Reparacin del ADN

Daos en el ADN, mostrados como roturas en los cromosomas. La reparacin del ADN es un conjunto de procesos por los cuales una clula identifica y corrige daos hechos a las molculas de ADN que codifican el genoma. En las clulas humanas, tanto las actividades metablicas como los factores ambientales, como los rayos UV o la radiactividad, pueden causar daos al ADN, provocando hasta un milln de lesiones moleculares por clula por da.1 Muchas de estas lesiones causan daos estructurales a la molcula de ADN, y pueden alterar o eliminar la capacidad de la clula de transcribir el gen que codifica el ADN afectado. Otras lesiones producen mutaciones potencialmente nocivas en el genoma de la clula, lo que afecta la supervivencia de sus clulas hijas a la hora de la mitosis. Por consiguiente, el proceso de reparacin del ADN es constantemente activo, respondiendo a daos a la estructura del ADN.2 3 La velocidad de la reparacin del ADN depende de muchos factores, como el tipo de clula, su edad, y el ambiente extracelular. Una clula que haya acumulado una gran cantidad de daos en el ADN, o que no pueda reparar eficazmente los daos producidos en su ADN, puede entrar en uno de tres estados posibles: Un estado irreversible de inactividad, llamado senescencia. Suicidio celular, llamado apoptosis o muerte celular programada. Carcinognesis, o formacin de cncer. La capacidad de reparacin del ADN es vital para la integridad de su genoma, y por tanto, de su funcionamiento normal y el del organismo. En el caso de muchos de los genes que se haba demostrado que influan en la longevidad, ms tarde se ha revelado que tienen un papel en la reparacin y proteccin del ADN.4 La incapacidad de corregir lesiones moleculares en las clulas que forman gametos pueden introducir mutaciones en el genoma de sus descendientes, influyendo en el ritmo de la evolucin. Contenido [ocultar] 1 Dao del ADN 1.1 Causas de los daos 1.2 Tipos de dao 1.3 Daos al ADN nuclear y al ADN mitocondrial 1.4 Envejecimiento y apoptosis 1.5 Daos en el ADN y mutaciones

2 Mecanismos de reparacin del ADN 2.1 Inversin directa 2.2 Daos a una nica cadena 2.3 Daos a cadena doble 3 Fuentes 3.1 Referencias 3.2 Bibliografa 4 Enlaces externos [editar]Dao del ADN

Los daos al ADN, que se deben a factores ambientales y a los procesos metablicos habituales dentro de la clula, tienen lugar a un ritmo de entre mil y un milln de lesiones moleculares por clula por da.1 Aunque esto slo representa un 0.000165% de las aproximadamente seis mil millones de bases (tres mil millones de pares de bases) del genoma humano, las lesiones no reparadas en nada crticos (como los genes supresores de tumores) pueden impedir que una clula lleve a cabo su funcin y aumentar de manera significativa la posibilidad de que se forme un tumor. La inmensa mayora de los daos al ADN afectan a la estructura primaria de la doble hlice, es decir, la qumica de las bases mismas es modificada. Estas modificaciones pueden a su vez destruir la estructura normal helicoidal de las molculas, introduciendo enlaces qumicos no originales o aductos voluminosos que no caben en la hlice doble estndar. A diferencia de las protenas y el ARN, el ADN suele carecer de estructura terciaria, por lo que no suele haber daos o perturbaciones a este nivel. Sin embargo, el ADN tiene unas superhlices envueltas alrededor de protenas "empaquetadoras" llamadas histonas (en las eucariotas), y ambas estructuras son vulnerables a los efectos de los daos al ADN. [editar]Causas de los daos Los daos al ADN se pueden subdividir en dos tipos principales: Los daos endgenos, como ataques por parte de especies reactivas del oxgeno producidas a partir de subproductos metablicos normales (mutacin espontnea), especialmente en el proceso de desaminacin oxidativa; Los daos exgenos causados por agentes externos, tales como: Radiacin ultravioleta del sol [UV 200-300nm] u otras frecuencias de radiacin, incluyendo los rayos X y los rayos gamma.5

Radiacin ionizante.6 Hidrlisis o disrupcin trmica. Algunas toxinas vegetales. Mutgenos artificiales, especialmente compuestos aromticos que actan como agentes intercalantes del ADN. Quimioterapia y radioterapia como tratamiento contra el cncer. Virus que se integran en el genoma.7 La replicacin de ADN daado antes de que la clula se divida puede provocar la incorporacin de bases errneas ante las daadas. Las clulas hijas que heredan estas bases errneas llevan mutaciones en los que la secuencia de ADN original es irrecuperable (excepto en el raro caso de una reversin de la mutacin, o bien ms frecuentemente a travs de la recombinacin gentica a pesar de ser igualmente raro). [editar]Tipos de dao Hay cuatro tipos principales de daos al ADN debido a procesos celulares endgenos: Oxidacin de las bases (por ejemplo, 8-oxo-7 0.8-dihidroguanina (8-oxoG)) y generacin de interrupciones de la cadena de ADN por parte de especies reactivas del oxgeno. Alquilacin de bases (normalmente metilacin), como la formacin de 7-metilguanina, 1-metiladenina, O6-metilguanina Hidrlisis de bases, como desaminacin, depurinacin y depirimidinacin. Malfuncionamiento de bases, debido a errores en la replicacin del ADN, en que se inserta una base de ADN errnea en una cadena de ADN en formacin, se inserta una base que no es necesaria insertar, o no se inserta una de necesaria. Los daos causados por agentes exgenos son de muchos tipos.8 Algunos ejemplos son: La luz UV-B debido a entrecruzamientos con bases adyacentes de citosina y timina, crean dmeros de pirimidina. Esto recibe el nombre de dao directo al ADN. La luz UV-A provoca la formacin de radicales libres, especialmente si hay crema solar que ha penetrado en la piel. Esto recibe el nombre de dao indirecto al ADN. La radiacin ionizante, como la que causa la desintegracin radiactiva o la de los rayos csmicos, provoca roturas en las cadenas de ADN. La disrupcin trmica a temperaturas elevadas aumenta la velocidad de la despurinizacin (prdida de bases de purina del tronco del ADN) y las roturas de cadenas sencillas. Por ejemplo, se observa

despurinizacin hidroltica en los bacteria termfilas, que viven en aguas termales a 85 a 250 C.9 10 En estas especies, la velocidad de despurinizacin (300 residuos de purina por genoma por generacin) es demasiado alta como para que se repare mediante los mecanismos habituales de reparacin, de manera que no se puede descartar la posibilidad de una respuesta adaptativa. Productos qumicos industriales, como el cloruro de vinilo o el agua oxigenada, as como compuestos qumicos ambientales como los hidrocarburos policclicos que se encuentran en el humo, el holln y el alquitrn, provocan una gran diversidad de aductos-etenobases de ADN, bases oxidadas, fosfotristeros alquilados, y entrecruzamiento del ADN, por citar slo algunos efectos. Los daos por radiacin UV, la alquilacin/metilacin, los daos por rayos X y los daos oxidativos son ejemplos de daos inducidos. Los daos espontneos incluyen la prdida de una base, la desaminacin, plegamientos de los anillos de azcar, y los desplazamientos de tautmeros.11 [editar]Daos al ADN nuclear y al ADN mitocondrial En las clulas humanas, y las clulas eucariotas en general, el ADN se encuentra en dos puntos de la clula: en el ncleo y en las mitocondrias. El ADN nuclear (ADNn) existe en forma de cromatina durante las fases no replicadoras del ciclo celular, y es condensado en estructuras agregadas denominadas cromosomas durante la divisin celular. En ambos estados, el ADN es altamente compacto y se enrolla alrededor de protenas en forma de perla, llamadas histonas. Cuando una clula necesita expresar la informacin gentica codificada en su ADNn, se desenrrolla la regin cromosmica correspondiente, expresan sus genes, y luego la regin vuelve a ser condensada en su forma de reposo. El ADN mitocondrial (ADNmt) se encuentra dentro de las mitocondrias (un tipo de orgnulos), existe en mltiples copias, y est estrechamente asociado con una serie de protenas para formar un complejo llamado nucleoide. Dentro de las mitocondrias, las especies reactivas del oxgeno (ERE) y los radicales libres, subproductos de la produccin constante de adenosn trifosfato (ATP) mediante la fosforilacin oxidativa, crean un medio altamente oxidativo que se sabe que daa la ADNmt. Una enzima clave a la hora de compensar la toxicidad de estas especies es la superxido dismutasa, que est presente tanto en las mitocondrias como en el citoplasma de las clulas eucariotas. [editar]Envejecimiento y apoptosis El envejecimiento, un estado irreversible en el que la clula ya no se divide (mitosis), es una respuesta protectora en el acortamiento de los extremos de los cromosomas (telmeros). Los telmeros son largas regiones de ADN no codificantes repetitivas, que delimitan los cromosomas y que se degradan parcialmente cada vez que una clula se divide (lmite de Hayflick).12 En cambio, la quietud es un estado reversible de latencia que no tiene relacin con los daos en el genoma (ciclo celular). El envejecimiento de las clulas puede representar una alternativa funcional a la apoptosis en que la presencia fsica de una clula es necesaria para el organismo,13 que sirve como mecanismo de ltimo recurso para evitar que una clula con el ADN daado se replique anormalmente en la ausencia de comunicacin celular pro-crecimiento. La divisin celular incontrolada puede provocar la formacin de un tumor (cncer), que es potencialmente letal para el organismo. Por tanto, la induccin del envejecimiento y la apoptosis es considerada parte de la estrategia de proteccin contra el cncer.

[editar]Daos en el ADN y mutaciones Es importante distinguir entre los daos en el ADN y las mutaciones, los dos tipos principales de errores en el ADN.14 15 16 17 Los daos en el ADN y las mutaciones son fundamentalmente diferentes. Estos daos son en ltimo trmino anormalidades qumicas en la estructura del ADN, como roturas de cadena sencilla y cadena doble, residuos de 8-hidroxideoxiguanosina, y aductos de hidrocarburos aromticos policclicos. Determinadas protenas pueden reconocer estas alteraciones en el ADN, de manera que los pueden reparar si hay disponible informacin redundante para ser copiada, a partir de la secuencia intacta de la cadena de ADN complementaria que no ha sufrido esta alteracin. Si una clula no repara daos en su ADN, puede quedar parada la expresin de un gen.18 En contraste a los daos en el ADN, una mutacin es un cambio en la secuencia de bases del ADN, es decir que no se produce ningn cambio que pueda ser reconocido por las protenas encargadas de la correccin de estas alteraciones, ya que su composicin qumica y estructural es normal. Las mutaciones provenientes de los errores de sntesis no pueden ser reconocida por las enzimas una vez que el cambio de bases est presente en ambas cadenas del ADN, de manera que las mutaciones resultan indetectables en la correccin y no son reparadas. Las mutaciones son replicadas durante la divisin celular.19 A nivel celular, las mutaciones pueden provocar cambios en el metabolismo y la proliferacin de estas clulas.20 En el conjunto de clulas de un organismo, el nmero de clulas mutantes aumentar o disminuir segn los efectos de la mutacin en la capacidad de la clula para sobrevivir y reproducirse. Aunque son claramente diferentes los unos de los otros, los daos en el ADN y las mutaciones estn relacionados, pues los daos en el ADN provocan a menudo errores de sntesis del ADN durante la replicacin o la reparacin, y estos errores son una causa importante de mutaciones. Teniendo en cuenta las propiedades de los daos en el ADN y las mutaciones, se puede ver que los daos en el ADN son un problema especial en clulas que no se dividen o que lo hacen lentamente, pues los daos no reparados tienden a acumularse con el tiempo. Por otra parte, en las clulas que se dividen rpidamente, los daos en el ADN no reparados que no matan la clula evitando su replicacin suelen provocar errores durante la replicacin y, por tanto, mutaciones.21 La gran mayora de mutaciones que no tienen un efecto neutro son deletreas para la supervivencia de una clula. As pues, en una poblacin de clulas de un tejido con clulas que se replican, las clulas mutantes tienden a desaparecer. Sin embargo, las pocas mutaciones que ofrecen una ventaja para la proliferacin celular tienden a extenderse de manera clnica a expensas de las clulas vecinas. Esta ventaja para la clula es una desventaja para el organismo en general, pues estas clulas mutantes proliferan libremente escapando al control del ciclo celular, son las clulas cancerosas. Aquellos tipos celulares que se dividen ms frecuentemente tienden a acumular ms fcilmente las mutaciones, ya que una vez ocurridas las mutaciones tardan estas clulas poco tiempo en replicar el ADN y por tanto la mutacin incorporar poco tiempo con la copia inicial de la cadena complementaria. As pues una vez dividida una de las dos clulas resultantes de la divisin habr fijado la variante mutante, siendo ms difcil que ocurra la correccin. As pues, los daos en el ADN en clulas que se dividen frecuentemente

son una causa importante de cncer,22 pues dan pie a mutaciones. En cambio, los daos en el ADN en clulas que se dividen poco son probablemente una causa importante del envejecimiento.23 [editar]Mecanismos de reparacin del ADN

Las clulas no pueden funcionar si los daos en el ADN corrompen la integridad y accesibilidad de informacin esencial en el genoma (pero las clulas permanecen aparentemente funcionales cuando faltan o estn daados genes "no esenciales"). Segn el tipo de daos que ha sufrido la estructura de doble hlice del ADN, han evolucionado una variedad de estrategias de reparacin que restauran la informacin perdida. Si es posible, las clulas utilizan la cadena de ADN complementaria (si no ha sido modificada) o la cromtida hermana como "plantilla" para restaurar la informacin original. Si no hay ninguna plantilla disponible, las clulas utilizan como ltimo recurso un sistema de recuperacin propenso a los errores conocido como sntesis de translesin. Los daos al ADN alteran la configuracin espacial de la hlice, su topologa, y la clula es capaz de detectar estas alteraciones. Una vez que se detectan los daos, unas molculas especficas reparadoras del ADN se adhieren al punto daado o cerca de l, induciendo a otras molculas a adherirse y formar un complejo que permite que tenga lugar la reparacin. Los tipos de molculas implicados y el mecanismo de reparacin que se utiliza depende del tipo de daos que haya sufrido el ADN y de la fase del ciclo celular en que se encuentre la clula. [editar]Inversin directa Se sabe que las clulas eliminan tres tipos de daos en el ADN invirtindolos qumicamente. Estos mecanismos no requieren una plantilla, ya que los tipos de daos que reparan slo pueden tener lugar en una de las cuatro bases. Estos mecanismos de inversin directa son especficos a cada tipo de dao y no implican la fragmentacin del ncleo de fosfodistero. La formacin de dmeros de timina (un tipo comn de dmero de ciclobutilo) despus de irradiacin con luz ultravioleta resulta en un enlace covalente anormal entre bases de timidina adyacentes. El proceso de fotorreactivacin invierte directamente este dao mediante la accin de la enzima fotoliasa, la activacin depende necesariamente de la energa absorbida de la luz azul/UVA (longitud de onda de 300-500Nm) para promover la catlisis.24 Otro tipo de daos, como la metilacin de bases de guanina, es directamente revertido por la protena metilguanina metil transferasa (MGMT), el equivalente bacteriano de la que recibe el nombre de OGT. Se trata de un proceso exigente en recursos, pues cada molcula de MGMT slo se puede utilizar una vez, es decir, la reaccin es estequiomtrica y no cataltica.25 En bacterias hay una respuesta generalizada a los agentes metilantes, conocida como respuesta adaptativa, y que confiere una cierta resistencia a los agentes alquilantes tras una exposicin prolongada a travs de la sobrerregulacin de las enzimas de reparacin de la alquilacin.26 El tercer tipo de daos al ADN invertido por las clulas es una cierta metilacin de las bases citosina y adenina. [editar]Daos a una nica cadena

Cuando slo una de las dos cadenas de la doble hlice tiene un defecto, la otra puede ser utilizada como plantilla para dirigir la correccin de la cadena daada. Para reparar daos a una de las molculas pareadas de ADN, existen varios mecanismos de reparacin de escisiones, que eliminan el nucletido daado y lo sustituyen con un nucletido intacto complementario al que se encuentra en la cadena de ADN no daada.25 Reparacin por escisin de base (BER), que repara daos a un nico nucletido causados por oxidacin, alquilacin, hidrlisis o desaminacin. Una glicosidasa escinde la base nitrogenada del nucletido daado, generando un sitio apurnico o apirimidnico. El esqueleto pentosa-fosfato residual es eliminado por una AP endonucleasa y finalmente es sustituido por el nucletido adecuado por la actividad secuencial de ADN polimerasa y ADN ligasa. Reparacin por escisin de nucletido (NER), que repara daos que afecten cadenas ms largas, de entre dos y treinta bases. Este proceso reconoce cambios grandes que distorsionan la hlice, como dmeros de timina, as como roturas de cadena nica (reparados con enzimas como la UvrABC endonucleasa. Una forma especializada de NER, conocida como reparacin acoplada a transcripcin (TCR) desarrolla enzimas de alta prioridad en genes que se estn transcribiendo activamente. Reparacin de malapareamiento (MMR), que corrige errores en la replicacin y recombinacin del ADN que resultan en nucletidos mal apareados (pero normales, es decir, no daados) despus de la replicacin del ADN. [editar]Daos a cadena doble Las roturas de cadena doble, en el que ambas cadenas de la doble hlice quedan rotas, son especialmente peligrosos para la clula, ya que pueden provocar problemas en el genoma. Existen dos mecanismos que reparan estas roturas: la unin de extremos no homlogos (NHEJ del ingls Nonhomologous DNA End Joining) y la reparacin recombinativa (tambin conocida como reparacin asistida por plantilla o reparacin de recombinacin homloga).25 En el NHEJ el ADN ligasa IV, un ADN ligasa especializada que forma un complejo con el cofactor XRCC4, une directamente los dos extremos.27 Para asegurarse de una reparacin precisa, el NHEJ se basa en cortas secuencias homlogas llamadas microhomologas, presentes en las colas monocatenarias de los extremos de ADN que deben ser unidos. Si estas secuencias son compatibles, la reparacin suele ser correcta.28 29 30 31 El NHEJ tambin puede causar mutaciones durante la reparacin. La prdida de bases nitrogenadas en el lugar de rotura puede provocar deleciones y la unin de translocaciones de forma terminal no correspondientes. El NHEJ es especialmente importante antes de que la clula haya replicado su ADN, pues no hay ninguna plantilla que permita la reparacin por recombinacin homloga. Hay rutas de NHEJ de seguridad en las eucariotas superiores.32 Adems de su papel como cuidador del genoma, el NHEJ es necesario para unir roturas de la cadena doble con extremos de horquilla, causados durante la recombinacin V (D) J, el proceso que genera la diversidad de los receptores de los linfocitos B y los linfocitos T en el sistema inmunitario de los vertebrados.33

La reparacin recombinante requiere la presencia de una secuencia idntica o casi idntica que sea utilizada como plantilla para reparar la rotura. La maquinaria enzimtica responsable de este proceso es casi idntica a la maquinaria responsable del cruce cromosmico durante la meiosis. Esta ruta permite que un cromosoma daado sea reparado utilizando una cromtida hermana (disponible en G2 despus de la replicacin del ADN) o un cromosoma homlogo como plantilla. Las roturas de cadena doble causados por los intentos de la maquinaria replicante de sintetizar a travs de una rotura de cadena nica o una lesin no reparada provocan un colapso de la horquilla de replicacin y son generalmente reparados por recombinacin. Las topoisomerasas provocan roturas tanto de una nica cadena como de la cadena doble cuando cambian el estado de superenrollamiento del ADN, lo que es especialmente habitual en regiones situadas cerca de una horquilla de replicacin abierta. Estos roturas no son consideradas como daos en el ADN, ya que son un intermedio natural del mecanismo bioqumico de las topoisomerasas y son inmediatamente reparados por las enzimas que los han creado. Un grupo de cientficos franceses bombardearon Deinococcus radiodurans para estudiar el mecanismo de reparacin de roturas de la cadena doble de ADN en este organismo. Al menos dos copias del genoma, con roturas aleatorias del ADN, pueden formar fragmentos de ADN por medio de apareamiento. Entonces, los fragmentos que se solapan parcialmente son utilizados para sintetizar las regiones homlogas mediante un bucle-D en movimiento que puede continuar la extensin hasta que encuentran cadenas correspondientes complementarias. En el ltimo paso se produce un cruce por medio de una recombinacin homloga de recargo dependiente.34 [editar]