemophilus cercanas a las de Staphylococcus eran ms grandes Staphylococcus produca NAD que aprovechaba Hemophilus
Las bacterias fotosintticas productoras de azufre: Oxidan el H2S permitiendo el desarrollo de especies sensibles a l.
Muchas bacterias producen la enzima penicilinasa inactiva la penicilina permitiendo el desarrollo de las bacterias sensibles
Parasitismo, +/-: Un organismo vive a expensas de otro. le roba a otro organismo los nutrientes El parsito se alimenta de las clulas o lquidos del husped El parsito depende del husped y vive en contacto fsico y metablico con l Eventualmente el husped muere
La bacteria Gram Bdelovibrio bacteriovorus Vive en el suelo y en las aguas de drenaje Es extraordinariamente mvil Se pega a la clula husped y la lisa
Hongos que parasitan hongos Hongos que parasitan algas Los virus son parsitos de hongos, algas y bacterias
Depredacin, +/-: Muerte e ingestin de microorganismos de una especie por los de otra especie
Los protozoos se alimentan de:

Hongos Algas Bacterias
Los hongos mucilaginosos de bacterias Didinium depreda a Paramecium
Interacciones de los microbios con plantas y animales: Interacciones Planta-Microbio Simbiosis Mutualista: Rhizobium: convierte el nitrgeno a una forma que puede ser utilizado por las plantas. Parasitismo: enfermedad Interacciones Animal-Microbio Simbiosis Mutualista: Microflora beneficica del tracto instestinal de las termitas Parasitismo: enfermedad
Importancia de la ecologa microbiana

Ecologa Global
Los microbios son el fundamento del sistema Tierra (Gaia), porque son responsables de la mayora de los ciclos de elementos Ciclos Geoqumicos Globales
Carbn Nitrgeno Hierro Azufre
Desde un punto de vista global, las bacterias juegan un rol muy importante : Son la base de los ciclos de reciclaje de nutrientes y elementos del ecosistema Las algas y cianobacterias contribuyen a la base energtica de los ciclos mediante la fotosntesis
Si los microorganismos fueron los responsables de la creacin de la atmsfera terretre
Qu papel desempean los microbios en la tendencia al calentamiento global?
Qu papel desempean los microbios en el El Nio?

Ecologa humana
Somos huspedes de billones de microbios que colonizan nuestro tracto intestinal, nuestra piel, pelo, dientes. El estudio de la microbiota humana puede aclarar relaciones muy complejas.
La colonizacin microbiana a veces nos causa problemas cuando resulta en enfermedad.
Aplicacin de ecologa humana: la epidemiologa
La epidemiologa, tambin se aplica a plantas cultivadas y animales domsticos

Exobiologa
La vida existe en otra parte del universo? Si hay vida en otra parte en el universo, probablemente es microbiana.
Noticia en 1996: evidencia de vida microbiana en el pasado de Marte. Contina la bsqueda para detectar vida ms all de nuestro propio planeta.
Mientras tanto, los microbios desempearn un papel dominante en la exploracin y colonizacin del espacio.
Reciclaje
Los microorganismos reciclan la mayora de los desechos orgnicos en recursos reutilizables.
Los seres humanos han aprovechado la potencia de los microbios para reciclar en varios sistemas: Tratamiento de desechos: Los microbios se utilizan
en el tratamiento de las aguas residuales para reciclar nutrientes, recuperacin del metano y el control de enfermedades.
Tratamiento de residuos animales: Los microbios

limpian los desechos producidos por los animales del domsticos
Compostaje: Prctica de moda para convertir las basuras de la cocina, las fincas, las plazas de mercado, los mataderos, etc., en un abono rico para el suelo. Aunque las lombrices han conseguido muy buena fama por su contribucin al la produccin de humus, los verdaderos obreros de la humificacin son los microbios. Compostaje municipal Miles de toneladas de hojas, recortes de hierba y basuras orgnicas son compostadas en grandes instalaciones municipales.
Bioremediacin
La degradacin ambiental es una de las peores amenazas a la que debe hacer frente la humanidad. Muchos problemas ambientales se pueden curar por los microbios.
Las bacterias ms estudiadas han sido las patgenas (particularmente para los humanos y animales domsticos). Sin embargo, muchas otras bacterias no patgenas son del mayor inters tecnolgico, por ejemplo aquellas que participan en:
Depuracin de aguas servidas o industriales Depuracin natural en ros, esteros o lagos Descomposicin de orgnicos en el suelo y en rellenos sanitarios (metanognesis)
Los microbios se utilizan para limpiar:

Bioremediacin de residuos txicos: Uso de microbios para la limpieza de residuos txicos.
Bioremediacin de Residuos industriales y domsticos: las algas para el tratamiento de aguas servidas en lagunas (o pozos), permiten mantener condiciones de oxgeno disuelto sobre el valor de saturacin en agua en la fraccin superior (menos profunda), donde penetra la luz solar.
Bioremediacin derramamientos de petrleo Bioremediation Pesticidas
Indicadores de calidad ambiental:
La calidad y la productividad de las aguas naturales estn relacionadas, en gran medida, con su poblacin microbiana El aire limpio, sin polvo, tiene relativamente pocos microorganismos
La seguridad de la calidad ambiental est ntimamente relacionada con la flora bacteriana presente.
Los microorganimos pueden utilizarse como indicadores de calidad ambiental Indicador de calidad microbiolgica de aguas es Escherichia coli, que se relaciona con contaminacin fecal
Microbiologa de la alimentacin
Fertilidad de los suelos
Microbiologa de la digestin Conservacin de alimentos y cosehas

Fertilidad de los suelos Dependemos de los cultivos para el sustento y estas cosechas dependen de suelos sanos con su vida microbiana equilibrada.
Mucha de la protena que comemos es el resultado de la fijacin bacteriana del nitrgeno del aire por microbios tales como Rhizobium.
Microbiologa de la digestin: Los microbios se utilizan como probiticos, un suplemento de la digestin que coloniza los intestinos, previniendo la colonizacin microbios causantes de enfermedad. No son alimento.
Conservacin de alimentos y cosehas
Una enorme cantidad de alimentos se pierde por: El mal manejo de alimentos procesados El mal trato y la conta minacin de los productos agrcolas y pecuarios durante la cosecha, el transporte el almacenamiento y la distribucin
Biotecnologa
Los microbios se utilizan como obreros en la produccin de muchos compuestos como: Combustible Minera Biocontrol Productos farmacuticos Biochips del ordenador Productos qumicos Ingeniera gentica Mara Cecilia Arango Jaramillo
Produccin del Combustible : produccin del etanol para ser usado como combustible para automviles
Explotacin minera Lixiviacin de metales de rocas ricas en hierro por los microbios. El 5% del mineral de cobre del mundo es producido biolixiviando El uranio se mina con la ayuda de bacterias
Biocontrol : uso de microbios para combatir parsitos y plagas. Uso del Bacilo thuriengensis, una bacteria que produce una toxina que mata 40 parsitos del plantas
Biochips para Ordenadores Los microorganismos se utilizarn en el futuro para producir los microprocesadores a base de protenas con ms interruptores que los microchips convencionales.
Ingeniera Gentica Algunos microorganismos se utilizan para llevar genes de unos organismos a otros Agrobacterium utilizada en la ingeniera gentica de plantas.
Ingeniera gentica:
Microorganismos genticamente modificados El dominio de estos procesos permitir Experimentos de campo reducir los riesgos con bacterianas que conlleva la modificadas genticamente liberacin de microorganismos Investigaciones sobre la transferencia de genes genticamente entre bacterias en su modificados al medio natural entorno. En los ltimos aos:
Hasta ahora, se ha demostrado que: Las bacterias modificadas genticamente suelen ser frgiles y mueren con relativa rapidez. No es probable, que sus genes gocen de muchas posibilidades para propasarse.
Productos farmacuticos
Productos qumicos
La bioingeniera de productos tiles tales como antibiticos, suplementos del alimento, y productos qumicos. Producidos industrialmente a gran escala por microorganismos seleccionados o modificados genticamente
Estudios bsicos en ciencias biolgicas

Como los microbios son simples, proporcionan un modelo para entender cmo ha evolucionado la vida. Fueron los primeros seres vivos en la tierra, hace 3700 millones de aos, mucho antes de que plantas y animales multicelulares, que se desarrollaron hace 600 millones de aos.
Los microbios se usan para estudiar la ecologa, porque: 1. Las bacterias son pequeas poblaciones grandes pueden ser estudiadas y reproducidas rpidamente 2. Tienen realciones complejas: Prooporcionan pistas de cmo funcionan los ecosistemas complejos
En los ltimos tiempos, la preocupacin por la calidad ambiental ha tenido como efecto un mayor inters por la ecologa microbiana
El estudio de la ecologa microbiana puede ayudarnos a mejorar nuestras vidas va el uso de microbios en: La restauracin ambiental La produccin del alimento

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La ecologa microbiana es compleja debido a la mltiples interacciones de los microorganismos.

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CARACTERSTICAS DE LOS ECOSISTEMAS MICROBIANOS

Caractersticas de los ecosistemas microbianos:

Capacidad de los microorganismos para transformar el ambiente

Producen importantes cambios en el ambiente

Mara Cecilia Arango Jaramillo

La capacidad adaptativa est entre los lmites del genotipo.

Las condiciones se hacen ms favorables para otra especie

La primera dejar su lugar a la mejor adaptada

Accin selectiva de los factores ambientales sobre las poblaciones de microorganismos

La adaptacin puede ser: Evolutiva Fenotpica o fisiolgica

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Mutacin espontnea o inducida

Hay oportunidades para un cambio en el genotipo como resultado de una mutacin.

Mara Cecilia Arango Jaramillo

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Transferencia gnica mediante transduccin.

Mara Cecilia Arango Jaramillo Robert V. Miller, Scientifican american,1998

Transferencia de plsmidos por conjugacin

Robert V. Miller, Scientifican amarican,1998

Robert V. Miller, Scientifican amarican,1998

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Transferencia de genes por transformacin

Tambin puede ocurrir en bacterias gramnegativas a travs de un mecanismo distinto.

Transformacin en una bacteria gram-positiva

Robert V. Miller, Scientifican amarican,1998 Mara Cecilia Arango Jaramillo http://193.146.205.151/web/articulos/articulos.htm

2. Adaptacin fisiolgica o fenotpica

Ocurren en todos los individuos de una poblacin expuestos al cambio

Interacciones genoma - ambiente

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Un cambio fsico o qumico:

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Tamao del hbitat

La localizacin y delimitacin de los hbitats microbianos no siempre son fciles de precisar

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Como la concentracin de nutrientes flucta, resultan alzas y bajas en el desarrollo

Mara Cecilia Arango Jaramillo

Diversidad de especies microbianas

contiene 1.000.000.000 microbios miles de especies.

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Asociaciones microbianas en ecosistemas

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Pseudomonas aeruginosa produce pigmentos que inhiben la germinacin de Aspergillus terreus

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Mutualismo, +/+: Cuando la relacin no es obligatoria se le llama cooperacin

Simbiosis en que ambos organismos resulta benefiados

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Intercambio de alimentos entre dos especies, sintrofismo:

Ambas bacterias crecen en simbiosis

Lactobacillus arabinosus Streptococcus fecalis

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